RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427644.1

LIMD1-AS1-201, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMD1-AS1, Length 1,536 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TMEM57Q8N5G2 664 aa12.54□□□□□ -0.4
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ATRNO75882 1429 aa12.54□□□□□ -0.4
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 A0A0G2JS52 829 aa12.53□□□□□ -0.4
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MYT1Q01538 1121 aa12.53□□□□□ -0.4
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 STK31Q9BXU1 1019 aa12.46□□□□□ -0.42
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa12.42□□□□□ -0.42
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 F6X3S4 739 aa12.42□□□□□ -0.42
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa12.41□□□□□ -0.42
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa12.4□□□□□ -0.42
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C5P01031 1676 aa12.4□□□□□ -0.42
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NHSQ6T4R5 1651 aa12.4□□□□□ -0.42
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KCPQ6ZWJ8 1503 aa12.39□□□□□ -0.43
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RGS3P49796 1198 aa12.39□□□□□ -0.43
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FAM196AQ6ZSG2 479 aa12.39□□□□□ -0.43
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KRT27Q7Z3Y8 459 aa12.39□□□□□ -0.43
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ACSBG1Q96GR2 724 aa12.39□□□□□ -0.43
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CHPF2Q9P2E5 772 aa12.39□□□□□ -0.43
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ANXA1P04083 346 aa12.38□□□□□ -0.43
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ATG3Q9NT62 314 aa12.38□□□□□ -0.43
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ERBB4Q15303 1308 aa12.38□□□□□ -0.43
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SLC4A10Q6U841 1118 aa12.37□□□□□ -0.43
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SIRT2Q8IXJ6 389 aa12.37□□□□□ -0.43
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HYPKQ9NX55 129 aa12.37□□□□□ -0.43
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