RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512069.6

PDE4D-220, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4D, Length 536 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-220ENST00000512069 ACTN2P35609 894 aa3.95□□□□□ -1.78
PDE4D-220ENST00000512069 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP3.95□□□□□ -1.783e-6■■■■□ 21.1
PDE4D-220ENST00000512069 CD151P48509 253 aa3.95□□□□□ -1.78
PDE4D-220ENST00000512069 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
PDE4D-220ENST00000512069 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
PDE4D-220ENST00000512069 CCL14Q16627 93 aa3.95□□□□□ -1.78
PDE4D-220ENST00000512069 SPDYCQ5MJ68 293 aa3.95□□□□□ -1.78
PDE4D-220ENST00000512069 ELFN2Q5R3F8 820 aa3.95□□□□□ -1.78
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PDE4D-220ENST00000512069 KIRREL3Q8IZU9 778 aa3.95□□□□□ -1.78
PDE4D-220ENST00000512069 KBTBD8Q8NFY9 601 aa3.95□□□□□ -1.78
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PDE4D-220ENST00000512069 SSMEM1Q8WWF3 244 aa3.95□□□□□ -1.78
PDE4D-220ENST00000512069 RSPH1Q8WYR4 309 aa3.95□□□□□ -1.78
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PDE4D-220ENST00000512069 GCNAQ96QF7 691 aa3.95□□□□□ -1.78
PDE4D-220ENST00000512069 SYT11Q9BT88 431 aa3.95□□□□□ -1.78
PDE4D-220ENST00000512069 FUCA2Q9BTY2 467 aa3.95□□□□□ -1.78
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PDE4D-220ENST00000512069 IL17BQ9UHF5 180 aa3.95□□□□□ -1.78
PDE4D-220ENST00000512069 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
PDE4D-220ENST00000512069 DAPK2Q9UIK4 370 aa3.95□□□□□ -1.78
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PDE4D-220ENST00000512069 CHD7Q9P2D1 2997 aa3.95□□□□□ -1.78
PDE4D-220ENST00000512069 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
PDE4D-220ENST00000512069 C5orf42Q9H799 3197 aa3.94□□□□□ -1.78
PDE4D-220ENST00000512069 CHD9Q3L8U1 2897 aa3.94□□□□□ -1.78
PDE4D-220ENST00000512069 ACACBO00763 2458 aa3.94□□□□□ -1.78
PDE4D-220ENST00000512069 A8MV72 311 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
PDE4D-220ENST00000512069 IGHV2-70P01814 119 aa3.94□□□□□ -1.78
PDE4D-220ENST00000512069 LINGO3P0C6S8 592 aa3.94□□□□□ -1.78
PDE4D-220ENST00000512069 CASQ1P31415 396 aa3.94□□□□□ -1.78
PDE4D-220ENST00000512069 KRT71Q3SY84 523 aa3.94□□□□□ -1.78
PDE4D-220ENST00000512069 SYT14P1Q58G82 188 aa3.94□□□□□ -1.78
PDE4D-220ENST00000512069 XKR6Q5GH73 641 aa3.94□□□□□ -1.78
PDE4D-220ENST00000512069 XKR3Q5GH77 459 aa3.94□□□□□ -1.78
PDE4D-220ENST00000512069 GARNL3Q5VVW2 1013 aa3.94□□□□□ -1.78
PDE4D-220ENST00000512069 CFAP161Q6P656 301 aa3.94□□□□□ -1.78
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PDE4D-220ENST00000512069 METTL7BQ6UX53 244 aa3.94□□□□□ -1.78
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PDE4D-220ENST00000512069 HSCBQ8IWL3 235 aa3.94□□□□□ -1.78
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF440Q8IYI8 595 aa3.94□□□□□ -1.78
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PDE4D-220ENST00000512069 DBF4BQ8NFT6 615 aa3.94□□□□□ -1.78
PDE4D-220ENST00000512069 OR5AP2Q8NGF4 316 aa3.94□□□□□ -1.78
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PDE4D-220ENST00000512069 ATL1Q8WXF7 558 aa3.94□□□□□ -1.78
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PDE4D-220ENST00000512069 A0A1W2PPQ1 181 aa3.93□□□□□ -1.78
PDE4D-220ENST00000512069 ENO4A6NNW6 628 aa3.93□□□□□ -1.78
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PDE4D-220ENST00000512069 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
PDE4D-220ENST00000512069 SMIM18P0DKX4 95 aa3.93□□□□□ -1.78
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PDE4D-220ENST00000512069 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
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