RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492895.1

ANKRD28-211, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-211ENST00000492895 SFI1A8K8P3 1242 aa6.04□□□□□ -1.44
ANKRD28-211ENST00000492895 M0R2N6 131 aa6.04□□□□□ -1.44
ANKRD28-211ENST00000492895 GPR25O00155 361 aa6.04□□□□□ -1.44
ANKRD28-211ENST00000492895 EPHA4P54764 986 aa6.04□□□□□ -1.44
ANKRD28-211ENST00000492895 FOXK2Q01167 660 aa6.04□□□□□ -1.44
ANKRD28-211ENST00000492895 C1orf216Q8TAB5 229 aa6.04□□□□□ -1.44
ANKRD28-211ENST00000492895 RUBCNLQ9H714 662 aa6.04□□□□□ -1.44
ANKRD28-211ENST00000492895 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
ANKRD28-211ENST00000492895 THBS1P07996 1170 aa6.03□□□□□ -1.44
ANKRD28-211ENST00000492895 SEC13P55735 322 aa6.03□□□□□ -1.44
ANKRD28-211ENST00000492895 PTK7Q13308 1070 aa6.03□□□□□ -1.44
ANKRD28-211ENST00000492895 GAS6Q14393 721 aa6.03□□□□□ -1.44
ANKRD28-211ENST00000492895 LBRQ14739 615 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
ANKRD28-211ENST00000492895 TEAD4Q15561 434 aa6.03□□□□□ -1.44
ANKRD28-211ENST00000492895 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
ANKRD28-211ENST00000492895 TBCELQ5QJ74 424 aa6.03□□□□□ -1.44
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC9A9Q8IVB4 645 aa6.03□□□□□ -1.44
ANKRD28-211ENST00000492895 TRERF1Q96PN7 1200 aa6.03□□□□□ -1.44
ANKRD28-211ENST00000492895 STK17AQ9UEE5 414 aa6.03□□□□□ -1.44
ANKRD28-211ENST00000492895 PARP3Q9Y6F1 533 aa6.03□□□□□ -1.44
ANKRD28-211ENST00000492895 RFX1P22670 979 aa6.02□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 NBPF1Q3BBV0 1214 aa6.02□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 EFHC2Q5JST6 749 aa6.02□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa6.02□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 FAM196BA6NMK8 535 aa6.01□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 USP17L15C9J2P7 530 aa6.01□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 USP17L10C9JJH3 530 aa6.01□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 USP17L13C9JLJ4 530 aa6.01□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 USP17L12C9JPN9 530 aa6.01□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 USP17L11C9JVI0 530 aa6.01□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 USP17L21D6R901 530 aa6.01□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 USP17L18D6R9N7 530 aa6.01□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 USP17L22D6RA61 530 aa6.01□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 USP17L17D6RBQ6 530 aa6.01□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 USP17L19D6RCP7 530 aa6.01□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 USP17L20D6RJB6 530 aa6.01□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 SLURP2P0DP57 97 aa6.01□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 TATP17735 454 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 ATP4AP20648 1035 aa6.01□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 NOS2P35228 1153 aa6.01□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 USP17L24Q0WX57 530 aa6.01□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 DPYDQ12882 1025 aa6.01□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 CDCA8Q53HL2 280 aa6.01□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa6.01□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 L3MBTL2Q969R5 705 aa6.01□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 CFHR5Q9BXR6 569 aa6.01□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 CRISPLD1Q9H336 500 aa6.01□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa6.01□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 SERTM1A2A2V5 107 aa6□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 FAM181BA6NEQ2 426 aa6□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 ARID3CA6NKF2 412 aa6□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 ANKMY2Q8IV38 441 aa6□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 MBIPQ9NS73 344 aa6□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF232Q9UNY5 417 aa6□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 A0A1W2PNR3 127 aa5.99□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 ADAMTS2O95450 1211 aa5.99□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 TXLNAP40222 546 aa5.99□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 NLRP8Q86W28 1048 aa5.99□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 ZIC5Q96T25 663 aa5.99□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 HINFPQ9BQA5 517 aa5.99□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 PHF24Q9UPV7 400 aa5.99□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 ATAD2Q6PL18 1390 aa5.98□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 EML1O00423 815 aa5.98□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 C21orf2O43822 256 aa5.98□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 MX2P20592 715 aa5.98□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 FIGNL1Q6PIW4 674 aa5.98□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 BICDL1Q6ZP65 573 aa5.98□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 ARXQ96QS3 562 aa5.98□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 SERPINA10Q9UK55 444 aa5.98□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 CHMP3Q9Y3E7 222 aa5.98□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 IGF1RP08069 1367 aa5.97□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 BNIP3LO60238 219 aa5.97□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa5.97□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 GAS2L2Q8NHY3 880 aa5.97□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 FAM200AQ8TCP9 573 aa5.97□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 WHAMMQ8TF30 809 aa5.97□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 C7orf43Q8WVR3 580 aa5.97□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 NDFIP2Q9NV92 336 aa5.97□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa5.97□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa5.97□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 GJA3Q9Y6H8 435 aa5.97□□□□□ -1.45
ANKRD28-211ENST00000492895 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
ANKRD28-211ENST00000492895 LGR5O75473 907 aa5.96□□□□□ -1.46
ANKRD28-211ENST00000492895 C1orf53Q5VUE5 145 aa5.96□□□□□ -1.46
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
ANKRD28-211ENST00000492895 POTEAQ6S8J7 498 aa5.96□□□□□ -1.46
ANKRD28-211ENST00000492895 STAG2Q8N3U4 1231 aa5.96□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms