RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327307.11

RRN3-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3, Length 2,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-202ENST00000327307 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 CHST12Q9NRB3 414 aa8.41□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 POLG2Q9UHN1 485 aa8.41□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 TMCC3Q9ULS5 477 aa8.41□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 GAPVD1Q14C86 1478 aa8.41□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 BRD3Q15059 726 aa8.41□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 C16orf87Q6PH81 154 aa8.41□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 RELL1Q8IUW5 271 aa8.41□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 TTC14Q96N46 770 aa8.41□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 CAPN10Q9HC96 672 aa8.41□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 ERICH4A6NGS2 130 aa8.4□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 GOLGA6L22H0YM25 854 aa8.4□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 NEFHP12036 1026 aa8.4□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 PAX7P23759 505 aa8.4□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 TRAPPC10P48553 1259 aa8.4□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.06
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RRN3-202ENST00000327307 TMEM63CQ9P1W3 806 aa8.4□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 HDAC9Q9UKV0 1011 aa8.4□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 CEP83Q9Y592 693 aa8.4□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 EID1Q9Y6B2 187 aa8.4□□□□□ -1.06
RRN3-202ENST00000327307 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa8.39□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 CDHR1Q96JP9 859 aa8.39□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa8.39□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 SEPT2Q15019 361 aa8.39□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 MFSD4BQ5TF39 518 aa8.39□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 PDXDC1Q6P996 788 aa8.39□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 CCDC34Q96HJ3 373 aa8.39□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 FMNL2Q96PY5 1086 aa8.39□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 SUN2Q9UH99 717 aa8.39□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 ZNF652Q9Y2D9 606 aa8.39□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 ZNF132P52740 706 aa8.38□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 CCT2P78371 535 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 DCTN1Q14203 1278 aa8.38□□□□□ -1.07
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RRN3-202ENST00000327307 RELTQ969Z4 430 aa8.38□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 FRMD6Q96NE9 622 aa8.38□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 CLIC5Q9NZA1 410 aa8.38□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
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RRN3-202ENST00000327307 ATRIPQ8WXE1 791 aa8.37□□□□□ -1.07
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RRN3-202ENST00000327307 TRPC1P48995 793 aa8.37□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 ZNF131P52739 623 aa8.37□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 IP6K2Q9UHH9 426 aa8.37□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 TNFRSF10BO14763 440 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 VAMP4O75379 141 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 BPNT1O95861 308 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 RPN1P04843 607 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 TMEM95Q3KNT9 176 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 IQCEQ6IPM2 695 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 PBRM1Q86U86 1689 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 A6NJY4 79 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 MSH5O43196 834 aa8.36□□□□□ -1.07
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RRN3-202ENST00000327307 PIK3CAP42336 1068 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 CASP2P42575 452 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 TAF11Q15544 211 aa8.36□□□□□ -1.07
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RRN3-202ENST00000327307 PPP4R4Q6NUP7 873 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 FERMT3Q86UX7 667 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 IQCF2Q8IXL9 164 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP8.36□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 PPCSQ9HAB8 311 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 POLR3EQ9NVU0 708 aa8.36□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 ENPP3O14638 875 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 KRT18P05783 430 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 ABCD1P33897 745 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 SERPINB4P48594 390 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP8.35□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 TOMM20Q15388 145 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 LDLRAD1Q5T700 205 aa8.35□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 A0A1W2PRQ8 180 aa8.34□□□□□ -1.07
RRN3-202ENST00000327307 SLC26A4O43511 780 aa8.34□□□□□ -1.07
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