RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000221770.7

POP4-201, Transcript of POP4 homolog, ribonuclease P/MRP subunit, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene POP4, Length 2,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4-201ENST00000221770 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP19.17■□□□□ 0.66
POP4-201ENST00000221770 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
POP4-201ENST00000221770 LMOD2Q6P5Q4 547 aa19.17■□□□□ 0.66
POP4-201ENST00000221770 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa19.17■□□□□ 0.66
POP4-201ENST00000221770 ANKRD24Q8TF21 1146 aa19.17■□□□□ 0.66
POP4-201ENST00000221770 SURF6O75683 361 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
POP4-201ENST00000221770 CHMLP26374 656 aa19.16■□□□□ 0.66
POP4-201ENST00000221770 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
POP4-201ENST00000221770 MCCP23508 829 aa19.16■□□□□ 0.66
POP4-201ENST00000221770 CLCN1P35523 988 aa19.16■□□□□ 0.66
POP4-201ENST00000221770 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
POP4-201ENST00000221770 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
POP4-201ENST00000221770 KRT28Q7Z3Y7 464 aa19.14■□□□□ 0.66
POP4-201ENST00000221770 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa19.14■□□□□ 0.66
POP4-201ENST00000221770 NCAPD2Q15021 1401 aa19.14■□□□□ 0.65
POP4-201ENST00000221770 SRGAP3O43295 1099 aa19.14■□□□□ 0.65
POP4-201ENST00000221770 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
POP4-201ENST00000221770 MRE11P49959 708 aa19.14■□□□□ 0.65
POP4-201ENST00000221770 SLIT3O75094 1523 aa19.14■□□□□ 0.65
POP4-201ENST00000221770 BAG4O95429 457 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
POP4-201ENST00000221770 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
POP4-201ENST00000221770 RHPN1Q8TCX5 695 aa19.13■□□□□ 0.65
POP4-201ENST00000221770 ARXQ96QS3 562 aa19.13■□□□□ 0.65
POP4-201ENST00000221770 KDM3BQ7LBC6 1761 aa19.13■□□□□ 0.65
POP4-201ENST00000221770 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
POP4-201ENST00000221770 LMO7Q8WWI1 1683 aa19.13■□□□□ 0.65
POP4-201ENST00000221770 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
POP4-201ENST00000221770 KIF1BPQ96EK5 621 aa19.13■□□□□ 0.65
POP4-201ENST00000221770 PDCL3Q9H2J4 239 aa19.13■□□□□ 0.65
POP4-201ENST00000221770 ANAPC15P60006 121 aa19.12■□□□□ 0.65
POP4-201ENST00000221770 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa19.12■□□□□ 0.65
POP4-201ENST00000221770 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa19.12■□□□□ 0.65
POP4-201ENST00000221770 ADAMTSL3P82987 1691 aa19.12■□□□□ 0.65
POP4-201ENST00000221770 MCM2P49736 904 aa19.12■□□□□ 0.65
POP4-201ENST00000221770 NUTM1Q86Y26 1132 aa19.12■□□□□ 0.65
POP4-201ENST00000221770 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
POP4-201ENST00000221770 ANXA1P04083 346 aa19.11■□□□□ 0.65
POP4-201ENST00000221770 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
POP4-201ENST00000221770 NEK4P51957 841 aa19.11■□□□□ 0.65
POP4-201ENST00000221770 ANO2Q9NQ90 1003 aa19.11■□□□□ 0.65
POP4-201ENST00000221770 RGPD2P0DJD1 1756 aa19.11■□□□□ 0.65
POP4-201ENST00000221770 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
POP4-201ENST00000221770 UNC5CLQ8IV45 518 aa19.11■□□□□ 0.65
POP4-201ENST00000221770 AXIN2Q9Y2T1 843 aa19.11■□□□□ 0.65
POP4-201ENST00000221770 ADCY9O60503 1353 aa19.1■□□□□ 0.65
POP4-201ENST00000221770 ALDH1L1O75891 902 aa19.09■□□□□ 0.65
POP4-201ENST00000221770 HDAC5Q9UQL6 1122 aa19.09■□□□□ 0.65
POP4-201ENST00000221770 TAF7LQ5H9L4 462 aa19.09■□□□□ 0.65
POP4-201ENST00000221770 GRPEL1Q9HAV7 217 aa19.09■□□□□ 0.65
