RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395560.7

UPP1-202, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 2

Gene UPP1, Length 955 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-202ENST00000395560 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.95■■□□□ 1.26
UPP1-202ENST00000395560 LY75O60449 1722 aa22.94■■□□□ 1.26
UPP1-202ENST00000395560 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
UPP1-202ENST00000395560 ERBB4Q15303 1308 aa22.93■■□□□ 1.26
UPP1-202ENST00000395560 STARD3NLO95772 234 aa22.93■■□□□ 1.26
UPP1-202ENST00000395560 STK31Q9BXU1 1019 aa22.93■■□□□ 1.26
UPP1-202ENST00000395560 C5P01031 1676 aa22.93■■□□□ 1.26
UPP1-202ENST00000395560 ATP6V1AP38606 617 aa22.92■■□□□ 1.26
UPP1-202ENST00000395560 NBPF14Q5TI25 921 aa22.92■■□□□ 1.26
UPP1-202ENST00000395560 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
UPP1-202ENST00000395560 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
UPP1-202ENST00000395560 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.91■■□□□ 1.26
UPP1-202ENST00000395560 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.91■■□□□ 1.26
UPP1-202ENST00000395560 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
UPP1-202ENST00000395560 USP16Q9Y5T5 823 aa22.91■■□□□ 1.26
UPP1-202ENST00000395560 CACNA1FO60840 1977 aa22.9■■□□□ 1.26
UPP1-202ENST00000395560 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.9■■□□□ 1.26
UPP1-202ENST00000395560 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.9■■□□□ 1.26
UPP1-202ENST00000395560 TJP1Q07157 1748 aa22.9■■□□□ 1.26
UPP1-202ENST00000395560 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.89■■□□□ 1.25
UPP1-202ENST00000395560 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.89■■□□□ 1.25
UPP1-202ENST00000395560 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
UPP1-202ENST00000395560 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
UPP1-202ENST00000395560 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
UPP1-202ENST00000395560 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.87■■□□□ 1.25
UPP1-202ENST00000395560 KIF16BQ96L93 1317 aa22.86■■□□□ 1.25
UPP1-202ENST00000395560 SLC4A2P04920 1241 aa22.86■■□□□ 1.25
UPP1-202ENST00000395560 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
UPP1-202ENST00000395560 HYPKQ9NX55 129 aa22.86■■□□□ 1.25
UPP1-202ENST00000395560 BCAR3O75815 825 aa22.85■■□□□ 1.25
UPP1-202ENST00000395560 ITPK1Q13572 414 aa22.85■■□□□ 1.25
UPP1-202ENST00000395560 TXNRD1Q16881 649 aa22.85■■□□□ 1.25
UPP1-202ENST00000395560 NECTIN2Q92692 538 aa22.85■■□□□ 1.25
UPP1-202ENST00000395560 SPON1Q9HCB6 807 aa22.85■■□□□ 1.25
UPP1-202ENST00000395560 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
UPP1-202ENST00000395560 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
UPP1-202ENST00000395560 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.84■■□□□ 1.25
UPP1-202ENST00000395560 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
UPP1-202ENST00000395560 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.83■■□□□ 1.25
UPP1-202ENST00000395560 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.82■■□□□ 1.24
UPP1-202ENST00000395560 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
UPP1-202ENST00000395560 ZBTB7AO95365 584 aa22.82■■□□□ 1.24
UPP1-202ENST00000395560 PDIA6Q15084 440 aa22.82■■□□□ 1.24
UPP1-202ENST00000395560 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.82■■□□□ 1.24
UPP1-202ENST00000395560 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.82■■□□□ 1.24
UPP1-202ENST00000395560 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.82■■□□□ 1.24
UPP1-202ENST00000395560 PTPRCP08575 1304 aa22.82■■□□□ 1.24
UPP1-202ENST00000395560 A1BGP04217 495 aa22.81■■□□□ 1.24
