RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418548.3

SFTA3-201, Transcript of surfactant associated 3, humanhuman

TSL 3

Gene SFTA3, Length 870 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3-201ENST00000418548 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
SFTA3-201ENST00000418548 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
SFTA3-201ENST00000418548 EP400Q96L91 3159 aa18.43■□□□□ 0.54
SFTA3-201ENST00000418548 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
SFTA3-201ENST00000418548 SOCS7O14512 581 aa18.43■□□□□ 0.54
SFTA3-201ENST00000418548 SMC4Q9NTJ3 1288 aa18.43■□□□□ 0.54
SFTA3-201ENST00000418548 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
SFTA3-201ENST00000418548 LY75O60449 1722 aa18.43■□□□□ 0.54
SFTA3-201ENST00000418548 LAMB4A4D0S4 1761 aa18.42■□□□□ 0.54
SFTA3-201ENST00000418548 DNAJC10Q8IXB1 793 aa18.42■□□□□ 0.54
SFTA3-201ENST00000418548 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
SFTA3-201ENST00000418548 PLSCR1O15162 318 aa18.41■□□□□ 0.54
SFTA3-201ENST00000418548 STARD3NLO95772 234 aa18.41■□□□□ 0.54
SFTA3-201ENST00000418548 ATP6V1AP38606 617 aa18.41■□□□□ 0.54
SFTA3-201ENST00000418548 BCL2L13Q9BXK5 485 aa18.41■□□□□ 0.54
SFTA3-201ENST00000418548 STK31Q9BXU1 1019 aa18.41■□□□□ 0.54
SFTA3-201ENST00000418548 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
SFTA3-201ENST00000418548 ERBB4Q15303 1308 aa18.41■□□□□ 0.54
SFTA3-201ENST00000418548 TJP1Q07157 1748 aa18.4■□□□□ 0.54
SFTA3-201ENST00000418548 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
SFTA3-201ENST00000418548 PDIA6Q15084 440 aa18.4■□□□□ 0.54
SFTA3-201ENST00000418548 NECTIN2Q92692 538 aa18.4■□□□□ 0.54
SFTA3-201ENST00000418548 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP18.4■□□□□ 0.54
SFTA3-201ENST00000418548 ITPK1Q13572 414 aa18.39■□□□□ 0.53
SFTA3-201ENST00000418548 CHPF2Q9P2E5 772 aa18.39■□□□□ 0.53
SFTA3-201ENST00000418548 RRP1P56182 461 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
SFTA3-201ENST00000418548 ARHGAP45Q92619 1136 aa18.38■□□□□ 0.53
SFTA3-201ENST00000418548 FOXD4L1Q9NU39 408 aa18.38■□□□□ 0.53
SFTA3-201ENST00000418548 HYPKQ9NX55 129 aa18.38■□□□□ 0.53
SFTA3-201ENST00000418548 KIF16BQ96L93 1317 aa18.38■□□□□ 0.53
SFTA3-201ENST00000418548 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
SFTA3-201ENST00000418548 NBPF26B4DH59 902 aa18.37■□□□□ 0.53
SFTA3-201ENST00000418548 APBA3O96018 575 aa18.37■□□□□ 0.53
SFTA3-201ENST00000418548 A1BGP04217 495 aa18.37■□□□□ 0.53
SFTA3-201ENST00000418548 SLC27A3Q5K4L6 730 aa18.37■□□□□ 0.53
SFTA3-201ENST00000418548 NBPF14Q5TI25 921 aa18.37■□□□□ 0.53
SFTA3-201ENST00000418548 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
SFTA3-201ENST00000418548 LRP10Q7Z4F1 713 aa18.37■□□□□ 0.53
SFTA3-201ENST00000418548 NBPF15Q8N660 670 aa18.37■□□□□ 0.53
SFTA3-201ENST00000418548 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
SFTA3-201ENST00000418548 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
SFTA3-201ENST00000418548 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
SFTA3-201ENST00000418548 PROSER3Q2NL68 480 aa18.36■□□□□ 0.53
SFTA3-201ENST00000418548 G2E3Q7L622 706 aa18.36■□□□□ 0.53
SFTA3-201ENST00000418548 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
SFTA3-201ENST00000418548 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
SFTA3-201ENST00000418548 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
SFTA3-201ENST00000418548 ZBTB22O15209 634 aa18.35■□□□□ 0.53
SFTA3-201ENST00000418548 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
SFTA3-201ENST00000418548 PROM2Q8N271 834 aa18.35■□□□□ 0.53