POP4-201ENST00000221770 HEG1Q9ULI3 1381 aa19.08■□□□□ 0.65
POP4-201ENST00000221770 KSR2Q6VAB6 950 aa19.08■□□□□ 0.65
POP4-201ENST00000221770 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.65
POP4-201ENST00000221770 C19orf44Q9H6X5 657 aa19.08■□□□□ 0.65
POP4-201ENST00000221770 PXDNQ92626 1479 aa19.08■□□□□ 0.64
POP4-201ENST00000221770 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa19.08■□□□□ 0.64
POP4-201ENST00000221770 PI4K2BQ8TCG2 481 aa19.07■□□□□ 0.64
POP4-201ENST00000221770 IL17RAQ96F46 866 aa19.07■□□□□ 0.64
POP4-201ENST00000221770 HYPKQ9NX55 129 aa19.07■□□□□ 0.64
POP4-201ENST00000221770 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
POP4-201ENST00000221770 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa19.07■□□□□ 0.64
POP4-201ENST00000221770 MTX1Q13505 466 aa19.07■□□□□ 0.64
POP4-201ENST00000221770 KLHL40Q2TBA0 621 aa19.06■□□□□ 0.64
POP4-201ENST00000221770 TMX3Q96JJ7 454 aa19.06■□□□□ 0.64
POP4-201ENST00000221770 PALD1Q9ULE6 856 aa19.06■□□□□ 0.64
POP4-201ENST00000221770 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
POP4-201ENST00000221770 C1orf167Q5SNV9 1468 aa19.06■□□□□ 0.64
POP4-201ENST00000221770 MCTP1Q6DN14 999 aa19.06■□□□□ 0.64
POP4-201ENST00000221770 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
POP4-201ENST00000221770 CNTROBQ8N137 903 aa19.05■□□□□ 0.64
POP4-201ENST00000221770 PANK2Q9BZ23 570 aa19.05■□□□□ 0.64
POP4-201ENST00000221770 PKP1Q13835 747 aa19.05■□□□□ 0.64
POP4-201ENST00000221770 PROSER3Q2NL68 480 aa19.05■□□□□ 0.64
POP4-201ENST00000221770 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
POP4-201ENST00000221770 ERBB3P21860 1342 aa19.04■□□□□ 0.64
POP4-201ENST00000221770 MST1RQ04912 1400 aa19.04■□□□□ 0.64
POP4-201ENST00000221770 DDX58O95786 925 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
POP4-201ENST00000221770 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
POP4-201ENST00000221770 TTC41PQ6P2S7 1318 aa19.03■□□□□ 0.64
POP4-201ENST00000221770 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
POP4-201ENST00000221770 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa19.03■□□□□ 0.64
POP4-201ENST00000221770 CUL4AQ13619 759 aa19.03■□□□□ 0.64
POP4-201ENST00000221770 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa19.03■□□□□ 0.64
POP4-201ENST00000221770 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP19.03■□□□□ 0.64
POP4-201ENST00000221770 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
POP4-201ENST00000221770 HSPA4P34932 840 aa19.02■□□□□ 0.64
POP4-201ENST00000221770 GAS2L3Q86XJ1 694 aa19.02■□□□□ 0.64
POP4-201ENST00000221770 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
POP4-201ENST00000221770 LINS1Q8NG48 757 aa19.02■□□□□ 0.64
POP4-201ENST00000221770 ZDHHC9Q9Y397 364 aa19.02■□□□□ 0.64
POP4-201ENST00000221770 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa19.02■□□□□ 0.64
POP4-201ENST00000221770 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
POP4-201ENST00000221770 ERC1Q8IUD2 1116 aa19.02■□□□□ 0.64
POP4-201ENST00000221770 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
POP4-201ENST00000221770 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
POP4-201ENST00000221770 LMTK3Q96Q04 1460 aa19.02■□□□□ 0.64
POP4-201ENST00000221770 LMBRD1Q9NUN5 540 aa19.02■□□□□ 0.64
POP4-201ENST00000221770 SGSM2O43147 1006 aa19.01■□□□□ 0.63
POP4-201ENST00000221770 KIF1AQ12756 1690 aa19.01■□□□□ 0.63
POP4-201ENST00000221770 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
POP4-201ENST00000221770 IL25Q9H293 177 aa19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms