RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360059.5

GTPBP4-201, Transcript of GTP binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene GTPBP4, Length 756 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4-201ENST00000360059 MRS2Q9HD23 443 aa25.25■■□□□ 1.63
GTPBP4-201ENST00000360059 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
GTPBP4-201ENST00000360059 MMP10P09238 476 aa25.24■■□□□ 1.63
GTPBP4-201ENST00000360059 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
GTPBP4-201ENST00000360059 CCDC184Q52MB2 194 aa25.24■■□□□ 1.63
GTPBP4-201ENST00000360059 NLGN1Q8N2Q7 840 aa25.24■■□□□ 1.63
GTPBP4-201ENST00000360059 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
GTPBP4-201ENST00000360059 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.23■■□□□ 1.63
GTPBP4-201ENST00000360059 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
GTPBP4-201ENST00000360059 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
GTPBP4-201ENST00000360059 CD2APQ9Y5K6 639 aa25.22■■□□□ 1.63
GTPBP4-201ENST00000360059 COL15A1P39059 1388 aa25.21■■□□□ 1.63
GTPBP4-201ENST00000360059 CANXP27824 592 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
GTPBP4-201ENST00000360059 MIS18AQ9NYP9 233 aa25.21■■□□□ 1.63
GTPBP4-201ENST00000360059 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.21■■□□□ 1.63
GTPBP4-201ENST00000360059 RIPK4P57078 832 aa25.2■■□□□ 1.62
GTPBP4-201ENST00000360059 TMPOP42166 694 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
GTPBP4-201ENST00000360059 ZPR1O75312 459 aa25.18■■□□□ 1.62
GTPBP4-201ENST00000360059 FKBP8Q14318 412 aa25.18■■□□□ 1.62
GTPBP4-201ENST00000360059 RUNDC1Q96C34 613 aa25.18■■□□□ 1.62
GTPBP4-201ENST00000360059 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
GTPBP4-201ENST00000360059 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa25.17■■□□□ 1.62
GTPBP4-201ENST00000360059 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
GTPBP4-201ENST00000360059 USPL1Q5W0Q7 1092 aa25.17■■□□□ 1.62
GTPBP4-201ENST00000360059 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
GTPBP4-201ENST00000360059 A1BGP04217 495 aa25.16■■□□□ 1.62
GTPBP4-201ENST00000360059 EIF5P55010 431 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
GTPBP4-201ENST00000360059 NARFQ9UHQ1 456 aa25.16■■□□□ 1.62
GTPBP4-201ENST00000360059 USP16Q9Y5T5 823 aa25.16■■□□□ 1.62
GTPBP4-201ENST00000360059 GPR162Q16538 588 aa25.15■■□□□ 1.62
GTPBP4-201ENST00000360059 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
GTPBP4-201ENST00000360059 PARP3Q9Y6F1 533 aa25.15■■□□□ 1.62
GTPBP4-201ENST00000360059 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.14■■□□□ 1.62
GTPBP4-201ENST00000360059 NEUROD2Q15784 382 aa25.14■■□□□ 1.62
GTPBP4-201ENST00000360059 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
GTPBP4-201ENST00000360059 KDM3BQ7LBC6 1761 aa25.13■■□□□ 1.61
GTPBP4-201ENST00000360059 A0A087WZG4 1122 aa25.12■■□□□ 1.61
GTPBP4-201ENST00000360059 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
GTPBP4-201ENST00000360059 DDR1Q08345 913 aa25.11■■□□□ 1.61
GTPBP4-201ENST00000360059 BCL2L12Q9HB09 334 aa25.11■■□□□ 1.61
GTPBP4-201ENST00000360059 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
GTPBP4-201ENST00000360059 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
GTPBP4-201ENST00000360059 C10orf71Q711Q0 1435 aa25.1■■□□□ 1.61
GTPBP4-201ENST00000360059 TM4SF1P30408 202 aa25.09■■□□□ 1.61
GTPBP4-201ENST00000360059 TSPYL4Q9UJ04 414 aa25.09■■□□□ 1.61
GTPBP4-201ENST00000360059 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP25.08■■□□□ 1.613e-6■□□□□ 8.2
GTPBP4-201ENST00000360059 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
GTPBP4-201ENST00000360059 TRIM35Q9UPQ4 493 aa25.08■■□□□ 1.61
GTPBP4-201ENST00000360059 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa25.08■■□□□ 1.61
GTPBP4-201ENST00000360059 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
GTPBP4-201ENST00000360059 YY1P25490 414 aa25.07■■□□□ 1.6
GTPBP4-201ENST00000360059 NFIXQ14938 502 aa25.07■■□□□ 1.6
GTPBP4-201ENST00000360059 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
GTPBP4-201ENST00000360059 KIF13BQ9NQT8 1826 aa25.06■■□□□ 1.6
GTPBP4-201ENST00000360059 PXDNLA1KZ92 1463 aa25.05■■□□□ 1.6
GTPBP4-201ENST00000360059 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.05■■□□□ 1.6
GTPBP4-201ENST00000360059 WWC3Q9ULE0 1092 aa25.05■■□□□ 1.6
GTPBP4-201ENST00000360059 LAMB4A4D0S4 1761 aa25.05■■□□□ 1.6
GTPBP4-201ENST00000360059 SCN7AQ01118 1682 aa25.04■■□□□ 1.6
GTPBP4-201ENST00000360059 NBPF26B4DH59 902 aa25.04■■□□□ 1.6
GTPBP4-201ENST00000360059 TGFB2P61812 414 aa25.04■■□□□ 1.6
GTPBP4-201ENST00000360059 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
GTPBP4-201ENST00000360059 NBPF15Q8N660 670 aa25.04■■□□□ 1.6
GTPBP4-201ENST00000360059 BABAM1Q9NWV8 329 aa25.04■■□□□ 1.6
GTPBP4-201ENST00000360059 APAF1O14727 1248 aa25.03■■□□□ 1.6
GTPBP4-201ENST00000360059 CAMTA2O94983 1202 aa25.03■■□□□ 1.6
GTPBP4-201ENST00000360059 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
GTPBP4-201ENST00000360059 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa25.03■■□□□ 1.6
GTPBP4-201ENST00000360059 BICDL1Q6ZP65 573 aa25.02■■□□□ 1.6
GTPBP4-201ENST00000360059 A0A0G2JLW4 131 aa25.01■■□□□ 1.59
GTPBP4-201ENST00000360059 GRIN3BO60391 1043 aa25.01■■□□□ 1.59
GTPBP4-201ENST00000360059 TBC1D9BQ66K14 1250 aa25.01■■□□□ 1.59
GTPBP4-201ENST00000360059 SERPINB2P05120 415 aa25■■□□□ 1.59
GTPBP4-201ENST00000360059 DPEP1P16444 411 aa25■■□□□ 1.59
GTPBP4-201ENST00000360059 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
GTPBP4-201ENST00000360059 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
GTPBP4-201ENST00000360059 BCORQ6W2J9 1755 aa24.98■■□□□ 1.59
GTPBP4-201ENST00000360059 CHL1O00533 1208 aa24.98■■□□□ 1.59
GTPBP4-201ENST00000360059 NRXN2Q9P2S2 1712 aa24.98■■□□□ 1.59
GTPBP4-201ENST00000360059 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
GTPBP4-201ENST00000360059 UTRNP46939 3433 aa24.96■■□□□ 1.59
GTPBP4-201ENST00000360059 NGEFQ8N5V2 710 aa24.95■■□□□ 1.58
GTPBP4-201ENST00000360059 CHD4Q14839 1912 aa24.94■■□□□ 1.58
GTPBP4-201ENST00000360059 CARMIL3Q8ND23 1372 aa24.94■■□□□ 1.58
GTPBP4-201ENST00000360059 MYL6BP14649 208 aa24.94■■□□□ 1.58
GTPBP4-201ENST00000360059 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
GTPBP4-201ENST00000360059 KCNA3P22001 575 aa24.94■■□□□ 1.58
GTPBP4-201ENST00000360059 SETDB2Q96T68 719 aa24.94■■□□□ 1.58
GTPBP4-201ENST00000360059 ZNF652Q9Y2D9 606 aa24.94■■□□□ 1.58
GTPBP4-201ENST00000360059 CHRNA5P30532 468 aa24.93■■□□□ 1.58
GTPBP4-201ENST00000360059 KRT24Q2M2I5 525 aa24.93■■□□□ 1.58
GTPBP4-201ENST00000360059 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.93■■□□□ 1.58
GTPBP4-201ENST00000360059 CFAP44Q96MT7 982 aa24.93■■□□□ 1.58
GTPBP4-201ENST00000360059 BCS1LQ9Y276 419 aa24.93■■□□□ 1.58
GTPBP4-201ENST00000360059 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
GTPBP4-201ENST00000360059 ERBB4Q15303 1308 aa24.92■■□□□ 1.58
GTPBP4-201ENST00000360059 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.91■■□□□ 1.58
GTPBP4-201ENST00000360059 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
GTPBP4-201ENST00000360059 HLFQ16534 295 aa24.9■■□□□ 1.58
GTPBP4-201ENST00000360059 PRR5LQ6MZQ0 368 aa24.9■■□□□ 1.58
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