RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390917.1

RNU6-604P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 604, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-604P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-604P-201ENST00000390917 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 UBASH3AP57075 661 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 CD47Q08722 323 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 TAF10Q12962 218 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 PTP4A2Q12974 167 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 GCKRQ14397 625 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 ODF4Q2M2E3 257 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 C17orf58Q2M2W7 97 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 COX19Q49B96 90 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 RHBDD2Q6NTF9 364 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 ZNF429Q86V71 674 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 GALNT13Q8IUC8 556 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 FTMTQ8N4E7 242 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 CARNMT1Q8N4J0 409 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 AFAP1Q8N556 730 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 ANKRD42Q8N9B4 389 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 IL17REQ8NFR9 667 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 AFG1LQ8WV93 481 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 MYDGFQ969H8 173 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 MARC2Q969Z3 335 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 WDR41Q9HAD4 459 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 HHATLQ9HCP6 504 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 STARD7Q9NQZ5 370 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 CHST12Q9NRB3 414 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 PIGVQ9NUD9 493 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 SLC2A8Q9NY64 477 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 FBXW11Q9UKB1 542 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 FER1L5A0AVI2 2057 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 TTC36A6NLP5 189 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 ATP2A1O14983 1001 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 PLPP2O43688 288 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 SLC24A1O60721 1099 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 TACC1O75410 805 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 JRKO75564 520 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 IGHV4-34P06331 123 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 C4BPBP20851 252 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 NPY1RP25929 384 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 GDI1P31150 447 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 TGFBR1P36897 503 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 PRCPP42785 496 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 GPD2P43304 727 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 NT5C2P49902 561 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 NEK2P51955 445 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 PRKG2Q13237 762 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 ASAH1Q13510 395 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 NAA25Q14CX7 972 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 MEP1AQ16819 746 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 PPP1R3AQ16821 1122 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 TMEM81Q6P7N7 255 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 UNC5DQ6UXZ4 953 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 NUDT13Q86X67 352 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 ZNF683Q8IZ20 524 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 BBS1Q8NFJ9 593 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 OR11H4Q8NGC9 324 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 RAET1EQ8TD07 263 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 CCDC107Q8WV48 283 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 RDH5Q92781 318 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 RILPL2Q969X0 211 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 HOOK2Q96ED9 719 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 KIF1BPQ96EK5 621 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 FAM20AQ96MK3 541 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 RAD9AQ99638 391 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 HSD17B14Q9BPX1 270 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 FAM167BQ9BTA0 163 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 MROH8Q9H579 483 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 MTMR10Q9NXD2 777 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 ALKBH4Q9NXW9 302 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 DAPK2Q9UIK4 370 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 A4GNTQ9UNA3 340 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 DUSP12Q9UNI6 340 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 ZNF148Q9UQR1 794 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 CEP83Q9Y592 693 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 PARD3Q8TEW0 1356 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 VWDEQ8N2E2 1590 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 A0A1W2PNN7 141 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 E2F8A0AVK6 867 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-604P-201ENST00000390917 FRMD3A2A2Y4 597 aa-0.9□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms