RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 LMTK3Q96Q04 1460 aa23.88■■□□□ 1.41
SPNS1-201ENST00000311008 SURF6O75683 361 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
SPNS1-201ENST00000311008 PI4KAP2A4QPH2 592 aa23.87■■□□□ 1.41
SPNS1-201ENST00000311008 TSHZ3Q63HK5 1081 aa23.87■■□□□ 1.41
SPNS1-201ENST00000311008 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa23.87■■□□□ 1.41
SPNS1-201ENST00000311008 GRPEL1Q9HAV7 217 aa23.86■■□□□ 1.41
SPNS1-201ENST00000311008 SRGAP3O43295 1099 aa23.86■■□□□ 1.41
SPNS1-201ENST00000311008 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa23.86■■□□□ 1.41
SPNS1-201ENST00000311008 RHPN1Q8TCX5 695 aa23.86■■□□□ 1.41
SPNS1-201ENST00000311008 ANKRD24Q8TF21 1146 aa23.86■■□□□ 1.41
SPNS1-201ENST00000311008 ORAI2Q96SN7 254 aa23.86■■□□□ 1.41
SPNS1-201ENST00000311008 RGPD2P0DJD1 1756 aa23.85■■□□□ 1.41
SPNS1-201ENST00000311008 KLHL40Q2TBA0 621 aa23.85■■□□□ 1.41
SPNS1-201ENST00000311008 ALDH1L1O75891 902 aa23.84■■□□□ 1.41
SPNS1-201ENST00000311008 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa23.84■■□□□ 1.41
SPNS1-201ENST00000311008 KCNQ3O43525 872 aa23.84■■□□□ 1.41
SPNS1-201ENST00000311008 NEK4P51957 841 aa23.84■■□□□ 1.41
SPNS1-201ENST00000311008 ANO2Q9NQ90 1003 aa23.83■■□□□ 1.41
SPNS1-201ENST00000311008 HEG1Q9ULI3 1381 aa23.83■■□□□ 1.41
SPNS1-201ENST00000311008 MST1RQ04912 1400 aa23.83■■□□□ 1.41
SPNS1-201ENST00000311008 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.4
SPNS1-201ENST00000311008 MTX1Q13505 466 aa23.83■■□□□ 1.4
SPNS1-201ENST00000311008 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa23.83■■□□□ 1.4
SPNS1-201ENST00000311008 ADCY9O60503 1353 aa23.82■■□□□ 1.4
SPNS1-201ENST00000311008 KIF1AQ12756 1690 aa23.82■■□□□ 1.4
SPNS1-201ENST00000311008 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
SPNS1-201ENST00000311008 KRT28Q7Z3Y7 464 aa23.81■■□□□ 1.4
SPNS1-201ENST00000311008 ARXQ96QS3 562 aa23.81■■□□□ 1.4
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SPNS1-201ENST00000311008 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
SPNS1-201ENST00000311008 PXDNQ92626 1479 aa23.8■■□□□ 1.4
SPNS1-201ENST00000311008 KSR2Q6VAB6 950 aa23.8■■□□□ 1.4
SPNS1-201ENST00000311008 HYPKQ9NX55 129 aa23.8■■□□□ 1.4
SPNS1-201ENST00000311008 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
SPNS1-201ENST00000311008 LMOD2Q6P5Q4 547 aa23.79■■□□□ 1.4
SPNS1-201ENST00000311008 NUTM1Q86Y26 1132 aa23.79■■□□□ 1.4
SPNS1-201ENST00000311008 PI4K2BQ8TCG2 481 aa23.79■■□□□ 1.4
SPNS1-201ENST00000311008 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
SPNS1-201ENST00000311008 TMX3Q96JJ7 454 aa23.79■■□□□ 1.4
SPNS1-201ENST00000311008 TTC41PQ6P2S7 1318 aa23.79■■□□□ 1.4
SPNS1-201ENST00000311008 CUL4AQ13619 759 aa23.79■■□□□ 1.4
SPNS1-201ENST00000311008 UNC5CLQ8IV45 518 aa23.79■■□□□ 1.4
SPNS1-201ENST00000311008 CNTROBQ8N137 903 aa23.79■■□□□ 1.4
SPNS1-201ENST00000311008 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
SPNS1-201ENST00000311008 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
SPNS1-201ENST00000311008 MCTP1Q6DN14 999 aa23.78■■□□□ 1.4
SPNS1-201ENST00000311008 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
SPNS1-201ENST00000311008 PANK2Q9BZ23 570 aa23.78■■□□□ 1.4
SPNS1-201ENST00000311008 ERC1Q8IUD2 1116 aa23.77■■□□□ 1.4
SPNS1-201ENST00000311008 DDX58O95786 925 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
SPNS1-201ENST00000311008 C19orf44Q9H6X5 657 aa23.76■■□□□ 1.39
SPNS1-201ENST00000311008 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
SPNS1-201ENST00000311008 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa23.76■■□□□ 1.39
SPNS1-201ENST00000311008 C1orf167Q5SNV9 1468 aa23.76■■□□□ 1.39
SPNS1-201ENST00000311008 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa23.76■■□□□ 1.39
SPNS1-201ENST00000311008 HSPA4P34932 840 aa23.75■■□□□ 1.39
SPNS1-201ENST00000311008 PALD1Q9ULE6 856 aa23.75■■□□□ 1.39
SPNS1-201ENST00000311008 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
SPNS1-201ENST00000311008 ANXA1P04083 346 aa23.75■■□□□ 1.39
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SPNS1-201ENST00000311008 AXIN2Q9Y2T1 843 aa23.74■■□□□ 1.39
SPNS1-201ENST00000311008 ERBB3P21860 1342 aa23.74■■□□□ 1.39
SPNS1-201ENST00000311008 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
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SPNS1-201ENST00000311008 PKP1Q13835 747 aa23.74■■□□□ 1.39
SPNS1-201ENST00000311008 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP23.74■■□□□ 1.39
SPNS1-201ENST00000311008 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa23.73■■□□□ 1.39
SPNS1-201ENST00000311008 GAS2L3Q86XJ1 694 aa23.73■■□□□ 1.39
SPNS1-201ENST00000311008 LINS1Q8NG48 757 aa23.73■■□□□ 1.39
SPNS1-201ENST00000311008 GPATCH3Q96I76 525 aa23.73■■□□□ 1.39
SPNS1-201ENST00000311008 ZDHHC9Q9Y397 364 aa23.72■■□□□ 1.39
SPNS1-201ENST00000311008 RAD50Q92878 1312 aa23.72■■□□□ 1.39
SPNS1-201ENST00000311008 AK9Q5TCS8 1911 aa23.72■■□□□ 1.39
SPNS1-201ENST00000311008 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa23.71■■□□□ 1.39
SPNS1-201ENST00000311008 UTYO14607 1347 aa23.71■■□□□ 1.39
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF445P59923 1031 aa23.71■■□□□ 1.39
SPNS1-201ENST00000311008 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa23.7■■□□□ 1.38
SPNS1-201ENST00000311008 RUFY2Q8WXA3 655 aa23.7■■□□□ 1.38
SPNS1-201ENST00000311008 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP23.7■■□□□ 1.38
SPNS1-201ENST00000311008 PROSER3Q2NL68 480 aa23.69■■□□□ 1.38
SPNS1-201ENST00000311008 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa23.69■■□□□ 1.38
SPNS1-201ENST00000311008 ABCC6O95255 1503 aa23.69■■□□□ 1.38
SPNS1-201ENST00000311008 ALS2Q96Q42 1657 aa23.69■■□□□ 1.38
SPNS1-201ENST00000311008 GRM8O00222 908 aa23.68■■□□□ 1.38
SPNS1-201ENST00000311008 BRD1O95696 1058 aa23.68■■□□□ 1.38
SPNS1-201ENST00000311008 ECHDC1Q9NTX5 307 aa23.68■■□□□ 1.38
SPNS1-201ENST00000311008 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa23.68■■□□□ 1.38
SPNS1-201ENST00000311008 SPG7Q9UQ90 795 aa23.68■■□□□ 1.38
SPNS1-201ENST00000311008 PLEKHG5O94827 1062 aa23.67■■□□□ 1.38
SPNS1-201ENST00000311008 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
SPNS1-201ENST00000311008 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
SPNS1-201ENST00000311008 TATP17735 454 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF790Q6PG37 636 aa23.67■■□□□ 1.38
SPNS1-201ENST00000311008 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
SPNS1-201ENST00000311008 SLC52A2Q9HAB3 445 aa23.67■■□□□ 1.38
SPNS1-201ENST00000311008 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
SPNS1-201ENST00000311008 IL25Q9H293 177 aa23.66■■□□□ 1.38
SPNS1-201ENST00000311008 NPHP3Q7Z494 1330 aa23.66■■□□□ 1.38
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