RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485499.1

PTPRT-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, human

TSL 3

Gene PTPRT, Length 208 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRT-208	ENST00000485499	NRAP	Q86VF7	1730 aa		9.45	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	9.45	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		9.45	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		9.45	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	GUCA2A	Q02747	115 aa		9.45	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	MSS51	Q4VC12	460 aa		9.45	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		9.45	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		9.45	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	GOPC	Q9HD26	462 aa		9.45	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	ADGRB2	O60241	1585 aa		9.45	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	KIF1B	O60333	1816 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	RETREG3	Q86VR2	466 aa		9.43	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		9.43	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	AVP	P01185	164 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	MTMR2	Q13614	643 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	PXDN	Q92626	1479 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	ABCC5	O15440	1437 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	C6orf229	H3BNL8	230 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	9.41	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	9.41	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	IL27	Q8NEV9	243 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	DACH1	Q9UI36	760 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	SLIT2	O94813	1529 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	DAPK1	P53355	1430 aa		9.4	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	IFT172	Q9UG01	1749 aa		9.4	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	9.4	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	KIF1A	Q12756	1690 aa		9.4	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	9.4	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	S1PR4	O95977	384 aa		9.4	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	BAG6	P46379	1132 aa		9.4	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	9.4	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	9.4	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		9.4	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		9.4	□□□□□ -0.9
PTPRT-208	ENST00000485499	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PTPRT-208	ENST00000485499	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PTPRT-208	ENST00000485499	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	9.38	□□□□□ -0.91
PTPRT-208	ENST00000485499	MMP16	P51512	607 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PTPRT-208	ENST00000485499	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	9.38	□□□□□ -0.91
PTPRT-208	ENST00000485499	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PTPRT-208	ENST00000485499	MYOM1	P52179	1685 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PTPRT-208	ENST00000485499	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PTPRT-208	ENST00000485499	LILRB3	O75022	631 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PTPRT-208	ENST00000485499	LCE2C	Q5TA81	110 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PTPRT-208	ENST00000485499	DESI1	Q6ICB0	168 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PTPRT-208	ENST00000485499	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PTPRT-208	ENST00000485499	UTRN	P46939	3433 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PTPRT-208	ENST00000485499	MET	P08581	1390 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PTPRT-208	ENST00000485499	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTPRT-208	ENST00000485499	ADGRL2	O95490	1459 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTPRT-208	ENST00000485499	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
PTPRT-208	ENST00000485499	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
PTPRT-208	ENST00000485499	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTPRT-208	ENST00000485499	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTPRT-208	ENST00000485499	ORAI2	Q96SN7	254 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTPRT-208	ENST00000485499	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	9.36	□□□□□ -0.91
PTPRT-208	ENST00000485499	CEP350	Q5VT06	3117 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTPRT-208	ENST00000485499	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTPRT-208	ENST00000485499	CASZ1	Q86V15	1759 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PTPRT-208	ENST00000485499	JUND	P17535	347 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PTPRT-208	ENST00000485499	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PTPRT-208	ENST00000485499	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PTPRT-208	ENST00000485499	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PTPRT-208	ENST00000485499	PRR7	Q8TB68	274 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PTPRT-208	ENST00000485499	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
PTPRT-208	ENST00000485499	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PTPRT-208	ENST00000485499	DISP2	A7MBM2	1401 aa		9.34	□□□□□ -0.91
PTPRT-208	ENST00000485499	AXIN1	O15169	862 aa		9.34	□□□□□ -0.91
PTPRT-208	ENST00000485499	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		9.34	□□□□□ -0.91
PTPRT-208	ENST00000485499	PPL	O60437	1756 aa		9.34	□□□□□ -0.91
PTPRT-208	ENST00000485499	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	9.33	□□□□□ -0.92
PTPRT-208	ENST00000485499	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	9.33	□□□□□ -0.92
PTPRT-208	ENST00000485499	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		9.33	□□□□□ -0.92
PTPRT-208	ENST00000485499	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	9.33	□□□□□ -0.92
PTPRT-208	ENST00000485499	QPCT	Q16769	361 aa		9.33	□□□□□ -0.92
PTPRT-208	ENST00000485499	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		9.33	□□□□□ -0.92
PTPRT-208	ENST00000485499	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		9.33	□□□□□ -0.92
PTPRT-208	ENST00000485499	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		9.33	□□□□□ -0.92
PTPRT-208	ENST00000485499	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	9.33	□□□□□ -0.92
PTPRT-208	ENST00000485499	CLTCL1	P53675	1640 aa		9.33	□□□□□ -0.92
PTPRT-208	ENST00000485499	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		9.33	□□□□□ -0.92
PTPRT-208	ENST00000485499	SBF2	Q86WG5	1849 aa		9.33	□□□□□ -0.92
PTPRT-208	ENST00000485499	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		9.32	□□□□□ -0.92
PTPRT-208	ENST00000485499	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	9.32	□□□□□ -0.92
PTPRT-208	ENST00000485499	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		9.32	□□□□□ -0.92
PTPRT-208	ENST00000485499	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	9.32	□□□□□ -0.92
PTPRT-208	ENST00000485499	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	9.32	□□□□□ -0.92
PTPRT-208	ENST00000485499	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		9.32	□□□□□ -0.92

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