RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455609.1

C9orf41-AS1-201, C9orf41 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf41-AS1, Length 719 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 COL15A1P39059 1388 aa20.63■□□□□ 0.89
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.63■□□□□ 0.89
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NFE2L2Q16236 605 aa20.63■□□□□ 0.89
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FKBP8Q14318 412 aa20.62■□□□□ 0.89
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CANXP27824 592 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 USPL1Q5W0Q7 1092 aa20.61■□□□□ 0.89
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C9orf41-AS1-201ENST00000455609 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP20.6■□□□□ 0.89
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PARP3Q9Y6F1 533 aa20.6■□□□□ 0.89
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KIF13BQ9NQT8 1826 aa20.6■□□□□ 0.89
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C10orf71Q711Q0 1435 aa20.59■□□□□ 0.89
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C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CHD4Q14839 1912 aa20.57■□□□□ 0.88
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C9orf41-AS1-201ENST00000455609 A1BGP04217 495 aa20.56■□□□□ 0.88
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 USP16Q9Y5T5 823 aa20.56■□□□□ 0.88
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PXDNLA1KZ92 1463 aa20.56■□□□□ 0.88
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KDM3BQ7LBC6 1761 aa20.55■□□□□ 0.88
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GRIN3BO60391 1043 aa20.55■□□□□ 0.88
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C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TM4SF1P30408 202 aa20.55■□□□□ 0.88
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP20.55■□□□□ 0.88
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BCL2L12Q9HB09 334 aa20.55■□□□□ 0.88
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 WWC3Q9ULE0 1092 aa20.55■□□□□ 0.88
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 A0A087WZG4 1122 aa20.54■□□□□ 0.88
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
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C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.54■□□□□ 0.88
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
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C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RIPK4P57078 832 aa20.53■□□□□ 0.88
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TGFB2P61812 414 aa20.53■□□□□ 0.88
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SCN7AQ01118 1682 aa20.53■□□□□ 0.88
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NFIXQ14938 502 aa20.52■□□□□ 0.88
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ADAMTS8Q9UP79 889 aa20.52■□□□□ 0.88
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C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
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C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RUNDC1Q96C34 613 aa20.5■□□□□ 0.87
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DPEP1P16444 411 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LMOD3Q0VAK6 560 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NRXN2Q9P2S2 1712 aa20.48■□□□□ 0.87
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NEUROD2Q15784 382 aa20.48■□□□□ 0.87
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BICDL1Q6ZP65 573 aa20.48■□□□□ 0.87
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BCORQ6W2J9 1755 aa20.47■□□□□ 0.87
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NBPF26B4DH59 902 aa20.47■□□□□ 0.87
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CAMTA2O94983 1202 aa20.47■□□□□ 0.87
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TBC1D9BQ66K14 1250 aa20.47■□□□□ 0.87
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NBPF15Q8N660 670 aa20.47■□□□□ 0.87
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SERPINB2P05120 415 aa20.46■□□□□ 0.87
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TSPYL4Q9UJ04 414 aa20.46■□□□□ 0.87
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KCNA3P22001 575 aa20.45■□□□□ 0.86
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRIM35Q9UPQ4 493 aa20.44■□□□□ 0.86
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BCS1LQ9Y276 419 aa20.44■□□□□ 0.86
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CHRNA5P30532 468 aa20.43■□□□□ 0.86
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BABAM1Q9NWV8 329 aa20.42■□□□□ 0.86
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CARMIL3Q8ND23 1372 aa20.42■□□□□ 0.86
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CCDC184Q52MB2 194 aa20.41■□□□□ 0.86
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PIM2Q9P1W9 311 aa20.41■□□□□ 0.86
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SETDB2Q96T68 719 aa20.4■□□□□ 0.86
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CLEC4GQ6UXB4 293 aa20.39■□□□□ 0.85
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PRR5LQ6MZQ0 368 aa20.38■□□□□ 0.85
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF652Q9Y2D9 606 aa20.38■□□□□ 0.85
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa20.38■□□□□ 0.85
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DLEC1Q9Y238 1755 aa20.37■□□□□ 0.85
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CHL1O00533 1208 aa20.37■□□□□ 0.85
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 APAF1O14727 1248 aa20.37■□□□□ 0.85
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MYL6BP14649 208 aa20.37■□□□□ 0.85
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CCDC24Q8N4L8 307 aa20.37■□□□□ 0.85
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NGEFQ8N5V2 710 aa20.37■□□□□ 0.85
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa20.37■□□□□ 0.85
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RGL2O15211 777 aa20.36■□□□□ 0.85
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ANP32CO43423 234 aa20.36■□□□□ 0.85
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CNBD1Q8NA66 436 aa20.36■□□□□ 0.85
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ADCY9O60503 1353 aa20.35■□□□□ 0.85
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