RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380776.4

KCNQ1-204, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 5

Gene KCNQ1, Length 229 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-204ENST00000380776 SLC39A6Q13433 755 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 DDB1Q16531 1140 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 KSR2Q6VAB6 950 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 NECTIN2Q92692 538 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 WNK3Q9BYP7 1800 aa8.57□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 VPS72Q15906 364 aa8.57□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 FAM161AQ3B820 660 aa8.57□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 NGLY1Q96IV0 654 aa8.57□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa8.57□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 SHANK3Q9BYB0 1731 aa8.57□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 LAMB4A4D0S4 1761 aa8.56□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 PI4KAP2A4QPH2 592 aa8.56□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 F6X3S4 739 aa8.56□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 STARD3NLO95772 234 aa8.56□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 RGS3P49796 1198 aa8.56□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 NUCB1Q02818 461 aa8.56□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa8.56□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 DCTPP1Q9H773 170 aa8.56□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 PAPPAQ13219 1627 aa8.55□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 PDE4AP27815 886 aa8.55□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa8.55□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 BEND3Q5T5X7 828 aa8.55□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 CEP85Q6P2H3 762 aa8.55□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 RIC3Q7Z5B4 369 aa8.55□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 LINS1Q8NG48 757 aa8.55□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 MEIS3Q99687 375 aa8.55□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 BACH2Q9BYV9 841 aa8.55□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 UBR2Q8IWV8 1755 aa8.55□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 ADCY9O60503 1353 aa8.54□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 ATP8B2P98198 1209 aa8.54□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 PDIA6Q15084 440 aa8.54□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 ANKRD45Q5TZF3 282 aa8.54□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa8.54□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 CHD1LQ86WJ1 897 aa8.54□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 PLBD2Q8NHP8 589 aa8.54□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 C8orf37Q96NL8 207 aa8.54□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa8.54□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 BCL9O00512 1426 aa8.54□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 RAB11FIP3O75154 756 aa8.53□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 COPS6Q7L5N1 327 aa8.53□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 XAGE3Q8WTP9 111 aa8.53□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 PIGBQ92521 554 aa8.53□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 USP44Q9H0E7 712 aa8.53□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 C1orf115Q9H7X2 142 aa8.53□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 USP21Q9UK80 565 aa8.53□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 USP16Q9Y5T5 823 aa8.53□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 KCPQ6ZWJ8 1503 aa8.53□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 C5P01031 1676 aa8.53□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa8.52□□□□□ -1.05
KCNQ1-204ENST00000380776 MYL6BP14649 208 aa8.52□□□□□ -1.05
KCNQ1-204ENST00000380776 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
KCNQ1-204ENST00000380776 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
KCNQ1-204ENST00000380776 PROSER3Q2NL68 480 aa8.52□□□□□ -1.05
KCNQ1-204ENST00000380776 SIRT2Q8IXJ6 389 aa8.52□□□□□ -1.05
KCNQ1-204ENST00000380776 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
KCNQ1-204ENST00000380776 UTYO14607 1347 aa8.52□□□□□ -1.05
KCNQ1-204ENST00000380776 BCL9LQ86UU0 1499 aa8.51□□□□□ -1.05
KCNQ1-204ENST00000380776 COL15A1P39059 1388 aa8.51□□□□□ -1.05
KCNQ1-204ENST00000380776 GRM8O00222 908 aa8.51□□□□□ -1.05
KCNQ1-204ENST00000380776 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
KCNQ1-204ENST00000380776 ANXA1P04083 346 aa8.51□□□□□ -1.05
KCNQ1-204ENST00000380776 MTX1Q13505 466 aa8.51□□□□□ -1.05
KCNQ1-204ENST00000380776 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa8.51□□□□□ -1.05
KCNQ1-204ENST00000380776 SSH3Q8TE77 659 aa8.51□□□□□ -1.05
KCNQ1-204ENST00000380776 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
KCNQ1-204ENST00000380776 ATG3Q9NT62 314 aa8.51□□□□□ -1.05
KCNQ1-204ENST00000380776 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
KCNQ1-204ENST00000380776 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
KCNQ1-204ENST00000380776 ITGB4P16144 1822 aa8.51□□□□□ -1.05
KCNQ1-204ENST00000380776 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa8.51□□□□□ -1.05
KCNQ1-204ENST00000380776 KAT6BQ8WYB5 2073 aa8.5□□□□□ -1.05
KCNQ1-204ENST00000380776 NEURL1BA8MQ27 555 aa8.5□□□□□ -1.05
KCNQ1-204ENST00000380776 GLI3P10071 1580 aa8.5□□□□□ -1.05
KCNQ1-204ENST00000380776 HSPA1LP34931 641 aa8.5□□□□□ -1.05
KCNQ1-204ENST00000380776 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
KCNQ1-204ENST00000380776 BMP2KLQ5H9B9 411 aa8.5□□□□□ -1.05
KCNQ1-204ENST00000380776 KIF6Q6ZMV9 814 aa8.5□□□□□ -1.05
KCNQ1-204ENST00000380776 LRP10Q7Z4F1 713 aa8.5□□□□□ -1.05
KCNQ1-204ENST00000380776 ERC1Q8IUD2 1116 aa8.5□□□□□ -1.05
KCNQ1-204ENST00000380776 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
KCNQ1-204ENST00000380776 LNPKQ9C0E8 428 aa8.5□□□□□ -1.05
KCNQ1-204ENST00000380776 POLA2Q14181 598 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNQ1-204ENST00000380776 GCKRQ14397 625 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNQ1-204ENST00000380776 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
KCNQ1-204ENST00000380776 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
KCNQ1-204ENST00000380776 CCDC191Q8NCU4 936 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNQ1-204ENST00000380776 MYD88Q99836 296 aa8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms