RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557428.1

PCNX1-215, Transcript of pecanex 1, humanhuman

TSL 4

Gene PCNX1, Length 541 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1-215ENST00000557428 MAGEC3Q8TD91 643 aa7.56□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 SLCO2A1Q92959 643 aa7.56□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 FAM136AQ96C01 138 aa7.56□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 PEX11GQ96HA9 241 aa7.56□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 PDLIM2Q96JY6 352 aa7.56□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 C19orf43Q9BQ61 176 aa7.56□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 MACROD1Q9BQ69 325 aa7.56□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 CARD6Q9BX69 1037 aa7.56□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 TSGA10Q9BZW7 698 aa7.56□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 LRRC40Q9H9A6 602 aa7.56□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 RASSF1Q9NS23 344 aa7.56□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 PNPLA3Q9NST1 481 aa7.56□□□□□ -1.2
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PCNX1-215ENST00000557428 SPATA7Q9P0W8 599 aa7.56□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa7.56□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 ANAPC5Q9UJX4 755 aa7.56□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 KLK4Q9Y5K2 254 aa7.56□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 MRFAP1Q9Y605 127 aa7.56□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 JMJD1CQ15652 2540 aa7.56□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 DNAJC13O75165 2243 aa7.56□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 ZNF407Q9C0G0 2248 aa7.56□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa7.55□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 FIGNL2A6NMB9 653 aa7.55□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 A6NNC1 897 aa7.55□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 ARHGEF33A8MVX0 844 aa7.55□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 PHF2O75151 1096 aa7.55□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 LY6G6DO95868 133 aa7.55□□□□□ -1.2
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PCNX1-215ENST00000557428 ACVR2AP27037 513 aa7.55□□□□□ -1.2
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PCNX1-215ENST00000557428 CCNFP41002 786 aa7.55□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 PRAMEP78395 509 aa7.55□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 PPP2R2BQ00005 443 aa7.55□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 SEMA3AQ14563 771 aa7.55□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 MEI1Q5TIA1 1274 aa7.55□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 ICE2Q659A1 982 aa7.55□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 PAOXQ6QHF9 649 aa7.55□□□□□ -1.2
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PCNX1-215ENST00000557428 BBS12Q6ZW61 710 aa7.55□□□□□ -1.2
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PCNX1-215ENST00000557428 SYCE1Q8N0S2 351 aa7.55□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 TMEM156Q8N614 296 aa7.55□□□□□ -1.2
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PCNX1-215ENST00000557428 OR4L1Q8NH43 312 aa7.55□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 SPATA3Q8NHX4 192 aa7.55□□□□□ -1.2
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PCNX1-215ENST00000557428 SMPDL3AQ92484 453 aa7.55□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 PANX3Q96QZ0 392 aa7.55□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 OR2A5Q96R48 311 aa7.55□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 ARNT2Q9HBZ2 717 aa7.55□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 ANKHQ9HCJ1 492 aa7.55□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 NEUROD4Q9HD90 331 aa7.55□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 ALKBH4Q9NXW9 302 aa7.55□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 GUCA1BQ9UMX6 200 aa7.55□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
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PCNX1-215ENST00000557428 CSPG4Q6UVK1 2322 aa7.54□□□□□ -1.2
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PCNX1-215ENST00000557428 MROH6A6NGR9 719 aa7.54□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 A8MUA0 341 aa7.54□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 FAM171A2A8MVW0 826 aa7.54□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 G3V3Y1 287 aa7.54□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 H0YIG0 161 aa7.54□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 ACOT7O00154 380 aa7.54□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 ZSCAN12O43309 604 aa7.54□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 ATE1O95260 518 aa7.54□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 NSA2O95478 260 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 CYC1P08574 325 aa7.54□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 GLI4P10075 376 aa7.54□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 TACR1P25103 407 aa7.54□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 HLCSP50747 726 aa7.54□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 MLF1P58340 268 aa7.54□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 PPIAP62937 165 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 HYAL2Q12891 473 aa7.54□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 FAM53BQ14153 422 aa7.54□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 TYSND1Q2T9J0 566 aa7.54□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 GXYLT1Q4G148 440 aa7.54□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa7.54□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 FLYWCH1Q4VC44 716 aa7.54□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 EMC4Q5J8M3 183 aa7.54□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 C11orf63Q6NUN7 778 aa7.54□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa7.54□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 ZNF227Q86WZ6 799 aa7.54□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 LIX1LQ8IVB5 337 aa7.54□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 KATNAL2Q8IYT4 538 aa7.54□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 LGI4Q8N135 537 aa7.54□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 OR13J1Q8NGT2 312 aa7.54□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 OR9A1PQ8NGU1 263 aa7.54□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 HMGCLL1Q8TB92 370 aa7.54□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 CREB3L4Q8TEY5 395 aa7.54□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 KRT35Q92764 455 aa7.54□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 MBD6Q96DN6 1003 aa7.54□□□□□ -1.2
PCNX1-215ENST00000557428 ARSGQ96EG1 525 aa7.54□□□□□ -1.2
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