RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000251203.13

PBX4-201, Transcript of PBX homeobox 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PBX4, Length 1,724 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX4-201ENST00000251203 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
PBX4-201ENST00000251203 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
PBX4-201ENST00000251203 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
PBX4-201ENST00000251203 ZNF790Q6PG37 636 aa26.68■■□□□ 1.86
PBX4-201ENST00000251203 FLIIQ13045 1269 aa26.68■■□□□ 1.86
PBX4-201ENST00000251203 SLC39A6Q13433 755 aa26.68■■□□□ 1.86
PBX4-201ENST00000251203 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
PBX4-201ENST00000251203 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
PBX4-201ENST00000251203 ILDR2Q71H61 639 aa26.67■■□□□ 1.86
PBX4-201ENST00000251203 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
PBX4-201ENST00000251203 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa26.67■■□□□ 1.86
PBX4-201ENST00000251203 BRWD3Q6RI45 1802 aa26.66■■□□□ 1.86
PBX4-201ENST00000251203 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
PBX4-201ENST00000251203 CABP4P57796 275 aa26.65■■□□□ 1.86
PBX4-201ENST00000251203 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
PBX4-201ENST00000251203 CHMP4AQ9BY43 222 aa26.65■■□□□ 1.86
PBX4-201ENST00000251203 RGS3P49796 1198 aa26.65■■□□□ 1.86
PBX4-201ENST00000251203 CHPF2Q9P2E5 772 aa26.64■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa26.63■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 F6X3S4 739 aa26.63■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 PAPPAQ13219 1627 aa26.63■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 BARGINQ6ZT62 677 aa26.62■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 ERVV-2B6SEH9 535 aa26.62■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 UBR2Q8IWV8 1755 aa26.61■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 A0A0G2JS52 829 aa26.61■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 SEPT12Q8IYM1 358 aa26.6■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 NFKBIBQ15653 356 aa26.59■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 C1orf115Q9H7X2 142 aa26.59■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 PXDNLA1KZ92 1463 aa26.59■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 CCT4P50991 539 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 SLC4A10Q6U841 1118 aa26.59■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 TTC5Q8N0Z6 440 aa26.58■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 LAMB4A4D0S4 1761 aa26.58■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 ANXA1P04083 346 aa26.56■■□□□ 1.84
PBX4-201ENST00000251203 ITGB4P16144 1822 aa26.56■■□□□ 1.84
PBX4-201ENST00000251203 PROSER3Q2NL68 480 aa26.56■■□□□ 1.84
PBX4-201ENST00000251203 TNS2Q63HR2 1409 aa26.55■■□□□ 1.84
PBX4-201ENST00000251203 FMNL2Q96PY5 1086 aa26.55■■□□□ 1.84
PBX4-201ENST00000251203 MEIS3Q99687 375 aa26.54■■□□□ 1.84
PBX4-201ENST00000251203 KCPQ6ZWJ8 1503 aa26.54■■□□□ 1.84
PBX4-201ENST00000251203 BECN1Q14457 450 aa26.53■■□□□ 1.84
PBX4-201ENST00000251203 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
PBX4-201ENST00000251203 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa26.53■■□□□ 1.84
PBX4-201ENST00000251203 GSE1Q14687 1217 aa26.52■■□□□ 1.84
PBX4-201ENST00000251203 SIRT2Q8IXJ6 389 aa26.52■■□□□ 1.84
PBX4-201ENST00000251203 SMC5Q8IY18 1101 aa26.52■■□□□ 1.84
PBX4-201ENST00000251203 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
PBX4-201ENST00000251203 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP26.52■■□□□ 1.84
PBX4-201ENST00000251203 ATP10DQ9P241 1426 aa26.52■■□□□ 1.84
PBX4-201ENST00000251203 EXOC5O00471 708 aa26.51■■□□□ 1.83
PBX4-201ENST00000251203 PDIA6Q15084 440 aa26.51■■□□□ 1.83
PBX4-201ENST00000251203 ADCY9O60503 1353 aa26.5■■□□□ 1.83
PBX4-201ENST00000251203 HYPKQ9NX55 129 aa26.5■■□□□ 1.83
PBX4-201ENST00000251203 USP16Q9Y5T5 823 aa26.49■■□□□ 1.83
PBX4-201ENST00000251203 TMOD3Q9NYL9 352 aa26.48■■□□□ 1.83
PBX4-201ENST00000251203 PI4KAP2A4QPH2 592 aa26.48■■□□□ 1.83
PBX4-201ENST00000251203 DDB1Q16531 1140 aa26.48■■□□□ 1.83
PBX4-201ENST00000251203 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa26.48■■□□□ 1.83
PBX4-201ENST00000251203 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
PBX4-201ENST00000251203 DNAAF4Q8WXU2 420 aa26.47■■□□□ 1.83
PBX4-201ENST00000251203 DOT1LQ8TEK3 1739 aa26.46■■□□□ 1.83
PBX4-201ENST00000251203 FAM182BQ5T319 152 aa26.46■■□□□ 1.83
PBX4-201ENST00000251203 KRT27Q7Z3Y8 459 aa26.46■■□□□ 1.83
PBX4-201ENST00000251203 ANKRD44Q8N8A2 993 aa26.45■■□□□ 1.83
PBX4-201ENST00000251203 CEP85Q6P2H3 762 aa26.45■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 PIGBQ92521 554 aa26.44■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 SLC4A3P48751 1232 aa26.43■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 BEND3Q5T5X7 828 aa26.43■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 KSR2Q6VAB6 950 aa26.43■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 LRP10Q7Z4F1 713 aa26.43■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa26.42■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 BCL9O00512 1426 aa26.42■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 GNAI3P08754 354 aa26.42■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 MYL6BP14649 208 aa26.42■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa26.42■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 GCC1Q96CN9 775 aa26.41■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 USP44Q9H0E7 712 aa26.41■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 GNAI2P04899 355 aa26.4■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 NUCB1Q02818 461 aa26.4■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 ASAP1Q9ULH1 1129 aa26.4■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 KAT6BQ8WYB5 2073 aa26.4■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 XAGE3Q8WTP9 111 aa26.39■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 TBC1D32Q96NH3 1257 aa26.39■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 ATG3Q9NT62 314 aa26.39■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 DDX58O95786 925 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.81
PBX4-201ENST00000251203 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.81
PBX4-201ENST00000251203 ERBB4Q15303 1308 aa26.39■■□□□ 1.81
PBX4-201ENST00000251203 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
PBX4-201ENST00000251203 COPS6Q7L5N1 327 aa26.36■■□□□ 1.81
PBX4-201ENST00000251203 DCTPP1Q9H773 170 aa26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms