RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
PTX4-201ENST00000293922 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
PTX4-201ENST00000293922 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
PTX4-201ENST00000293922 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa23.99■■□□□ 1.43
PTX4-201ENST00000293922 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
PTX4-201ENST00000293922 HEG1Q9ULI3 1381 aa23.99■■□□□ 1.43
PTX4-201ENST00000293922 BTBD11A6QL63 1104 aa23.98■■□□□ 1.43
PTX4-201ENST00000293922 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
PTX4-201ENST00000293922 DCTN1Q14203 1278 aa23.98■■□□□ 1.43
PTX4-201ENST00000293922 KCNQ3O43525 872 aa23.97■■□□□ 1.43
PTX4-201ENST00000293922 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
PTX4-201ENST00000293922 NEFMP07197 916 aa23.95■■□□□ 1.42
PTX4-201ENST00000293922 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP23.95■■□□□ 1.42
PTX4-201ENST00000293922 FMNL2Q96PY5 1086 aa23.95■■□□□ 1.42
PTX4-201ENST00000293922 COL15A1P39059 1388 aa23.94■■□□□ 1.42
PTX4-201ENST00000293922 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.94■■□□□ 1.42
PTX4-201ENST00000293922 STARD3NLO95772 234 aa23.94■■□□□ 1.42
PTX4-201ENST00000293922 FKBP8Q14318 412 aa23.94■■□□□ 1.42
PTX4-201ENST00000293922 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.93■■□□□ 1.42
PTX4-201ENST00000293922 APAF1O14727 1248 aa23.93■■□□□ 1.42
PTX4-201ENST00000293922 NFE2L2Q16236 605 aa23.93■■□□□ 1.42
PTX4-201ENST00000293922 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
PTX4-201ENST00000293922 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
PTX4-201ENST00000293922 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
PTX4-201ENST00000293922 C10orf71Q711Q0 1435 aa23.91■■□□□ 1.42
PTX4-201ENST00000293922 ZPR1O75312 459 aa23.91■■□□□ 1.42
PTX4-201ENST00000293922 USPL1Q5W0Q7 1092 aa23.91■■□□□ 1.42
PTX4-201ENST00000293922 NARFQ9UHQ1 456 aa23.91■■□□□ 1.42
PTX4-201ENST00000293922 PARP3Q9Y6F1 533 aa23.91■■□□□ 1.42
PTX4-201ENST00000293922 EIF5P55010 431 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
PTX4-201ENST00000293922 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
PTX4-201ENST00000293922 NGEFQ8N5V2 710 aa23.9■■□□□ 1.42
PTX4-201ENST00000293922 DDR1Q08345 913 aa23.89■■□□□ 1.41
PTX4-201ENST00000293922 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
PTX4-201ENST00000293922 DLG5Q8TDM6 1919 aa23.89■■□□□ 1.41
PTX4-201ENST00000293922 KIF13BQ9NQT8 1826 aa23.88■■□□□ 1.41
PTX4-201ENST00000293922 TM4SF1P30408 202 aa23.88■■□□□ 1.41
PTX4-201ENST00000293922 TMPOP42166 694 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
PTX4-201ENST00000293922 PXDNLA1KZ92 1463 aa23.88■■□□□ 1.41
PTX4-201ENST00000293922 GRIN3BO60391 1043 aa23.87■■□□□ 1.41
PTX4-201ENST00000293922 BCL2L12Q9HB09 334 aa23.87■■□□□ 1.41
PTX4-201ENST00000293922 CHD4Q14839 1912 aa23.86■■□□□ 1.41
PTX4-201ENST00000293922 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa23.86■■□□□ 1.41
PTX4-201ENST00000293922 A1BGP04217 495 aa23.86■■□□□ 1.41
PTX4-201ENST00000293922 MIS18AQ9NYP9 233 aa23.86■■□□□ 1.41
PTX4-201ENST00000293922 USP16Q9Y5T5 823 aa23.86■■□□□ 1.41
PTX4-201ENST00000293922 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.86■■□□□ 1.41
PTX4-201ENST00000293922 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa23.85■■□□□ 1.41
PTX4-201ENST00000293922 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
PTX4-201ENST00000293922 TGFB2P61812 414 aa23.85■■□□□ 1.41
PTX4-201ENST00000293922 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
PTX4-201ENST00000293922 WWC3Q9ULE0 1092 aa23.85■■□□□ 1.41
PTX4-201ENST00000293922 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.84■■□□□ 1.41
PTX4-201ENST00000293922 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
PTX4-201ENST00000293922 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
PTX4-201ENST00000293922 A0A087WZG4 1122 aa23.84■■□□□ 1.41
PTX4-201ENST00000293922 CCDC27Q2M243 656 aa23.84■■□□□ 1.41
PTX4-201ENST00000293922 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
PTX4-201ENST00000293922 NFIXQ14938 502 aa23.83■■□□□ 1.4
PTX4-201ENST00000293922 A0A0G2JLW4 131 aa23.82■■□□□ 1.4
PTX4-201ENST00000293922 RIPK4P57078 832 aa23.82■■□□□ 1.4
PTX4-201ENST00000293922 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
PTX4-201ENST00000293922 NEUROD2Q15784 382 aa23.81■■□□□ 1.4
PTX4-201ENST00000293922 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
PTX4-201ENST00000293922 ZNF521Q96K83 1311 aa23.81■■□□□ 1.4
PTX4-201ENST00000293922 DPEP1P16444 411 aa23.8■■□□□ 1.4
PTX4-201ENST00000293922 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
PTX4-201ENST00000293922 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa23.8■■□□□ 1.4
PTX4-201ENST00000293922 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
PTX4-201ENST00000293922 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
PTX4-201ENST00000293922 KDM3BQ7LBC6 1761 aa23.79■■□□□ 1.4
PTX4-201ENST00000293922 TRIM35Q9UPQ4 493 aa23.79■■□□□ 1.4
PTX4-201ENST00000293922 SCN7AQ01118 1682 aa23.78■■□□□ 1.4
PTX4-201ENST00000293922 WWC1Q8IX03 1113 aa23.78■■□□□ 1.4
PTX4-201ENST00000293922 KCNA3P22001 575 aa23.77■■□□□ 1.4
PTX4-201ENST00000293922 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
PTX4-201ENST00000293922 LMOD3Q0VAK6 560 aa23.77■■□□□ 1.4
PTX4-201ENST00000293922 NBPF26B4DH59 902 aa23.76■■□□□ 1.39
PTX4-201ENST00000293922 CAMTA2O94983 1202 aa23.76■■□□□ 1.39
PTX4-201ENST00000293922 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
PTX4-201ENST00000293922 NBPF15Q8N660 670 aa23.76■■□□□ 1.39
PTX4-201ENST00000293922 NRXN2Q9P2S2 1712 aa23.76■■□□□ 1.39
PTX4-201ENST00000293922 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
PTX4-201ENST00000293922 SERPINB2P05120 415 aa23.76■■□□□ 1.39
PTX4-201ENST00000293922 TBC1D9BQ66K14 1250 aa23.76■■□□□ 1.39
PTX4-201ENST00000293922 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
PTX4-201ENST00000293922 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
PTX4-201ENST00000293922 BICDL1Q6ZP65 573 aa23.75■■□□□ 1.39
PTX4-201ENST00000293922 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
PTX4-201ENST00000293922 BCS1LQ9Y276 419 aa23.74■■□□□ 1.39
PTX4-201ENST00000293922 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
PTX4-201ENST00000293922 LAMB4A4D0S4 1761 aa23.72■■□□□ 1.39
PTX4-201ENST00000293922 CHRNA5P30532 468 aa23.72■■□□□ 1.39
PTX4-201ENST00000293922 WDR63Q8IWG1 891 aa23.72■■□□□ 1.39
PTX4-201ENST00000293922 TSPYL4Q9UJ04 414 aa23.72■■□□□ 1.39
PTX4-201ENST00000293922 BCORQ6W2J9 1755 aa23.71■■□□□ 1.39
PTX4-201ENST00000293922 CARMIL3Q8ND23 1372 aa23.7■■□□□ 1.39
PTX4-201ENST00000293922 BABAM1Q9NWV8 329 aa23.7■■□□□ 1.38
PTX4-201ENST00000293922 PIM2Q9P1W9 311 aa23.7■■□□□ 1.38
PTX4-201ENST00000293922 GOLGA2Q08379 1002 aa23.68■■□□□ 1.38
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