RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467748.1

RABGGTB-206, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 468 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-206ENST00000467748 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-206ENST00000467748 AIDAQ96BJ3 306 aa8.56□□□□□ -1.04
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RABGGTB-206ENST00000467748 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-206ENST00000467748 IGHA1P01876 353 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGGTB-206ENST00000467748 FOXK2Q01167 660 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC9A9Q8IVB4 645 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGGTB-206ENST00000467748 SIX5Q8N196 739 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGGTB-206ENST00000467748 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
RABGGTB-206ENST00000467748 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
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RABGGTB-206ENST00000467748 PTK7Q13308 1070 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-206ENST00000467748 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-206ENST00000467748 GAS2L2Q8NHY3 880 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-206ENST00000467748 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-206ENST00000467748 VRTNQ9H8Y1 702 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-206ENST00000467748 USP17L15C9J2P7 530 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-206ENST00000467748 USP17L10C9JJH3 530 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-206ENST00000467748 USP17L13C9JLJ4 530 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-206ENST00000467748 USP17L12C9JPN9 530 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-206ENST00000467748 USP17L11C9JVI0 530 aa8.53□□□□□ -1.04
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RABGGTB-206ENST00000467748 USP17L18D6R9N7 530 aa8.53□□□□□ -1.04
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RABGGTB-206ENST00000467748 USP17L17D6RBQ6 530 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-206ENST00000467748 USP17L19D6RCP7 530 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-206ENST00000467748 USP17L20D6RJB6 530 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-206ENST00000467748 H7C1W4 665 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-206ENST00000467748 TXLNAP40222 546 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-206ENST00000467748 USP17L24Q0WX57 530 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-206ENST00000467748 DPYDQ12882 1025 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-206ENST00000467748 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
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RABGGTB-206ENST00000467748 C14orf37Q86TY3 774 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-206ENST00000467748 KLRG1Q96E93 195 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-206ENST00000467748 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-206ENST00000467748 NOS2P35228 1153 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-206ENST00000467748 IRS1P35568 1242 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-206ENST00000467748 SEC13P55735 322 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-206ENST00000467748 ANKMY2Q8IV38 441 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-206ENST00000467748 PGBD3Q8N328 593 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-206ENST00000467748 WHAMMQ8TF30 809 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-206ENST00000467748 L3MBTL2Q969R5 705 aa8.5□□□□□ -1.05
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RABGGTB-206ENST00000467748 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM196BA6NMK8 535 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-206ENST00000467748 C21orf2O43822 256 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-206ENST00000467748 TEAD4Q15561 434 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-206ENST00000467748 ARXQ96QS3 562 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-206ENST00000467748 CRISPLD1Q9H336 500 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-206ENST00000467748 C1orf115Q9H7X2 142 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-206ENST00000467748 M0R2N6 131 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGGTB-206ENST00000467748 ADAMTS2O95450 1211 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGGTB-206ENST00000467748 NBPF1Q3BBV0 1214 aa8.48□□□□□ -1.05
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RABGGTB-206ENST00000467748 EML1O00423 815 aa8.47□□□□□ -1.05
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RABGGTB-206ENST00000467748 HCN2Q9UL51 889 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTB-206ENST00000467748 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa8.47□□□□□ -1.05
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RABGGTB-206ENST00000467748 BNIP3LO60238 219 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-206ENST00000467748 TATP17735 454 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
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RABGGTB-206ENST00000467748 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
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RABGGTB-206ENST00000467748 SLURP2P0DP57 97 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
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RABGGTB-206ENST00000467748 C7orf43Q8WVR3 580 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-206ENST00000467748 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
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RABGGTB-206ENST00000467748 LYPD4Q6UWN0 246 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-206ENST00000467748 CCDC82Q8N4S0 544 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-206ENST00000467748 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-206ENST00000467748 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-206ENST00000467748 DCDC2BA2VCK2 349 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-206ENST00000467748 ADAM23O75077 832 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-206ENST00000467748 CTBSQ01459 385 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-206ENST00000467748 LBRQ14739 615 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-206ENST00000467748 STK32AQ8WU08 396 aa8.43□□□□□ -1.06
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