RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504263.1

PCAT4-201, prostate cancer associated transcript 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCAT4, Length 2,091 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCAT4-201ENST00000504263 DUX4L5P0CJ88 424 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 DUX4L6P0CJ89 424 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 DUX4L7P0CJ90 424 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 CKBP12277 381 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 ANXA3P12429 323 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 LCP1P13796 627 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 ELNP15502 786 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 GPX3P22352 226 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 WARSP23381 471 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 KDELR1P24390 212 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 GADD45AP24522 165 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 PAX6P26367 422 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 LAP3P28838 519 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 PIGAP37287 484 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 CEACAM6P40199 344 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 CASP2P42575 452 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 MAP2K4P45985 399 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 GRIA4P48058 902 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 NOVP48745 357 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 GSK3BP49841 420 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 CLCN3P51790 818 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 HMGCS2P54868 508 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 RAG2P55895 527 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 ARPP19P56211 112 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 BACE1P56817 501 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 DCDP81605 110 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 PURAQ00577 322 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 ROR1Q01973 937 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 GPR17Q13304 367 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 COTL1Q14019 142 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 FGFBP1Q14512 234 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 TEAD4Q15561 434 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 STXBP2Q15833 593 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 PTPRNQ16849 979 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 MPEG1Q2M385 716 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 XKR3Q5GH77 459 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 TPGS2Q68CL5 300 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 SCYL2Q6P3W7 929 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 ERICH5Q6P6B1 374 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 FAM111BQ6SJ93 734 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 PAMR1Q6UXH9 720 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 HSDL2Q6YN16 418 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 FUNDC1Q8IVP5 155 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 NAXDQ8IW45 347 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 ABRAQ8N0Z2 381 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 NAGSQ8N159 534 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 OR52K1Q8NGK4 314 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 CLHC1Q8NHS4 586 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
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PCAT4-201ENST00000504263 GPR152Q8TDT2 470 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 CREB3L4Q8TEY5 395 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 STYXQ8WUJ0 223 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 CHTF18Q8WVB6 975 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 SLC5A11Q8WWX8 675 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 LPAR1Q92633 364 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 TMEM125Q96AQ2 219 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 OTULINQ96BN8 352 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 ARMC5Q96C12 935 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 LRRC58Q96CX6 371 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 MSLNLQ96KJ4 702 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 C7orf34Q96L11 122 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 TBATAQ96M53 351 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 CCDC115Q96NT0 180 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 NT5C1BQ96P26 610 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 SLC38A2Q96QD8 506 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 ZBTB18Q99592 522 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 PITX2Q99697 317 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 KCNJ15Q99712 375 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 SOSTQ9BQB4 213 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 OCSTAMPQ9BR26 566 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 C2orf88Q9BSF0 95 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 WDR18Q9BV38 432 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 GPR61Q9BZJ8 451 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 SDCBP2Q9H190 292 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 CHRDQ9H2X0 955 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 MAGIXQ9H6Y5 334 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 GORASP2Q9H8Y8 452 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 SLC28A3Q9HAS3 691 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 VAT1LQ9HCJ6 419 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 NIT2Q9NQR4 276 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 C19orf12Q9NSK7 152 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 SMPD4Q9NXE4 827 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 NDUFAF4Q9P032 175 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 DUX4Q9UBX2 424 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 SEC14L4Q9UDX3 406 aa3.4□□□□□ -1.87
PCAT4-201ENST00000504263 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa3.4□□□□□ -1.87
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