RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458278.6

ANKRD54-208, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 623 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-208ENST00000458278 GPR162Q16538 588 aa22.77■■□□□ 1.24
ANKRD54-208ENST00000458278 COL15A1P39059 1388 aa22.76■■□□□ 1.23
ANKRD54-208ENST00000458278 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
ANKRD54-208ENST00000458278 CHD4Q14839 1912 aa22.76■■□□□ 1.23
ANKRD54-208ENST00000458278 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.75■■□□□ 1.23
ANKRD54-208ENST00000458278 ZPR1O75312 459 aa22.75■■□□□ 1.23
ANKRD54-208ENST00000458278 YY1P25490 414 aa22.75■■□□□ 1.23
ANKRD54-208ENST00000458278 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
ANKRD54-208ENST00000458278 KCNQ3O43525 872 aa22.74■■□□□ 1.23
ANKRD54-208ENST00000458278 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.74■■□□□ 1.23
ANKRD54-208ENST00000458278 NARFQ9UHQ1 456 aa22.73■■□□□ 1.23
ANKRD54-208ENST00000458278 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
ANKRD54-208ENST00000458278 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
ANKRD54-208ENST00000458278 FKBP8Q14318 412 aa22.72■■□□□ 1.23
ANKRD54-208ENST00000458278 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.23
ANKRD54-208ENST00000458278 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
ANKRD54-208ENST00000458278 A0A087WZG4 1122 aa22.71■■□□□ 1.23
ANKRD54-208ENST00000458278 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
ANKRD54-208ENST00000458278 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
ANKRD54-208ENST00000458278 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.71■■□□□ 1.23
ANKRD54-208ENST00000458278 GRIN3BO60391 1043 aa22.7■■□□□ 1.22
ANKRD54-208ENST00000458278 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
ANKRD54-208ENST00000458278 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.7■■□□□ 1.22
ANKRD54-208ENST00000458278 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.69■■□□□ 1.22
ANKRD54-208ENST00000458278 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
ANKRD54-208ENST00000458278 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.68■■□□□ 1.22
ANKRD54-208ENST00000458278 TM4SF1P30408 202 aa22.68■■□□□ 1.22
ANKRD54-208ENST00000458278 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
ANKRD54-208ENST00000458278 TGFB2P61812 414 aa22.68■■□□□ 1.22
ANKRD54-208ENST00000458278 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.68■■□□□ 1.22
ANKRD54-208ENST00000458278 A1BGP04217 495 aa22.67■■□□□ 1.22
ANKRD54-208ENST00000458278 RIPK4P57078 832 aa22.67■■□□□ 1.22
ANKRD54-208ENST00000458278 DDR1Q08345 913 aa22.67■■□□□ 1.22
ANKRD54-208ENST00000458278 USP16Q9Y5T5 823 aa22.67■■□□□ 1.22
ANKRD54-208ENST00000458278 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.66■■□□□ 1.22
ANKRD54-208ENST00000458278 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
ANKRD54-208ENST00000458278 RUNDC1Q96C34 613 aa22.66■■□□□ 1.22
ANKRD54-208ENST00000458278 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.66■■□□□ 1.22
ANKRD54-208ENST00000458278 SCN7AQ01118 1682 aa22.65■■□□□ 1.22
ANKRD54-208ENST00000458278 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
ANKRD54-208ENST00000458278 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
ANKRD54-208ENST00000458278 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.65■■□□□ 1.22
ANKRD54-208ENST00000458278 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.65■■□□□ 1.22
ANKRD54-208ENST00000458278 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.65■■□□□ 1.22
ANKRD54-208ENST00000458278 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.64■■□□□ 1.22
ANKRD54-208ENST00000458278 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.63■■□□□ 1.21
ANKRD54-208ENST00000458278 NFIXQ14938 502 aa22.63■■□□□ 1.21
ANKRD54-208ENST00000458278 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.63■■□□□ 1.21
ANKRD54-208ENST00000458278 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.63■■□□□ 1.21