UPP1-202ENST00000395560 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
UPP1-202ENST00000395560 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.81■■□□□ 1.24
UPP1-202ENST00000395560 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
UPP1-202ENST00000395560 PTGER2P43116 358 aa22.8■■□□□ 1.24
UPP1-202ENST00000395560 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
UPP1-202ENST00000395560 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.8■■□□□ 1.24
UPP1-202ENST00000395560 MS4A1P11836 297 aa22.79■■□□□ 1.24
UPP1-202ENST00000395560 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
UPP1-202ENST00000395560 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
UPP1-202ENST00000395560 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.79■■□□□ 1.24
UPP1-202ENST00000395560 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
UPP1-202ENST00000395560 NBPF26B4DH59 902 aa22.78■■□□□ 1.24
UPP1-202ENST00000395560 MYL6BP14649 208 aa22.78■■□□□ 1.24
UPP1-202ENST00000395560 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
UPP1-202ENST00000395560 FLIIQ13045 1269 aa22.78■■□□□ 1.24
UPP1-202ENST00000395560 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.78■■□□□ 1.24
UPP1-202ENST00000395560 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
UPP1-202ENST00000395560 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
UPP1-202ENST00000395560 NBPF15Q8N660 670 aa22.78■■□□□ 1.24
UPP1-202ENST00000395560 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
UPP1-202ENST00000395560 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
UPP1-202ENST00000395560 UTRNP46939 3433 aa22.77■■□□□ 1.24
UPP1-202ENST00000395560 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
UPP1-202ENST00000395560 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.77■■□□□ 1.24
UPP1-202ENST00000395560 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
UPP1-202ENST00000395560 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
UPP1-202ENST00000395560 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.77■■□□□ 1.24
UPP1-202ENST00000395560 C4BP0C0L5 1744 aa22.77■■□□□ 1.23
UPP1-202ENST00000395560 KCNQ4P56696 695 aa22.76■■□□□ 1.23
UPP1-202ENST00000395560 SLC15A2Q16348 729 aa22.76■■□□□ 1.23
UPP1-202ENST00000395560 PROSER3Q2NL68 480 aa22.76■■□□□ 1.23
UPP1-202ENST00000395560 ANXA1P04083 346 aa22.75■■□□□ 1.23
UPP1-202ENST00000395560 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.75■■□□□ 1.23
UPP1-202ENST00000395560 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
UPP1-202ENST00000395560 RPS6KA4O75676 772 aa22.74■■□□□ 1.23
UPP1-202ENST00000395560 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
UPP1-202ENST00000395560 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
UPP1-202ENST00000395560 ZNF827Q17R98 1081 aa22.74■■□□□ 1.23
UPP1-202ENST00000395560 COPS6Q7L5N1 327 aa22.74■■□□□ 1.23
UPP1-202ENST00000395560 G2E3Q7L622 706 aa22.74■■□□□ 1.23
UPP1-202ENST00000395560 AK7Q96M32 723 aa22.74■■□□□ 1.23
UPP1-202ENST00000395560 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
UPP1-202ENST00000395560 A0A087WZG4 1122 aa22.73■■□□□ 1.23
UPP1-202ENST00000395560 PDE3AQ14432 1141 aa22.73■■□□□ 1.23
UPP1-202ENST00000395560 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.73■■□□□ 1.23
UPP1-202ENST00000395560 STK32BQ9NY57 414 aa22.73■■□□□ 1.23
UPP1-202ENST00000395560 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
UPP1-202ENST00000395560 SGIP1Q9BQI5 828 aa22.72■■□□□ 1.23
UPP1-202ENST00000395560 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
UPP1-202ENST00000395560 KSR2Q6VAB6 950 aa22.71■■□□□ 1.23
UPP1-202ENST00000395560 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.71■■□□□ 1.23
UPP1-202ENST00000395560 GNPATO15228 680 aa22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms