RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SGMS1-201ENST00000361543 COL15A1P39059 1388 aa10.2□□□□□ -0.78
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SGMS1-201ENST00000361543 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
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SGMS1-201ENST00000361543 CAMTA2O94983 1202 aa10.08□□□□□ -0.8
SGMS1-201ENST00000361543 SERPINB2P05120 415 aa10.08□□□□□ -0.8
SGMS1-201ENST00000361543 TMPOP42166 694 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
SGMS1-201ENST00000361543 RIPK4P57078 832 aa10.08□□□□□ -0.8
SGMS1-201ENST00000361543 LMOD3Q0VAK6 560 aa10.08□□□□□ -0.8
SGMS1-201ENST00000361543 BICDL1Q6ZP65 573 aa10.08□□□□□ -0.8
SGMS1-201ENST00000361543 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
SGMS1-201ENST00000361543 ATP10DQ9P241 1426 aa10.07□□□□□ -0.8
SGMS1-201ENST00000361543 TIAM2Q8IVF5 1701 aa10.07□□□□□ -0.8
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