RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 TSPYL4Q9UJ04 414 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-205ENST00000450873 CHL1O00533 1208 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-205ENST00000450873 KCNQ3O43525 872 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-205ENST00000450873 AMIGO3Q86WK7 504 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-205ENST00000450873 WDR63Q8IWG1 891 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-205ENST00000450873 CFAP44Q96MT7 982 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC4A9Q96Q91 983 aa13.81□□□□□ -0.2
RABGEF1-205ENST00000450873 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
RABGEF1-205ENST00000450873 GNAI1P63096 354 aa13.8□□□□□ -0.2
RABGEF1-205ENST00000450873 IFT57Q9NWB7 429 aa13.8□□□□□ -0.2
RABGEF1-205ENST00000450873 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
RABGEF1-205ENST00000450873 KCPQ6ZWJ8 1503 aa13.8□□□□□ -0.2
RABGEF1-205ENST00000450873 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP13.8□□□□□ -0.2
RABGEF1-205ENST00000450873 ITPK1Q13572 414 aa13.8□□□□□ -0.2
RABGEF1-205ENST00000450873 IL16Q14005 1332 aa13.8□□□□□ -0.2
RABGEF1-205ENST00000450873 PHF14O94880 888 aa13.79□□□□□ -0.2
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF853P0CG23 659 aa13.79□□□□□ -0.2
RABGEF1-205ENST00000450873 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
RABGEF1-205ENST00000450873 HEG1Q9ULI3 1381 aa13.79□□□□□ -0.2
RABGEF1-205ENST00000450873 BCL11AQ9H165 835 aa13.79□□□□□ -0.2
RABGEF1-205ENST00000450873 UBR2Q8IWV8 1755 aa13.78□□□□□ -0.2
RABGEF1-205ENST00000450873 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
RABGEF1-205ENST00000450873 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
RABGEF1-205ENST00000450873 KDM3BQ7LBC6 1761 aa13.77□□□□□ -0.2
RABGEF1-205ENST00000450873 GNPATO15228 680 aa13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-205ENST00000450873 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-205ENST00000450873 SMIM5Q71RC9 77 aa13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-205ENST00000450873 DNAJC10Q8IXB1 793 aa13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-205ENST00000450873 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
RABGEF1-205ENST00000450873 STARD3NLO95772 234 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-205ENST00000450873 MBIPQ9NS73 344 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF521Q96K83 1311 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-205ENST00000450873 C1QTNF8P60827 252 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-205ENST00000450873 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-205ENST00000450873 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-205ENST00000450873 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-205ENST00000450873 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-205ENST00000450873 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-205ENST00000450873 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-205ENST00000450873 UTRNP46939 3433 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-205ENST00000450873 CRKLP46109 303 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-205ENST00000450873 GOLGA2Q08379 1002 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-205ENST00000450873 MYH16Q9H6N6 1097 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-205ENST00000450873 TJP1Q07157 1748 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-205ENST00000450873 ADRA2BP18089 450 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-205ENST00000450873 TRAPPC3LQ5T215 181 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC87Q9NVE4 849 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-205ENST00000450873 KIF13BQ9NQT8 1826 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-205ENST00000450873 USP16Q9Y5T5 823 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-205ENST00000450873 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-205ENST00000450873 RPS6KA4O75676 772 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-205ENST00000450873 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-205ENST00000450873 E9PSI1 815 aa13.71□□□□□ -0.21
RABGEF1-205ENST00000450873 HOXB7P09629 217 aa13.71□□□□□ -0.21
RABGEF1-205ENST00000450873 NLGN1Q8N2Q7 840 aa13.71□□□□□ -0.21
RABGEF1-205ENST00000450873 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
RABGEF1-205ENST00000450873 MMP10P09238 476 aa13.71□□□□□ -0.21
RABGEF1-205ENST00000450873 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 FANCIQ9NVI1 1328 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 DUSP27Q5VZP5 1158 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 ATP10DQ9P241 1426 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 ADCY9O60503 1353 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 KRT24Q2M2I5 525 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 CHMP4AQ9BY43 222 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa13.7□□□□□ -0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 C4AP0C0L4 1744 aa13.69□□□□□ -0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 A1BGP04217 495 aa13.69□□□□□ -0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 SLFN5Q08AF3 891 aa13.69□□□□□ -0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 CANXP27824 592 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 C8orf58Q8NAV2 365 aa13.69□□□□□ -0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 C10orf71Q711Q0 1435 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 ERBB4Q15303 1308 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 PXDNLA1KZ92 1463 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 GYS1P13807 737 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 RFC4P35249 363 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 TGFB2P61812 414 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 ZBED9Q6R2W3 1325 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 LAMB4A4D0S4 1761 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A087WZG4 1122 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 EIF5P55010 431 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 CDCA7LQ96GN5 454 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 ERICH6Q7L0X2 663 aa13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 TSPYL6Q8N831 410 aa13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 NBPF26B4DH59 902 aa13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-205ENST00000450873 NBPF15Q8N660 670 aa13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.3 ms