RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462817.5

LIMS1-211, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene LIMS1, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-211ENST00000462817 HEG1Q9ULI3 1381 aa20.53■□□□□ 0.88
LIMS1-211ENST00000462817 USPL1Q5W0Q7 1092 aa20.52■□□□□ 0.88
LIMS1-211ENST00000462817 COL15A1P39059 1388 aa20.51■□□□□ 0.87
LIMS1-211ENST00000462817 C4AP0C0L4 1744 aa20.51■□□□□ 0.87
LIMS1-211ENST00000462817 FKBP8Q14318 412 aa20.51■□□□□ 0.87
LIMS1-211ENST00000462817 UBR2Q8IWV8 1755 aa20.51■□□□□ 0.87
LIMS1-211ENST00000462817 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
LIMS1-211ENST00000462817 A0A087WZG4 1122 aa20.5■□□□□ 0.87
LIMS1-211ENST00000462817 KCNQ3O43525 872 aa20.5■□□□□ 0.87
LIMS1-211ENST00000462817 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
LIMS1-211ENST00000462817 NFE2L2Q16236 605 aa20.5■□□□□ 0.87
LIMS1-211ENST00000462817 PLEKHF1Q96S99 279 aa20.5■□□□□ 0.87
LIMS1-211ENST00000462817 WWC3Q9ULE0 1092 aa20.5■□□□□ 0.87
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LIMS1-211ENST00000462817 TGFB2P61812 414 aa20.48■□□□□ 0.87
LIMS1-211ENST00000462817 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
LIMS1-211ENST00000462817 CHD4Q14839 1912 aa20.48■□□□□ 0.87
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LIMS1-211ENST00000462817 MIS18AQ9NYP9 233 aa20.45■□□□□ 0.86
LIMS1-211ENST00000462817 A0A0G2JLW4 131 aa20.44■□□□□ 0.86
LIMS1-211ENST00000462817 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
LIMS1-211ENST00000462817 USP16Q9Y5T5 823 aa20.44■□□□□ 0.86
LIMS1-211ENST00000462817 C10orf71Q711Q0 1435 aa20.44■□□□□ 0.86
LIMS1-211ENST00000462817 TM4SF1P30408 202 aa20.43■□□□□ 0.86
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LIMS1-211ENST00000462817 DDR1Q08345 913 aa20.43■□□□□ 0.86
LIMS1-211ENST00000462817 BICDL1Q6ZP65 573 aa20.43■□□□□ 0.86
LIMS1-211ENST00000462817 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa20.43■□□□□ 0.86
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LIMS1-211ENST00000462817 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
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LIMS1-211ENST00000462817 DLG5Q8TDM6 1919 aa20.42■□□□□ 0.86
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LIMS1-211ENST00000462817 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
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LIMS1-211ENST00000462817 SERPINB2P05120 415 aa20.4■□□□□ 0.86
LIMS1-211ENST00000462817 NEUROD2Q15784 382 aa20.4■□□□□ 0.86
LIMS1-211ENST00000462817 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.4■□□□□ 0.86
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LIMS1-211ENST00000462817 BCL2L12Q9HB09 334 aa20.39■□□□□ 0.85
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LIMS1-211ENST00000462817 TSPYL4Q9UJ04 414 aa20.38■□□□□ 0.85
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LIMS1-211ENST00000462817 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
LIMS1-211ENST00000462817 SETDB2Q96T68 719 aa20.35■□□□□ 0.85
LIMS1-211ENST00000462817 ZNF652Q9Y2D9 606 aa20.35■□□□□ 0.85
LIMS1-211ENST00000462817 CHRNA5P30532 468 aa20.34■□□□□ 0.85
LIMS1-211ENST00000462817 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
LIMS1-211ENST00000462817 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa20.34■□□□□ 0.85
LIMS1-211ENST00000462817 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
LIMS1-211ENST00000462817 CAMTA2O94983 1202 aa20.33■□□□□ 0.85
LIMS1-211ENST00000462817 NGEFQ8N5V2 710 aa20.33■□□□□ 0.85
LIMS1-211ENST00000462817 KCNA3P22001 575 aa20.32■□□□□ 0.84
LIMS1-211ENST00000462817 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
LIMS1-211ENST00000462817 CARMIL3Q8ND23 1372 aa20.32■□□□□ 0.84
LIMS1-211ENST00000462817 NBPF26B4DH59 902 aa20.31■□□□□ 0.84
LIMS1-211ENST00000462817 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
LIMS1-211ENST00000462817 NBPF15Q8N660 670 aa20.31■□□□□ 0.84
LIMS1-211ENST00000462817 BABAM1Q9NWV8 329 aa20.31■□□□□ 0.84
LIMS1-211ENST00000462817 KDM3BQ7LBC6 1761 aa20.31■□□□□ 0.84
LIMS1-211ENST00000462817 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa20.3■□□□□ 0.84
LIMS1-211ENST00000462817 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
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LIMS1-211ENST00000462817 H0YIN7 160 aa20.3■□□□□ 0.84
LIMS1-211ENST00000462817 CLEC4GQ6UXB4 293 aa20.3■□□□□ 0.84
LIMS1-211ENST00000462817 C2CD5Q86YS7 1000 aa20.3■□□□□ 0.84
LIMS1-211ENST00000462817 MYL6BP14649 208 aa20.29■□□□□ 0.84
LIMS1-211ENST00000462817 PDE6BP35913 854 aa20.29■□□□□ 0.84
LIMS1-211ENST00000462817 ST5P78524 1137 aa20.29■□□□□ 0.84
LIMS1-211ENST00000462817 CNBD1Q8NA66 436 aa20.29■□□□□ 0.84
LIMS1-211ENST00000462817 ANP32CO43423 234 aa20.28■□□□□ 0.84
LIMS1-211ENST00000462817 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
LIMS1-211ENST00000462817 KIF6Q6ZMV9 814 aa20.28■□□□□ 0.84
LIMS1-211ENST00000462817 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
LIMS1-211ENST00000462817 LAMB4A4D0S4 1761 aa20.27■□□□□ 0.84
LIMS1-211ENST00000462817 PRR5LQ6MZQ0 368 aa20.27■□□□□ 0.84
LIMS1-211ENST00000462817 CCDC24Q8N4L8 307 aa20.27■□□□□ 0.84
LIMS1-211ENST00000462817 BRIP1Q9BX63 1249 aa20.27■□□□□ 0.84
LIMS1-211ENST00000462817 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa20.27■□□□□ 0.84
LIMS1-211ENST00000462817 TTLL6Q8N841 843 aa20.26■□□□□ 0.83
LIMS1-211ENST00000462817 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
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