RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF404Q494X3 552 aa20.69■□□□□ 0.9
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PTPRM-211ENST00000580170 CCDC54Q8NEL0 328 aa20.69■□□□□ 0.9
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PTPRM-211ENST00000580170 MAB21L2Q9Y586 359 aa20.69■□□□□ 0.9
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PTPRM-211ENST00000580170 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM248Q9NWD8 314 aa20.69■□□□□ 0.9
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PTPRM-211ENST00000580170 ZNF423Q2M1K9 1284 aa20.69■□□□□ 0.9
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PTPRM-211ENST00000580170 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
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PTPRM-211ENST00000580170 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
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PTPRM-211ENST00000580170 SH3D21A4FU49 640 aa20.67■□□□□ 0.9
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PTPRM-211ENST00000580170 WACQ9BTA9 647 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRM-211ENST00000580170 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa20.67■□□□□ 0.9
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