ANKRD54-208ENST00000458278 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
ANKRD54-208ENST00000458278 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
ANKRD54-208ENST00000458278 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.62■■□□□ 1.21
ANKRD54-208ENST00000458278 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
ANKRD54-208ENST00000458278 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
ANKRD54-208ENST00000458278 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
ANKRD54-208ENST00000458278 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.6■■□□□ 1.21
ANKRD54-208ENST00000458278 BCORQ6W2J9 1755 aa22.6■■□□□ 1.21
ANKRD54-208ENST00000458278 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
ANKRD54-208ENST00000458278 A0A0G2JLW4 131 aa22.59■■□□□ 1.21
ANKRD54-208ENST00000458278 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.59■■□□□ 1.21
ANKRD54-208ENST00000458278 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
ANKRD54-208ENST00000458278 RGL2O15211 777 aa22.58■■□□□ 1.21
ANKRD54-208ENST00000458278 CAMTA2O94983 1202 aa22.58■■□□□ 1.21
ANKRD54-208ENST00000458278 DPEP1P16444 411 aa22.58■■□□□ 1.21
ANKRD54-208ENST00000458278 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
ANKRD54-208ENST00000458278 NBPF26B4DH59 902 aa22.57■■□□□ 1.2
ANKRD54-208ENST00000458278 SERPINB2P05120 415 aa22.57■■□□□ 1.2
ANKRD54-208ENST00000458278 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
ANKRD54-208ENST00000458278 NBPF15Q8N660 670 aa22.57■■□□□ 1.2
ANKRD54-208ENST00000458278 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.56■■□□□ 1.2
ANKRD54-208ENST00000458278 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
ANKRD54-208ENST00000458278 NEUROD2Q15784 382 aa22.56■■□□□ 1.2
ANKRD54-208ENST00000458278 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.56■■□□□ 1.2
ANKRD54-208ENST00000458278 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.56■■□□□ 1.2
ANKRD54-208ENST00000458278 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.56■■□□□ 1.2
ANKRD54-208ENST00000458278 KCNA3P22001 575 aa22.55■■□□□ 1.2
ANKRD54-208ENST00000458278 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.54■■□□□ 1.2
ANKRD54-208ENST00000458278 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
ANKRD54-208ENST00000458278 PIM2Q9P1W9 311 aa22.54■■□□□ 1.2
ANKRD54-208ENST00000458278 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.54■■□□□ 1.2
ANKRD54-208ENST00000458278 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.54■■□□□ 1.2
ANKRD54-208ENST00000458278 SETDB2Q96T68 719 aa22.53■■□□□ 1.2
ANKRD54-208ENST00000458278 BCS1LQ9Y276 419 aa22.53■■□□□ 1.2
ANKRD54-208ENST00000458278 ERBB4Q15303 1308 aa22.53■■□□□ 1.2
ANKRD54-208ENST00000458278 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.52■■□□□ 1.2
ANKRD54-208ENST00000458278 CHL1O00533 1208 aa22.52■■□□□ 1.2
ANKRD54-208ENST00000458278 ANP32CO43423 234 aa22.52■■□□□ 1.2
ANKRD54-208ENST00000458278 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.5■■□□□ 1.19
ANKRD54-208ENST00000458278 APAF1O14727 1248 aa22.49■■□□□ 1.19
ANKRD54-208ENST00000458278 CHRNA5P30532 468 aa22.49■■□□□ 1.19
ANKRD54-208ENST00000458278 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
ANKRD54-208ENST00000458278 CCDC184Q52MB2 194 aa22.48■■□□□ 1.19
ANKRD54-208ENST00000458278 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.48■■□□□ 1.19
ANKRD54-208ENST00000458278 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.48■■□□□ 1.19
ANKRD54-208ENST00000458278 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD54-208ENST00000458278 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD54-208ENST00000458278 CNBD1Q8NA66 436 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD54-208ENST00000458278 CFAP44Q96MT7 982 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD54-208ENST00000458278 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD54-208ENST00000458278 PDE6BP35913 854 aa22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.5 ms