SFTA3-201ENST00000418548 TAF1LQ8IZX4 1826 aa18.35■□□□□ 0.53
SFTA3-201ENST00000418548 PTPRCP08575 1304 aa18.34■□□□□ 0.53
SFTA3-201ENST00000418548 PLIN1O60240 522 aa18.34■□□□□ 0.53
SFTA3-201ENST00000418548 ANXA1P04083 346 aa18.34■□□□□ 0.53
SFTA3-201ENST00000418548 FLIIQ13045 1269 aa18.34■□□□□ 0.53
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SFTA3-201ENST00000418548 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
SFTA3-201ENST00000418548 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa18.34■□□□□ 0.53
SFTA3-201ENST00000418548 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
SFTA3-201ENST00000418548 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa18.34■□□□□ 0.53
SFTA3-201ENST00000418548 LINC00116Q8NCU8 138 aa18.34■□□□□ 0.53
SFTA3-201ENST00000418548 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
SFTA3-201ENST00000418548 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
SFTA3-201ENST00000418548 LRRC4BQ9NT99 713 aa18.34■□□□□ 0.53
SFTA3-201ENST00000418548 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
SFTA3-201ENST00000418548 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa18.34■□□□□ 0.53
SFTA3-201ENST00000418548 CRKLP46109 303 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
SFTA3-201ENST00000418548 KCNQ4P56696 695 aa18.33■□□□□ 0.52
SFTA3-201ENST00000418548 CCDC125Q86Z20 511 aa18.33■□□□□ 0.52
SFTA3-201ENST00000418548 CCDC87Q9NVE4 849 aa18.33■□□□□ 0.52
SFTA3-201ENST00000418548 RREB1Q92766 1687 aa18.33■□□□□ 0.52
SFTA3-201ENST00000418548 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa18.32■□□□□ 0.52
SFTA3-201ENST00000418548 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
SFTA3-201ENST00000418548 PDE3AQ14432 1141 aa18.32■□□□□ 0.52
SFTA3-201ENST00000418548 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
SFTA3-201ENST00000418548 MS4A1P11836 297 aa18.31■□□□□ 0.52
SFTA3-201ENST00000418548 TRIM27P14373 513 aa18.31■□□□□ 0.52
SFTA3-201ENST00000418548 MYL6BP14649 208 aa18.31■□□□□ 0.52
SFTA3-201ENST00000418548 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
SFTA3-201ENST00000418548 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
SFTA3-201ENST00000418548 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa18.31■□□□□ 0.52
SFTA3-201ENST00000418548 CANXP27824 592 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
SFTA3-201ENST00000418548 EIF5P55010 431 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
SFTA3-201ENST00000418548 COPS6Q7L5N1 327 aa18.3■□□□□ 0.52
SFTA3-201ENST00000418548 CAMKK2Q96RR4 588 aa18.3■□□□□ 0.52
SFTA3-201ENST00000418548 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
SFTA3-201ENST00000418548 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
SFTA3-201ENST00000418548 XAGE3Q8WTP9 111 aa18.29■□□□□ 0.52
SFTA3-201ENST00000418548 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
SFTA3-201ENST00000418548 TNNQ9UQP3 1299 aa18.28■□□□□ 0.52
SFTA3-201ENST00000418548 C4BP0C0L5 1744 aa18.27■□□□□ 0.52
SFTA3-201ENST00000418548 RPS6KA4O75676 772 aa18.27■□□□□ 0.52
SFTA3-201ENST00000418548 DDX58O95786 925 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
SFTA3-201ENST00000418548 BAG6P46379 1132 aa18.27■□□□□ 0.52
SFTA3-201ENST00000418548 C20orf194Q5TEA3 1177 aa18.27■□□□□ 0.52
SFTA3-201ENST00000418548 KSR2Q6VAB6 950 aa18.27■□□□□ 0.52
SFTA3-201ENST00000418548 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa18.27■□□□□ 0.52
SFTA3-201ENST00000418548 ABCC4O15439 1325 aa18.26■□□□□ 0.51
SFTA3-201ENST00000418548 PI4KAP2A4QPH2 592 aa18.26■□□□□ 0.51
SFTA3-201ENST00000418548 RLBP1P12271 317 aa18.26■□□□□ 0.51
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