RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 SVOPQ8N4V2 548 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 MBIPQ9NS73 344 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 GJA3Q9Y6H8 435 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 ADAMTS2O95450 1211 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 MX2P20592 715 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 ATP4AP20648 1035 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 EPHA4P54764 986 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 L3MBTL2Q969R5 705 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 CRISPLD1Q9H336 500 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 SERTM1A2A2V5 107 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 USP17L15C9J2P7 530 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 USP17L10C9JJH3 530 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 USP17L13C9JLJ4 530 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 USP17L12C9JPN9 530 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 USP17L11C9JVI0 530 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 USP17L21D6R901 530 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 USP17L18D6R9N7 530 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 USP17L22D6RA61 530 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 USP17L17D6RBQ6 530 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 USP17L19D6RCP7 530 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 USP17L20D6RJB6 530 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 M0R2N6 131 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 FOXK2Q01167 660 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 USP17L24Q0WX57 530 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 CFAP70Q5T0N1 1121 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 FIGNL1Q6PIW4 674 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 HINFPQ9BQA5 517 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 A0A1W2PNR3 127 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 THBS1P07996 1170 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 SLURP2P0DP57 97 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 NOS2P35228 1153 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 DPYDQ12882 1025 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 PTK7Q13308 1070 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 TEAD4Q15561 434 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 CFHR5Q9BXR6 569 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 IGF1RP08069 1367 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM196BA6NMK8 535 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 MAP3K10Q02779 954 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 CDCA8Q53HL2 280 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 ABHD17AQ96GS6 310 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 NEUROD4Q9HD90 331 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-210ENST00000485459 TXLNAP40222 546 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-210ENST00000485459 C14orf37Q86TY3 774 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-210ENST00000485459 NLRP8Q86W28 1048 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-210ENST00000485459 ANKMY2Q8IV38 441 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-210ENST00000485459 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-210ENST00000485459 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-210ENST00000485459 DKK1O94907 266 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-210ENST00000485459 WHAMMQ8TF30 809 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-210ENST00000485459 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-210ENST00000485459 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-210ENST00000485459 DCDC2BA2VCK2 349 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-210ENST00000485459 ARID3CA6NKF2 412 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-210ENST00000485459 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-210ENST00000485459 BNIP3LO60238 219 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-210ENST00000485459 LGR5O75473 907 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-210ENST00000485459 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-210ENST00000485459 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-210ENST00000485459 ZIC5Q96T25 663 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-210ENST00000485459 EML1O00423 815 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-210ENST00000485459 BMP4P12644 408 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-210ENST00000485459 FGFR3P22607 806 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-210ENST00000485459 MAP2K3P46734 347 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-210ENST00000485459 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM200AQ8TCP9 573 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-210ENST00000485459 RHPN1Q8TCX5 695 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-210ENST00000485459 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-210ENST00000485459 ATAD2Q6PL18 1390 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-210ENST00000485459 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-210ENST00000485459 LYPD4Q6UWN0 246 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-210ENST00000485459 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-210ENST00000485459 ENAMQ9NRM1 1142 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-210ENST00000485459 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-210ENST00000485459 NGLY1Q96IV0 654 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-210ENST00000485459 PHACTR1Q9C0D0 580 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-210ENST00000485459 SERPINA10Q9UK55 444 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-210ENST00000485459 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-210ENST00000485459 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-210ENST00000485459 C21orf2O43822 256 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-210ENST00000485459 GAS2L2Q8NHY3 880 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-210ENST00000485459 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-210ENST00000485459 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-210ENST00000485459 MAPTP10636 758 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-210ENST00000485459 BCRP11274 1271 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-210ENST00000485459 CD33P20138 364 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-210ENST00000485459 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms