RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338546.9

HPS1-202, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-202ENST00000338546 ADCY9O60503 1353 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS1-202ENST00000338546 PDIA6Q15084 440 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS1-202ENST00000338546 C5P01031 1676 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS1-202ENST00000338546 ATP8B2P98198 1209 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS1-202ENST00000338546 LNPKQ9C0E8 428 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS1-202ENST00000338546 PAPPAQ13219 1627 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS1-202ENST00000338546 UBR2Q8IWV8 1755 aa20.26■□□□□ 0.83
HPS1-202ENST00000338546 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
HPS1-202ENST00000338546 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
HPS1-202ENST00000338546 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
HPS1-202ENST00000338546 LAMB4A4D0S4 1761 aa20.26■□□□□ 0.83
HPS1-202ENST00000338546 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa20.25■□□□□ 0.83
HPS1-202ENST00000338546 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
HPS1-202ENST00000338546 PROSER3Q2NL68 480 aa20.25■□□□□ 0.83
HPS1-202ENST00000338546 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
HPS1-202ENST00000338546 LRP6O75581 1613 aa20.24■□□□□ 0.83
HPS1-202ENST00000338546 BMP2KLQ5H9B9 411 aa20.24■□□□□ 0.83
HPS1-202ENST00000338546 TNS2Q63HR2 1409 aa20.24■□□□□ 0.83
HPS1-202ENST00000338546 GLI3P10071 1580 aa20.23■□□□□ 0.83
HPS1-202ENST00000338546 LINS1Q8NG48 757 aa20.23■□□□□ 0.83
HPS1-202ENST00000338546 NWD2Q9ULI1 1742 aa20.23■□□□□ 0.83
HPS1-202ENST00000338546 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa20.23■□□□□ 0.83
HPS1-202ENST00000338546 WNK3Q9BYP7 1800 aa20.22■□□□□ 0.83
HPS1-202ENST00000338546 NRAPQ86VF7 1730 aa20.22■□□□□ 0.83
HPS1-202ENST00000338546 ANXA1P04083 346 aa20.22■□□□□ 0.83
HPS1-202ENST00000338546 DDRGK1Q96HY6 314 aa20.21■□□□□ 0.83
HPS1-202ENST00000338546 KCPQ6ZWJ8 1503 aa20.21■□□□□ 0.83
HPS1-202ENST00000338546 EXOC5O00471 708 aa20.21■□□□□ 0.83
HPS1-202ENST00000338546 LRP10Q7Z4F1 713 aa20.21■□□□□ 0.83
HPS1-202ENST00000338546 SSH3Q8TE77 659 aa20.21■□□□□ 0.83
HPS1-202ENST00000338546 TMOD3Q9NYL9 352 aa20.21■□□□□ 0.83
HPS1-202ENST00000338546 USP35Q9P2H5 1018 aa20.21■□□□□ 0.83
HPS1-202ENST00000338546 USP16Q9Y5T5 823 aa20.21■□□□□ 0.83
HPS1-202ENST00000338546 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
HPS1-202ENST00000338546 UTYO14607 1347 aa20.2■□□□□ 0.82
HPS1-202ENST00000338546 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
HPS1-202ENST00000338546 VSIG10Q8N0Z9 540 aa20.2■□□□□ 0.82
HPS1-202ENST00000338546 UBAP1LF5GYI3 381 aa20.19■□□□□ 0.82
HPS1-202ENST00000338546 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
HPS1-202ENST00000338546 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
HPS1-202ENST00000338546 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa20.19■□□□□ 0.82
HPS1-202ENST00000338546 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa20.18■□□□□ 0.82
HPS1-202ENST00000338546 SLIT2O94813 1529 aa20.18■□□□□ 0.82
HPS1-202ENST00000338546 PIP4K2BP78356 416 aa20.18■□□□□ 0.82
HPS1-202ENST00000338546 NEXNQ0ZGT2 675 aa20.18■□□□□ 0.82
HPS1-202ENST00000338546 MTX1Q13505 466 aa20.18■□□□□ 0.82
HPS1-202ENST00000338546 POLA2Q14181 598 aa20.17■□□□□ 0.82
HPS1-202ENST00000338546 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa20.17■□□□□ 0.82
HPS1-202ENST00000338546 RIC3Q7Z5B4 369 aa20.17■□□□□ 0.82
