RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 BABAM1Q9NWV8 329 aa17.56■□□□□ 0.4
PRAME-211ENST00000476336 TMPOP42166 694 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
PRAME-211ENST00000476336 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
PRAME-211ENST00000476336 ADAMTS8Q9UP79 889 aa17.55■□□□□ 0.4
PRAME-211ENST00000476336 GRIN3BO60391 1043 aa17.54■□□□□ 0.4
PRAME-211ENST00000476336 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
PRAME-211ENST00000476336 DCTN1Q14203 1278 aa17.54■□□□□ 0.4
PRAME-211ENST00000476336 MSL1Q68DK7 614 aa17.54■□□□□ 0.4
PRAME-211ENST00000476336 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
PRAME-211ENST00000476336 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
PRAME-211ENST00000476336 CD2APQ9Y5K6 639 aa17.54■□□□□ 0.4
PRAME-211ENST00000476336 C4AP0C0L4 1744 aa17.53■□□□□ 0.4
PRAME-211ENST00000476336 A0A087WZG4 1122 aa17.53■□□□□ 0.4
PRAME-211ENST00000476336 AMIGO3Q86WK7 504 aa17.53■□□□□ 0.4
PRAME-211ENST00000476336 ZPR1O75312 459 aa17.52■□□□□ 0.4
PRAME-211ENST00000476336 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
PRAME-211ENST00000476336 KDM3BQ7LBC6 1761 aa17.51■□□□□ 0.39
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PRAME-211ENST00000476336 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP17.5■□□□□ 0.39
PRAME-211ENST00000476336 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
PRAME-211ENST00000476336 COL15A1P39059 1388 aa17.5■□□□□ 0.39
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PRAME-211ENST00000476336 CCDC146Q8IYE0 955 aa17.49■□□□□ 0.39
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PRAME-211ENST00000476336 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa17.49■□□□□ 0.39
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PRAME-211ENST00000476336 SMIM5Q71RC9 77 aa17.48■□□□□ 0.39
PRAME-211ENST00000476336 KCNQ3O43525 872 aa17.47■□□□□ 0.39
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PRAME-211ENST00000476336 C1QTNF8P60827 252 aa17.47■□□□□ 0.39
PRAME-211ENST00000476336 MRS2Q9HD23 443 aa17.47■□□□□ 0.39
PRAME-211ENST00000476336 PARP3Q9Y6F1 533 aa17.47■□□□□ 0.39
PRAME-211ENST00000476336 LAMB4A4D0S4 1761 aa17.47■□□□□ 0.39
PRAME-211ENST00000476336 NEUROD2Q15784 382 aa17.46■□□□□ 0.39
PRAME-211ENST00000476336 TSPYL4Q9UJ04 414 aa17.46■□□□□ 0.39
PRAME-211ENST00000476336 RGL2O15211 777 aa17.45■□□□□ 0.38
PRAME-211ENST00000476336 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
PRAME-211ENST00000476336 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
PRAME-211ENST00000476336 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
PRAME-211ENST00000476336 USP16Q9Y5T5 823 aa17.45■□□□□ 0.38
PRAME-211ENST00000476336 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
PRAME-211ENST00000476336 MIS18AQ9NYP9 233 aa17.44■□□□□ 0.38
PRAME-211ENST00000476336 TRIM35Q9UPQ4 493 aa17.44■□□□□ 0.38
PRAME-211ENST00000476336 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
PRAME-211ENST00000476336 KIF13BQ9NQT8 1826 aa17.43■□□□□ 0.38
PRAME-211ENST00000476336 APAF1O14727 1248 aa17.43■□□□□ 0.38
PRAME-211ENST00000476336 A1BGP04217 495 aa17.43■□□□□ 0.38
PRAME-211ENST00000476336 USPL1Q5W0Q7 1092 aa17.43■□□□□ 0.38
PRAME-211ENST00000476336 ERBB4Q15303 1308 aa17.43■□□□□ 0.38
