RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518681.5

MIB2-231, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene MIB2, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-231	ENST00000518681	C6orf183	Q5T699	404 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	ZNF675	Q8TD23	568 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	SCRN2	Q96FV2	425 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	TSPAN6	O43657	245 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	TGFB1	P01137	390 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	HLA-F	P30511	346 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	TGM4	P49221	684 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	PPP5C	P53041	499 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	CTSC	P53634	463 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	SMARCB1	Q12824	385 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	18.18	■□□□□ 0.5	8e-8	■■■■□ 21.2
MIB2-231	ENST00000518681	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	DESI1	Q6ICB0	168 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	SLC35B4	Q969S0	331 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	MS4A12	Q9NXJ0	267 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681		A0A1W2PRU2	124 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	SEMG1	P04279	462 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	HBA1	P69905	142 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	SMU1	Q2TAY7	513 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	FAHD1	Q6P587	224 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	OR51B5	Q9H339	312 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	SMIM30	A4D0T7	59 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	SNPH	O15079	494 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	TRPC1	P48995	793 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	MTAP	Q13126	283 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	VOPP1	Q96AW1	172 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	CCL26	Q9Y258	94 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	KPNA5	O15131	536 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	UPK1B	O75841	260 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	SOX14	O95416	240 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	SYTL3	Q4VX76	610 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	IGSF21	Q96ID5	467 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	SPAST	Q9UBP0	616 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	RAB23	Q9ULC3	237 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	CTDSP2	O14595	271 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	ADORA3	P0DMS8	318 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	CKMT1A	P12532	417 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	CSNK1D	P48730	415 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	SPINT3	P49223	89 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	STARD3	Q14849	445 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	GAREM2	Q75VX8	874 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	ZNF605	Q86T29	641 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	C11orf74	Q86VG3	221 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681		H3BM21	787 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	COQ9	O75208	318 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	DNAJB5	O75953	348 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	C8G	P07360	202 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	PRIM2	P49643	509 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
MIB2-231	ENST00000518681	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		18.16	■□□□□ 0.5

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