RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423339.2

CCDC82-202, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC82, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-202ENST00000423339 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 CABS1Q96KC9 395 aa2.74□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 RASL10BQ96S79 203 aa2.74□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 MID1IP1Q9NPA3 183 aa2.74□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 SLC52A3Q9NQ40 469 aa2.74□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 GPR173Q9NS66 373 aa2.74□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 IL36AQ9UHA7 158 aa2.74□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 SNX5Q9Y5X3 404 aa2.74□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 FYCO1Q9BQS8 1478 aa2.74□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 CEP162Q5TB80 1403 aa2.74□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa2.74□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 ACEP12821 1306 aa2.74□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 EPHB6O15197 1021 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 TTI1O43156 1089 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 SCO2O43819 266 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 KINO60870 393 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 NME6O75414 186 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 GLCEO94923 617 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 AMBPP02760 352 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 FAM157CP0CG43 387 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 DUTP33316 252 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 CDKN1AP38936 164 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 OR3A3P47888 321 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 CLDN17P56750 224 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 CETN1Q12798 172 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 EXT1Q16394 746 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 SLC39A12Q504Y0 691 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 TMEM270Q6UE05 265 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 LEKR1Q6ZMV7 388 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 SH2D5Q6ZV89 423 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 RAPH1Q70E73 1250 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 KCTD9Q7L273 389 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 SLC37A3Q8NCC5 494 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 KBTBD8Q8NFY9 601 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 OR7A2PQ8NGA2 310 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 OR2T11Q8NH01 316 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 SUSD6Q92537 303 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 FBXO17Q96EF6 278 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 C10orf90Q96M02 699 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 BTBD9Q96Q07 612 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 LPAR4Q99677 370 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 C17orf62Q9BQA9 187 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 SLC5A7Q9GZV3 580 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 RNF121Q9H920 327 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 C2CD2Q9Y426 696 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 C9orf84Q5VXU9 1444 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 MIA2Q96PC5 1412 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 YEATS2Q9ULM3 1422 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 STK36Q9NRP7 1315 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 PTPRMP28827 1452 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 TRIM64A6NGJ6 449 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 TRIM64BA6NI03 449 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 SLCO1B7G3V0H7 640 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 FPGTO14772 594 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 AP2A2O94973 939 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 YES1P07947 543 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 SP9P0CG40 484 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 PRSS56P0CW18 603 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 ALDH1B1P30837 517 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 SSTR1P30872 391 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 DNA2P51530 1060 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 KIAA1024LP59773 190 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 RPS6KA1Q15418 735 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF74Q16587 644 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 ARHGEF16Q5VV41 709 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 CCDC83Q8IWF9 413 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 LRTM2Q8N967 370 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 NAT8LQ8N9F0 302 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 SPC24Q8NBT2 197 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 KRT35Q92764 455 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 SCRT2Q9NQ03 307 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 PDRG1Q9NUG6 133 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 MIS18AQ9NYP9 233 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 SPG21Q9NZD8 308 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 TRPC4Q9UBN4 977 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 PRDM4Q9UKN5 801 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 GAB2Q9UQC2 676 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC82-202ENST00000423339 ITM2BQ9Y287 266 aa2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms