RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000022225.11

Trim23-201, Transcript of E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trim23, Length 3,416 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim23-201ENSMUST00000022225 Gm11983V9GXS8 105 aa14.74□□□□□ -0.05
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Trim23-201ENSMUST00000022225 Jakmip1Q8BVL9 626 aa14.7□□□□□ -0.06
Trim23-201ENSMUST00000022225 Ift57Q8BXG3 429 aa14.7□□□□□ -0.06
Trim23-201ENSMUST00000022225 Igbp1bQ9QZ29 343 aa14.7□□□□□ -0.06
Trim23-201ENSMUST00000022225 Hmox1P14901 289 aa14.7□□□□□ -0.06
Trim23-201ENSMUST00000022225 Mctp2Q5RJH2 878 aa14.7□□□□□ -0.06
Trim23-201ENSMUST00000022225 Zpr1Q62384 459 aa14.7□□□□□ -0.06
Trim23-201ENSMUST00000022225 Hsp90b1P08113 802 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
Trim23-201ENSMUST00000022225 Tpm1P58771 284 aa14.7□□□□□ -0.06
Trim23-201ENSMUST00000022225 GscQ02591 256 aa14.69□□□□□ -0.06
Trim23-201ENSMUST00000022225 Rtel1Q0VGM9 1203 aa14.69□□□□□ -0.06
Trim23-201ENSMUST00000022225 Kif20bQ80WE4 1774 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Trim23-201ENSMUST00000022225 Ube2oQ6ZPJ3 1288 aa14.69□□□□□ -0.06
Trim23-201ENSMUST00000022225 Rufy3Q9D394 469 aa14.69□□□□□ -0.06
Trim23-201ENSMUST00000022225 Odf2lQ9D478 642 aa14.69□□□□□ -0.06
Trim23-201ENSMUST00000022225 Surf1P09925 306 aa14.68□□□□□ -0.06
Trim23-201ENSMUST00000022225 Frat1P70339 274 aa14.68□□□□□ -0.06
Trim23-201ENSMUST00000022225 U2surpQ6NV83 1029 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
Trim23-201ENSMUST00000022225 Smc3Q9CW03 1217 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
Trim23-201ENSMUST00000022225 Babam1Q3UI43 333 aa14.67□□□□□ -0.06
Trim23-201ENSMUST00000022225 Pof1bQ8K4L4 587 aa14.67□□□□□ -0.06
Trim23-201ENSMUST00000022225 Bmp2kQ91Z96 1138 aa14.67□□□□□ -0.06
Trim23-201ENSMUST00000022225 1700017N19RikA0A087WPJ1 469 aa14.67□□□□□ -0.06
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Trim23-201ENSMUST00000022225 Klhdc4Q921I2 584 aa14.67□□□□□ -0.06
Trim23-201ENSMUST00000022225 Chl1P70232 1209 aa14.67□□□□□ -0.06
Trim23-201ENSMUST00000022225 Samd1D3YXK1 519 aa14.66□□□□□ -0.06
Trim23-201ENSMUST00000022225 Paxbp1P58501 919 aa14.66□□□□□ -0.06
Trim23-201ENSMUST00000022225 Lrrc8aQ80WG5 810 aa14.66□□□□□ -0.06
Trim23-201ENSMUST00000022225 Noc3lQ8VI84 807 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Trim23-201ENSMUST00000022225 NhsB1AV60 1647 aa14.66□□□□□ -0.06
Trim23-201ENSMUST00000022225 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa14.66□□□□□ -0.06
Trim23-201ENSMUST00000022225 Syt1P46096 421 aa14.66□□□□□ -0.06
Trim23-201ENSMUST00000022225 Fgd6Q69ZL1 1399 aa14.65□□□□□ -0.06
Trim23-201ENSMUST00000022225 Evi5lH3BKQ3 813 aa14.65□□□□□ -0.06
Trim23-201ENSMUST00000022225 EcsitQ9QZH6 435 aa14.65□□□□□ -0.06
Trim23-201ENSMUST00000022225 Fmnl2A2APV2 1086 aa14.65□□□□□ -0.06
Trim23-201ENSMUST00000022225 Gjb2Q00977 226 aa14.65□□□□□ -0.06
Trim23-201ENSMUST00000022225 Arid5bQ8BM75 1188 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Trim23-201ENSMUST00000022225 Tsen34Q8BMZ5 316 aa14.65□□□□□ -0.06
Trim23-201ENSMUST00000022225 Dnaaf2Q8BPI1 814 aa14.65□□□□□ -0.06
Trim23-201ENSMUST00000022225 Mad1l1Q9WTX8 717 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Trim23-201ENSMUST00000022225 Polr3gQ6NXY9 223 aa14.64□□□□□ -0.07
Trim23-201ENSMUST00000022225 Kif13aQ9EQW7 1749 aa14.64□□□□□ -0.07
Trim23-201ENSMUST00000022225 Casz1Q9CWL2 1761 aa14.64□□□□□ -0.07
Trim23-201ENSMUST00000022225 Rbm33Q9CXK9 1231 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Trim23-201ENSMUST00000022225 Ndufa8Q9DCJ5 172 aa14.64□□□□□ -0.07
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Trim23-201ENSMUST00000022225 Prex1Q69ZK0 1650 aa14.64□□□□□ -0.07
Trim23-201ENSMUST00000022225 Esyt1Q3U7R1 1092 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
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Trim23-201ENSMUST00000022225 Nphp1Q9QY53 687 aa14.63□□□□□ -0.07
Trim23-201ENSMUST00000022225 Rad50P70388 1312 aa14.63□□□□□ -0.07
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Trim23-201ENSMUST00000022225 Anp32eP97822 260 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Trim23-201ENSMUST00000022225 Lins1Q3U1D0 764 aa14.63□□□□□ -0.07
Trim23-201ENSMUST00000022225 Prdm2A2A7B5 1709 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Trim23-201ENSMUST00000022225 Spag5Q7TME2 1165 aa14.62□□□□□ -0.07
Trim23-201ENSMUST00000022225 Tomm22Q9CPQ3 142 aa14.62□□□□□ -0.07
Trim23-201ENSMUST00000022225 Cabp2Q9JLK4 216 aa14.62□□□□□ -0.07
Trim23-201ENSMUST00000022225 AW822073A0A0N4SUK1 652 aa14.62□□□□□ -0.07
Trim23-201ENSMUST00000022225 Spef2Q8C9J3 1734 aa14.62□□□□□ -0.07
Trim23-201ENSMUST00000022225 Atp10aO54827 1508 aa14.62□□□□□ -0.07
Trim23-201ENSMUST00000022225 Ppp1r15aP17564 657 aa14.62□□□□□ -0.07
Trim23-201ENSMUST00000022225 Kcnd1Q03719 651 aa14.62□□□□□ -0.07
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