HPS1-202ENST00000338546 XAGE3Q8WTP9 111 aa20.17■□□□□ 0.82
HPS1-202ENST00000338546 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
HPS1-202ENST00000338546 RAB11FIP3O75154 756 aa20.17■□□□□ 0.82
HPS1-202ENST00000338546 COPS6Q7L5N1 327 aa20.17■□□□□ 0.82
HPS1-202ENST00000338546 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
HPS1-202ENST00000338546 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa20.17■□□□□ 0.82
HPS1-202ENST00000338546 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
HPS1-202ENST00000338546 ADAMTS2O95450 1211 aa20.16■□□□□ 0.82
HPS1-202ENST00000338546 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
HPS1-202ENST00000338546 JCADQ9P266 1359 aa20.15■□□□□ 0.82
HPS1-202ENST00000338546 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa20.15■□□□□ 0.82
HPS1-202ENST00000338546 MYL6BP14649 208 aa20.15■□□□□ 0.82
HPS1-202ENST00000338546 BARGINQ6ZT62 677 aa20.15■□□□□ 0.82
HPS1-202ENST00000338546 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa20.14■□□□□ 0.82
HPS1-202ENST00000338546 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa20.14■□□□□ 0.82
HPS1-202ENST00000338546 GRM8O00222 908 aa20.14■□□□□ 0.81
HPS1-202ENST00000338546 MSH5O43196 834 aa20.14■□□□□ 0.81
HPS1-202ENST00000338546 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
HPS1-202ENST00000338546 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa20.14■□□□□ 0.81
HPS1-202ENST00000338546 PLBD2Q8NHP8 589 aa20.14■□□□□ 0.81
HPS1-202ENST00000338546 LRRCC1Q9C099 1032 aa20.14■□□□□ 0.81
HPS1-202ENST00000338546 OSBPL3Q9H4L5 887 aa20.14■□□□□ 0.81
HPS1-202ENST00000338546 ITGB4P16144 1822 aa20.13■□□□□ 0.81
HPS1-202ENST00000338546 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa20.13■□□□□ 0.81
HPS1-202ENST00000338546 PIGBQ92521 554 aa20.13■□□□□ 0.81
HPS1-202ENST00000338546 BCL9O00512 1426 aa20.13■□□□□ 0.81
HPS1-202ENST00000338546 COL15A1P39059 1388 aa20.12■□□□□ 0.81
HPS1-202ENST00000338546 IGKV5-2P06315 115 aa20.12■□□□□ 0.81
HPS1-202ENST00000338546 NEURL1BA8MQ27 555 aa20.11■□□□□ 0.81
HPS1-202ENST00000338546 SEC24BO95487 1268 aa20.11■□□□□ 0.81
HPS1-202ENST00000338546 TTC22Q5TAA0 569 aa20.11■□□□□ 0.81
HPS1-202ENST00000338546 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
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HPS1-202ENST00000338546 GCKRQ14397 625 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS1-202ENST00000338546 DDB1Q16531 1140 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS1-202ENST00000338546 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
HPS1-202ENST00000338546 NBPF14Q5TI25 921 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS1-202ENST00000338546 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
HPS1-202ENST00000338546 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
HPS1-202ENST00000338546 NBPF15Q8N660 670 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS1-202ENST00000338546 ATG3Q9NT62 314 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS1-202ENST00000338546 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS1-202ENST00000338546 UNC5CLQ8IV45 518 aa20.09■□□□□ 0.81
HPS1-202ENST00000338546 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa20.09■□□□□ 0.81
HPS1-202ENST00000338546 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa20.08■□□□□ 0.81
HPS1-202ENST00000338546 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
HPS1-202ENST00000338546 TBC1D32Q96NH3 1257 aa20.08■□□□□ 0.81
HPS1-202ENST00000338546 STARD3NLO95772 234 aa20.08■□□□□ 0.8
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