RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413409.6

PTPRC-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,338 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-206ENST00000413409 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
PTPRC-206ENST00000413409 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRC-206ENST00000413409 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRC-206ENST00000413409 CHRNA5P30532 468 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRC-206ENST00000413409 GOLGA2Q08379 1002 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRC-206ENST00000413409 KDRP35968 1356 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRC-206ENST00000413409 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PTPRC-206ENST00000413409 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRC-206ENST00000413409 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRC-206ENST00000413409 RASSF7Q02833 373 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRC-206ENST00000413409 APAF1O14727 1248 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRC-206ENST00000413409 ADRA2BP18089 450 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRC-206ENST00000413409 RFC4P35249 363 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRC-206ENST00000413409 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PTPRC-206ENST00000413409 RUNDC1Q96C34 613 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRC-206ENST00000413409 GLTPD2A6NH11 291 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRC-206ENST00000413409 FOXN1O15353 648 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRC-206ENST00000413409 RPS6KA4O75676 772 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRC-206ENST00000413409 DDR1Q08345 913 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRC-206ENST00000413409 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRC-206ENST00000413409 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PTPRC-206ENST00000413409 SPG7Q9UQ90 795 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRC-206ENST00000413409 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PTPRC-206ENST00000413409 NCAPD2Q15021 1401 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRC-206ENST00000413409 FLT4P35916 1363 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRC-206ENST00000413409 POTECB2RU33 542 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRC-206ENST00000413409 SLFN5Q08AF3 891 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRC-206ENST00000413409 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PTPRC-206ENST00000413409 E9PSI1 815 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRC-206ENST00000413409 PHKG2P15735 406 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRC-206ENST00000413409 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PTPRC-206ENST00000413409 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PTPRC-206ENST00000413409 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRC-206ENST00000413409 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PTPRC-206ENST00000413409 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PTPRC-206ENST00000413409 CCDC27Q2M243 656 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRC-206ENST00000413409 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRC-206ENST00000413409 LMNB1P20700 586 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRC-206ENST00000413409 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
PTPRC-206ENST00000413409 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRC-206ENST00000413409 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PTPRC-206ENST00000413409 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRC-206ENST00000413409 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRC-206ENST00000413409 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRC-206ENST00000413409 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRC-206ENST00000413409 FAM161AQ3B820 660 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRC-206ENST00000413409 EYA1Q99502 592 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRC-206ENST00000413409 CREBZFQ9NS37 354 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRC-206ENST00000413409 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PTPRC-206ENST00000413409 TM4SF1P30408 202 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRC-206ENST00000413409 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PTPRC-206ENST00000413409 WWC1Q8IX03 1113 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRC-206ENST00000413409 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PTPRC-206ENST00000413409 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
PTPRC-206ENST00000413409 WDR63Q8IWG1 891 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRC-206ENST00000413409 PCDH10Q9P2E7 1040 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRC-206ENST00000413409 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PTPRC-206ENST00000413409 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRC-206ENST00000413409 NFKBIEO00221 500 aa22.14■■□□□ 1.14
PTPRC-206ENST00000413409 POTEIP0CG38 1075 aa22.14■■□□□ 1.14
PTPRC-206ENST00000413409 POTEJP0CG39 1038 aa22.14■■□□□ 1.14
PTPRC-206ENST00000413409 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
PTPRC-206ENST00000413409 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
PTPRC-206ENST00000413409 CNTNAP1P78357 1384 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRC-206ENST00000413409 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRC-206ENST00000413409 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRC-206ENST00000413409 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRC-206ENST00000413409 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRC-206ENST00000413409 CHADLQ6NUI6 762 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRC-206ENST00000413409 POLKQ9UBT6 870 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRC-206ENST00000413409 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRC-206ENST00000413409 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRC-206ENST00000413409 ABHD8Q96I13 439 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRC-206ENST00000413409 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRC-206ENST00000413409 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRC-206ENST00000413409 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRC-206ENST00000413409 LBX1P52954 281 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRC-206ENST00000413409 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PTPRC-206ENST00000413409 VEGFBP49765 207 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRC-206ENST00000413409 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRC-206ENST00000413409 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRC-206ENST00000413409 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PTPRC-206ENST00000413409 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PTPRC-206ENST00000413409 TTLL6Q8N841 843 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRC-206ENST00000413409 WBP1LQ9NX94 342 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRC-206ENST00000413409 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRC-206ENST00000413409 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRC-206ENST00000413409 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRC-206ENST00000413409 AIDAQ96BJ3 306 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRC-206ENST00000413409 PASKQ96RG2 1323 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRC-206ENST00000413409 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PTPRC-206ENST00000413409 IL16Q14005 1332 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRC-206ENST00000413409 CABP4P57796 275 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRC-206ENST00000413409 NFIXQ14938 502 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRC-206ENST00000413409 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PTPRC-206ENST00000413409 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PTPRC-206ENST00000413409 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PTPRC-206ENST00000413409 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRC-206ENST00000413409 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRC-206ENST00000413409 DDNO94850 711 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
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