RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 STARD3NLO95772 234 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 MMP10P09238 476 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 LAMB4A4D0S4 1761 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 NLGN1Q8N2Q7 840 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIF13BQ9NQT8 1826 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMPOP42166 694 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 CANXP27824 592 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 RIPK4P57078 832 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 MIS18AQ9NYP9 233 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD2APQ9Y5K6 639 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCN7AQ01118 1682 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 DCAF8L1A6NGE4 600 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 RUNDC1Q96C34 613 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 FKBP8Q14318 412 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa25.77■■□□□ 1.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 EIF5P55010 431 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 USPL1Q5W0Q7 1092 aa25.77■■□□□ 1.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 NARFQ9UHQ1 456 aa25.77■■□□□ 1.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 C10orf71Q711Q0 1435 aa25.77■■□□□ 1.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC184Q52MB2 194 aa25.76■■□□□ 1.71
PTPRCAP-201ENST00000326294 USP16Q9Y5T5 823 aa25.76■■□□□ 1.71
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZPR1O75312 459 aa25.75■■□□□ 1.71
PTPRCAP-201ENST00000326294 A1BGP04217 495 aa25.75■■□□□ 1.71
PTPRCAP-201ENST00000326294 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.75■■□□□ 1.71
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
PTPRCAP-201ENST00000326294 BCORQ6W2J9 1755 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRCAP-201ENST00000326294 DDR1Q08345 913 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRCAP-201ENST00000326294 NEUROD2Q15784 382 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRCAP-201ENST00000326294 BCL2L12Q9HB09 334 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRCAP-201ENST00000326294 UTRNP46939 3433 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRCAP-201ENST00000326294 PARP3Q9Y6F1 533 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A087WZG4 1122 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANP32CO43423 234 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRCAP-201ENST00000326294 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM35Q9UPQ4 493 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRCAP-201ENST00000326294 PXDNLA1KZ92 1463 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRCAP-201ENST00000326294 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.71
PTPRCAP-201ENST00000326294 TM4SF1P30408 202 aa25.7■■□□□ 1.7
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
PTPRCAP-201ENST00000326294 NRXN2Q9P2S2 1712 aa25.7■■□□□ 1.7
PTPRCAP-201ENST00000326294 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
PTPRCAP-201ENST00000326294 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR162Q16538 588 aa25.69■■□□□ 1.7
PTPRCAP-201ENST00000326294 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSPYL4Q9UJ04 414 aa25.69■■□□□ 1.7
PTPRCAP-201ENST00000326294 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
PTPRCAP-201ENST00000326294 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
PTPRCAP-201ENST00000326294 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP25.68■■□□□ 1.7
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHD4Q14839 1912 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRCAP-201ENST00000326294 NBPF26B4DH59 902 aa25.67■■□□□ 1.7
PTPRCAP-201ENST00000326294 NFIXQ14938 502 aa25.67■■□□□ 1.7
PTPRCAP-201ENST00000326294 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
PTPRCAP-201ENST00000326294 NBPF15Q8N660 670 aa25.67■■□□□ 1.7
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa25.67■■□□□ 1.7
PTPRCAP-201ENST00000326294 BABAM1Q9NWV8 329 aa25.66■■□□□ 1.7
PTPRCAP-201ENST00000326294 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
PTPRCAP-201ENST00000326294 APAF1O14727 1248 aa25.64■■□□□ 1.7
PTPRCAP-201ENST00000326294 CAMTA2O94983 1202 aa25.64■■□□□ 1.7
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRS2Q9HD23 443 aa25.64■■□□□ 1.7
PTPRCAP-201ENST00000326294 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHL1O00533 1208 aa25.61■■□□□ 1.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 YY1P25490 414 aa25.61■■□□□ 1.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 TGFB2P61812 414 aa25.61■■□□□ 1.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBC1D9BQ66K14 1250 aa25.61■■□□□ 1.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 WWC3Q9ULE0 1092 aa25.61■■□□□ 1.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 BICDL1Q6ZP65 573 aa25.59■■□□□ 1.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A0G2JLW4 131 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 SERPINB2P05120 415 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 DPEP1P16444 411 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 CARMIL3Q8ND23 1372 aa25.57■■□□□ 1.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 GRIN3BO60391 1043 aa25.57■■□□□ 1.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 DLEC1Q9Y238 1755 aa25.56■■□□□ 1.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa25.56■■□□□ 1.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERBB4Q15303 1308 aa25.56■■□□□ 1.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 CFAP44Q96MT7 982 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNA3P22001 575 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRT24Q2M2I5 525 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 RGL2O15211 777 aa25.53■■□□□ 1.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLEC4GQ6UXB4 293 aa25.53■■□□□ 1.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa25.53■■□□□ 1.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUP98P52948 1817 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF853P0CG23 659 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYL6BP14649 208 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHRNA5P30532 468 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF652Q9Y2D9 606 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDIA6Q15084 440 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRP10Q7Z4F1 713 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 NGEFQ8N5V2 710 aa25.51■■□□□ 1.67
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