RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491952.1

TTC3-222, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 5

Gene TTC3, Length 247 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-222	ENST00000491952	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TTC3-222	ENST00000491952	SIRT1	Q96EB6	747 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TTC3-222	ENST00000491952	ITGB7	P26010	798 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TTC3-222	ENST00000491952	PLA2G4A	P47712	749 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TTC3-222	ENST00000491952	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TTC3-222	ENST00000491952	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TTC3-222	ENST00000491952	CD163	Q86VB7	1156 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TTC3-222	ENST00000491952	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TTC3-222	ENST00000491952	USP3	Q9Y6I4	520 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TTC3-222	ENST00000491952	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		7.52	□□□□□ -1.21
TTC3-222	ENST00000491952	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
TTC3-222	ENST00000491952	RRAGC	Q9HB90	399 aa		7.52	□□□□□ -1.21
TTC3-222	ENST00000491952	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		7.52	□□□□□ -1.21
TTC3-222	ENST00000491952		A0A1W2PNR3	127 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TTC3-222	ENST00000491952	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TTC3-222	ENST00000491952	CDK2AP1	O14519	115 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TTC3-222	ENST00000491952	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
TTC3-222	ENST00000491952	EFS	O43281	561 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TTC3-222	ENST00000491952	FAM157B	P0CG42	384 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TTC3-222	ENST00000491952	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
TTC3-222	ENST00000491952	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TTC3-222	ENST00000491952	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TTC3-222	ENST00000491952	ZIC5	Q96T25	663 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TTC3-222	ENST00000491952	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TTC3-222	ENST00000491952	PIK3R2	O00459	728 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TTC3-222	ENST00000491952	FURIN	P09958	794 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TTC3-222	ENST00000491952	CHRNA4	P43681	627 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TTC3-222	ENST00000491952	VAC14	Q08AM6	782 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TTC3-222	ENST00000491952	GRIN2C	Q14957	1233 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TTC3-222	ENST00000491952	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TTC3-222	ENST00000491952	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TTC3-222	ENST00000491952	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TTC3-222	ENST00000491952	ADH6	P28332	368 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TTC3-222	ENST00000491952	CHSY3	Q70JA7	882 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TTC3-222	ENST00000491952		A6NJY4	79 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TTC3-222	ENST00000491952	AMPD1	P23109	780 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
TTC3-222	ENST00000491952		Q8N3U1	123 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TTC3-222	ENST00000491952	TRIM11	Q96F44	468 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TTC3-222	ENST00000491952	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TTC3-222	ENST00000491952	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
TTC3-222	ENST00000491952	CD33	P20138	364 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TTC3-222	ENST00000491952	SOX11	P35716	441 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TTC3-222	ENST00000491952	WASHC4	Q2M389	1173 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TTC3-222	ENST00000491952	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TTC3-222	ENST00000491952	STRN4	Q9NRL3	753 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TTC3-222	ENST00000491952	EPHA4	P54764	986 aa		7.46	□□□□□ -1.22
TTC3-222	ENST00000491952	LAMC2	Q13753	1193 aa		7.46	□□□□□ -1.22
TTC3-222	ENST00000491952	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		7.45	□□□□□ -1.22
TTC3-222	ENST00000491952	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
TTC3-222	ENST00000491952	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		7.45	□□□□□ -1.22
TTC3-222	ENST00000491952	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		7.45	□□□□□ -1.22
TTC3-222	ENST00000491952	AIDA	Q96BJ3	306 aa		7.45	□□□□□ -1.22
TTC3-222	ENST00000491952	PIK3CD	O00329	1044 aa		7.44	□□□□□ -1.22
TTC3-222	ENST00000491952	EML1	O00423	815 aa		7.44	□□□□□ -1.22
TTC3-222	ENST00000491952	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
TTC3-222	ENST00000491952	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
TTC3-222	ENST00000491952	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		7.44	□□□□□ -1.22
TTC3-222	ENST00000491952	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
TTC3-222	ENST00000491952	TEAD4	Q15561	434 aa		7.43	□□□□□ -1.22
TTC3-222	ENST00000491952	POTEA	Q6S8J7	498 aa		7.43	□□□□□ -1.22
TTC3-222	ENST00000491952	ALG2	Q9H553	416 aa		7.43	□□□□□ -1.22
TTC3-222	ENST00000491952	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
TTC3-222	ENST00000491952	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
TTC3-222	ENST00000491952	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		7.42	□□□□□ -1.22
TTC3-222	ENST00000491952	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
TTC3-222	ENST00000491952	TXLNA	P40222	546 aa		7.42	□□□□□ -1.22
TTC3-222	ENST00000491952	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		7.42	□□□□□ -1.22
TTC3-222	ENST00000491952	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
TTC3-222	ENST00000491952	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		7.42	□□□□□ -1.22
TTC3-222	ENST00000491952	ELOA3	Q8NG57	546 aa		7.42	□□□□□ -1.22
TTC3-222	ENST00000491952	ABL2	P42684	1182 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TTC3-222	ENST00000491952	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
TTC3-222	ENST00000491952	SEMA3F	Q13275	785 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TTC3-222	ENST00000491952	MCM6	Q14566	821 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TTC3-222	ENST00000491952	PLVAP	Q9BX97	442 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TTC3-222	ENST00000491952	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TTC3-222	ENST00000491952	CABP1	Q9NZU7	370 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TTC3-222	ENST00000491952	MARK1	Q9P0L2	795 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TTC3-222	ENST00000491952	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
TTC3-222	ENST00000491952	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF358	Q9NW07	568 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TTC3-222	ENST00000491952	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TTC3-222	ENST00000491952	BACH1	O14867	736 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TTC3-222	ENST00000491952	SIN3B	O75182	1162 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TTC3-222	ENST00000491952	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TTC3-222	ENST00000491952	NOS2	P35228	1153 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TTC3-222	ENST00000491952	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
TTC3-222	ENST00000491952	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	7.38	□□□□□ -1.23
TTC3-222	ENST00000491952	TNFRSF25	Q93038	417 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TTC3-222	ENST00000491952	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TTC3-222	ENST00000491952	COG6	Q9Y2V7	657 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TTC3-222	ENST00000491952	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TTC3-222	ENST00000491952	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
TTC3-222	ENST00000491952	SLC24A1	O60721	1099 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TTC3-222	ENST00000491952	GTF2I	P78347	998 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TTC3-222	ENST00000491952	DOC2B	Q14184	412 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TTC3-222	ENST00000491952	EML3	Q32P44	896 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TTC3-222	ENST00000491952	SYT9	Q86SS6	491 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TTC3-222	ENST00000491952	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		7.37	□□□□□ -1.23

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