PRAME-211ENST00000476336 CHL1O00533 1208 aa17.42■□□□□ 0.38
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PRAME-211ENST00000476336 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
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PRAME-211ENST00000476336 CLEC4GQ6UXB4 293 aa17.41■□□□□ 0.38
PRAME-211ENST00000476336 CFAP44Q96MT7 982 aa17.41■□□□□ 0.38
PRAME-211ENST00000476336 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
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PRAME-211ENST00000476336 CCDC27Q2M243 656 aa17.4■□□□□ 0.38
PRAME-211ENST00000476336 NGEFQ8N5V2 710 aa17.4■□□□□ 0.38
PRAME-211ENST00000476336 CHMP4AQ9BY43 222 aa17.4■□□□□ 0.38
PRAME-211ENST00000476336 ZNF652Q9Y2D9 606 aa17.4■□□□□ 0.38
PRAME-211ENST00000476336 GNAI1P63096 354 aa17.39■□□□□ 0.37
PRAME-211ENST00000476336 CCDC184Q52MB2 194 aa17.39■□□□□ 0.37
PRAME-211ENST00000476336 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
PRAME-211ENST00000476336 C10orf71Q711Q0 1435 aa17.38■□□□□ 0.37
PRAME-211ENST00000476336 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa17.38■□□□□ 0.37
PRAME-211ENST00000476336 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa17.38■□□□□ 0.37
PRAME-211ENST00000476336 HOXB7P09629 217 aa17.38■□□□□ 0.37
PRAME-211ENST00000476336 IFT57Q9NWB7 429 aa17.38■□□□□ 0.37
PRAME-211ENST00000476336 BCORQ6W2J9 1755 aa17.38■□□□□ 0.37
PRAME-211ENST00000476336 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
PRAME-211ENST00000476336 NFIXQ14938 502 aa17.37■□□□□ 0.37
PRAME-211ENST00000476336 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa17.37■□□□□ 0.37
PRAME-211ENST00000476336 NRXN2Q9P2S2 1712 aa17.36■□□□□ 0.37
PRAME-211ENST00000476336 BCL2L12Q9HB09 334 aa17.36■□□□□ 0.37
PRAME-211ENST00000476336 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
PRAME-211ENST00000476336 NBPF26B4DH59 902 aa17.35■□□□□ 0.37
PRAME-211ENST00000476336 ERVV-1B6SEH8 477 aa17.35■□□□□ 0.37
PRAME-211ENST00000476336 CAMTA2O94983 1202 aa17.35■□□□□ 0.37
PRAME-211ENST00000476336 ZNF853P0CG23 659 aa17.35■□□□□ 0.37
PRAME-211ENST00000476336 DDR1Q08345 913 aa17.35■□□□□ 0.37
PRAME-211ENST00000476336 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
PRAME-211ENST00000476336 NBPF15Q8N660 670 aa17.35■□□□□ 0.37
PRAME-211ENST00000476336 SETDB2Q96T68 719 aa17.35■□□□□ 0.37
PRAME-211ENST00000476336 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa17.35■□□□□ 0.37
PRAME-211ENST00000476336 CARMIL3Q8ND23 1372 aa17.35■□□□□ 0.37
PRAME-211ENST00000476336 SERPINB2P05120 415 aa17.34■□□□□ 0.37
PRAME-211ENST00000476336 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
PRAME-211ENST00000476336 ATP10DQ9P241 1426 aa17.34■□□□□ 0.37
PRAME-211ENST00000476336 IL16Q14005 1332 aa17.33■□□□□ 0.36
PRAME-211ENST00000476336 KIF6Q6ZMV9 814 aa17.33■□□□□ 0.36
PRAME-211ENST00000476336 ADCY9O60503 1353 aa17.32■□□□□ 0.36
PRAME-211ENST00000476336 TBC1D9BQ66K14 1250 aa17.32■□□□□ 0.36
PRAME-211ENST00000476336 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
PRAME-211ENST00000476336 MBIPQ9NS73 344 aa17.32■□□□□ 0.36
PRAME-211ENST00000476336 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
PRAME-211ENST00000476336 PXDNLA1KZ92 1463 aa17.31■□□□□ 0.36
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