RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312233.4

GLIS1-201, Transcript of GLIS family zinc finger 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene GLIS1, Length 2,812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1-201ENST00000312233 AGLP35573 1532 aa20.75■□□□□ 0.91
GLIS1-201ENST00000312233 NYAP1Q6ZVC0 841 aa20.74■□□□□ 0.91
GLIS1-201ENST00000312233 GOLGA5Q8TBA6 731 aa20.74■□□□□ 0.91
GLIS1-201ENST00000312233 GSCP56915 257 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
GLIS1-201ENST00000312233 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP20.73■□□□□ 0.91
GLIS1-201ENST00000312233 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa20.73■□□□□ 0.91
GLIS1-201ENST00000312233 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
GLIS1-201ENST00000312233 DRC7Q8IY82 874 aa20.73■□□□□ 0.91
GLIS1-201ENST00000312233 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
GLIS1-201ENST00000312233 NOS1P29475 1434 aa20.73■□□□□ 0.91
GLIS1-201ENST00000312233 TCHHQ07283 1943 aa20.73■□□□□ 0.91
GLIS1-201ENST00000312233 USP27XA6NNY8 438 aa20.73■□□□□ 0.91
GLIS1-201ENST00000312233 UBE2HP62256 183 aa20.73■□□□□ 0.91
GLIS1-201ENST00000312233 PTPN14Q15678 1187 aa20.73■□□□□ 0.91
GLIS1-201ENST00000312233 NPATQ14207 1427 aa20.73■□□□□ 0.91
GLIS1-201ENST00000312233 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
GLIS1-201ENST00000312233 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa20.73■□□□□ 0.91
GLIS1-201ENST00000312233 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
GLIS1-201ENST00000312233 CCDC171Q6TFL3 1326 aa20.72■□□□□ 0.91
GLIS1-201ENST00000312233 SHPRHQ149N8 1683 aa20.72■□□□□ 0.91
GLIS1-201ENST00000312233 MAGEA9P43362 315 aa20.72■□□□□ 0.91
GLIS1-201ENST00000312233 NEK4P51957 841 aa20.72■□□□□ 0.91
GLIS1-201ENST00000312233 E2F4Q16254 413 aa20.72■□□□□ 0.91
GLIS1-201ENST00000312233 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa20.72■□□□□ 0.91
GLIS1-201ENST00000312233 UBXN6Q9BZV1 441 aa20.72■□□□□ 0.91
GLIS1-201ENST00000312233 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
GLIS1-201ENST00000312233 MYOM1P52179 1685 aa20.72■□□□□ 0.91
GLIS1-201ENST00000312233 CCDC91Q7Z6B0 441 aa20.72■□□□□ 0.91
GLIS1-201ENST00000312233 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
GLIS1-201ENST00000312233 CNPY2Q9Y2B0 182 aa20.72■□□□□ 0.91
GLIS1-201ENST00000312233 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
GLIS1-201ENST00000312233 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
GLIS1-201ENST00000312233 SUFUQ9UMX1 484 aa20.71■□□□□ 0.91
GLIS1-201ENST00000312233 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
GLIS1-201ENST00000312233 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
GLIS1-201ENST00000312233 TTC22Q5TAA0 569 aa20.7■□□□□ 0.9
GLIS1-201ENST00000312233 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
GLIS1-201ENST00000312233 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
GLIS1-201ENST00000312233 FAM200AQ8TCP9 573 aa20.7■□□□□ 0.9
GLIS1-201ENST00000312233 UGGT1Q9NYU2 1555 aa20.69■□□□□ 0.9
GLIS1-201ENST00000312233 REXO1L1PQ8IX06 675 aa20.69■□□□□ 0.9
GLIS1-201ENST00000312233 IQUBQ8NA54 791 aa20.69■□□□□ 0.9
GLIS1-201ENST00000312233 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
GLIS1-201ENST00000312233 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa20.69■□□□□ 0.9
GLIS1-201ENST00000312233 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.69■□□□□ 0.9
GLIS1-201ENST00000312233 MED4Q9NPJ6 270 aa20.69■□□□□ 0.9
GLIS1-201ENST00000312233 CCDC192P0DO97 292 aa20.68■□□□□ 0.9
GLIS1-201ENST00000312233 MCM2P49736 904 aa20.68■□□□□ 0.9
GLIS1-201ENST00000312233 SIRT2Q8IXJ6 389 aa20.68■□□□□ 0.9
GLIS1-201ENST00000312233 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
GLIS1-201ENST00000312233 PLA2G4DQ86XP0 818 aa20.68■□□□□ 0.9
GLIS1-201ENST00000312233 ZNF75DP51815 510 aa20.67■□□□□ 0.9
GLIS1-201ENST00000312233 LUZP1Q86V48 1076 aa20.67■□□□□ 0.9
GLIS1-201ENST00000312233 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
GLIS1-201ENST00000312233 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
GLIS1-201ENST00000312233 OAS2P29728 719 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
GLIS1-201ENST00000312233 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa20.66■□□□□ 0.9
GLIS1-201ENST00000312233 TMCO3Q6UWJ1 677 aa20.66■□□□□ 0.9
GLIS1-201ENST00000312233 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
GLIS1-201ENST00000312233 LRRN4CLQ8ND94 238 aa20.66■□□□□ 0.9
GLIS1-201ENST00000312233 CCDC144BQ3MJ40 725 aa20.66■□□□□ 0.9
GLIS1-201ENST00000312233 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa20.66■□□□□ 0.9
GLIS1-201ENST00000312233 MNS1Q8NEH6 495 aa20.66■□□□□ 0.9
GLIS1-201ENST00000312233 TDO2P48775 406 aa20.65■□□□□ 0.9
GLIS1-201ENST00000312233 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa20.65■□□□□ 0.9
GLIS1-201ENST00000312233 CARD14Q9BXL6 1004 aa20.65■□□□□ 0.9
GLIS1-201ENST00000312233 AATKQ6ZMQ8 1374 aa20.65■□□□□ 0.9
GLIS1-201ENST00000312233 CCDC189A1A4V9 331 aa20.65■□□□□ 0.9
GLIS1-201ENST00000312233 AK7Q96M32 723 aa20.65■□□□□ 0.9
GLIS1-201ENST00000312233 TRIM5Q9C035 493 aa20.65■□□□□ 0.9
GLIS1-201ENST00000312233 L2HGDHQ9H9P8 463 aa20.65■□□□□ 0.9
GLIS1-201ENST00000312233 MCTP2Q6DN12 878 aa20.64■□□□□ 0.9
GLIS1-201ENST00000312233 ACTN2P35609 894 aa20.64■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 PSD3Q9NYI0 1048 aa20.64■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 MED14O60244 1454 aa20.64■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 CASC1Q6TDU7 716 aa20.63■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 SDSP20132 328 aa20.63■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 LRRC8AQ8IWT6 810 aa20.63■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 EXOC4Q96A65 974 aa20.63■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 CLIP2Q9UDT6 1046 aa20.63■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 MRVI1Q9Y6F6 885 aa20.62■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 LMAN1P49257 510 aa20.62■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 PPM1EQ8WY54 764 aa20.62■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 FAM212AQ96EL1 285 aa20.61■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 ELP1O95163 1332 aa20.61■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 ABCC11Q96J66 1382 aa20.61■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 FIBPO43427 364 aa20.61■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 ATP8B1O43520 1251 aa20.61■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 ATP6V1AP38606 617 aa20.61■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa20.61■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 NBPF20Q3BBV1 942 aa20.6■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 RNF217Q8TC41 542 aa20.6■□□□□ 0.89
GLIS1-201ENST00000312233 ADAM21Q9UKJ8 722 aa20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 161.6 ms