RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420377.6

PTPN22-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 22, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPN22, Length 2,726 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN22-202ENST00000420377 OR8G3PP0DMU2 310 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 MYBP10242 640 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 CKMT1AP12532 417 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 CBLP22681 906 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 PSMB6P28072 239 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 ADH6P28332 368 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 GCAP28676 217 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 GJB2P29033 226 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 FOXN2P32314 431 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 SERPINF1P36955 418 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 RAP1GAPP47736 663 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 CAMLGP49069 296 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 SLC11A2P49281 568 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 NAGLUP54802 743 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 ADPRHP54922 357 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 REEP5Q00765 189 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 BTKQ06187 659 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 RPA4Q13156 261 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 ILKQ13418 452 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 TNK1Q13470 666 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 TRIP10Q15642 601 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 TAB1Q15750 504 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 CALCRLQ16602 461 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 ARHGAP40Q5TG30 622 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 PRAMEF20Q5VT98 475 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 MEDAGQ5VYS4 303 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 RRAGAQ7L523 313 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 DEFB128Q7Z7B8 93 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 NLRX1Q86UT6 975 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 IQCHQ86VS3 1027 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 DHFR2Q86XF0 187 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 SCN4BQ8IWT1 228 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 FAM185AQ8N0U4 392 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 SLC39A11Q8N1S5 342 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 MINDY1Q8N5J2 469 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 WDSUB1Q8N9V3 476 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 TMEM35BQ8NCS4 154 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 OR10A7Q8NGE5 316 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 OR4C15Q8NGM1 316 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 CLEC4DQ8WXI8 215 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 NINJ1Q92982 152 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 ACDQ96AP0 544 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 MCUR1Q96AQ8 359 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 TMCO6Q96DC7 493 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 CNBD2Q96M20 576 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 LGMNQ99538 433 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 ZNF577Q9BSK1 485 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 PDCD10Q9BUL8 212 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 NT5C1AQ9BXI3 368 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 EXO5Q9H790 373 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 BRF2Q9HAW0 419 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 MKNK2Q9HBH9 465 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 ERVK-5Q9HDB9 667 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 GPRC5CQ9NQ84 441 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 DNAJC28Q9NX36 388 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 TMEM216Q9P0N5 145 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 EBF1Q9UH73 591 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 PPM1HQ9ULR3 514 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 CHKBQ9Y259 395 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 HYOU1Q9Y4L1 999 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 ALG5Q9Y673 324 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 MROH6A6NGR9 719 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 TUBAL3A6NHL2 446 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 FAM170BA6NMN3 283 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 MPTX1A8MV57 137 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 C2CD4DB7Z1M9 353 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 H7C2Y5 167 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 M0QZ92 97 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 FCHO1O14526 889 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 ADAM12O43184 909 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 CHP2O43745 196 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 ATE1O95260 518 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 MLYCDO95822 493 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 GYPCP04921 128 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 LIPFP07098 398 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 ACSM4P0C7M7 580 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 IL7P13232 177 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 ZNF250P15622 560 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 IL12AP29459 219 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 RBX1P62877 108 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-202ENST00000420377 NOMO3P69849 1222 aa3.99□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms