RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
NISCH-201ENST00000345716 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
NISCH-201ENST00000345716 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa20.03■□□□□ 0.8
NISCH-201ENST00000345716 CKLFQ9UBR5 152 aa20.03■□□□□ 0.8
NISCH-201ENST00000345716 SCN1BQ07699 218 aa20.03■□□□□ 0.8
NISCH-201ENST00000345716 BICRALQ6AI39 1079 aa20.03■□□□□ 0.8
NISCH-201ENST00000345716 CRTC1Q6UUV9 634 aa20.03■□□□□ 0.8
NISCH-201ENST00000345716 RAB43Q86YS6 212 aa20.03■□□□□ 0.8
NISCH-201ENST00000345716 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
NISCH-201ENST00000345716 RAB8BQ92930 207 aa20.03■□□□□ 0.8
NISCH-201ENST00000345716 PTERQ96BW5 349 aa20.03■□□□□ 0.8
NISCH-201ENST00000345716 DHFRP00374 187 aa20.03■□□□□ 0.8
NISCH-201ENST00000345716 DOC2AQ14183 400 aa20.03■□□□□ 0.8
NISCH-201ENST00000345716 LCN1P1Q5VSP4 162 aa20.03■□□□□ 0.8
NISCH-201ENST00000345716 LIN54Q6MZP7 749 aa20.03■□□□□ 0.8
NISCH-201ENST00000345716 REEP3Q6NUK4 255 aa20.03■□□□□ 0.8
NISCH-201ENST00000345716 TCEAL8Q8IYN2 117 aa20.03■□□□□ 0.8
NISCH-201ENST00000345716 SCRN2Q96FV2 425 aa20.03■□□□□ 0.8
NISCH-201ENST00000345716 ING4Q9UNL4 249 aa20.03■□□□□ 0.8
NISCH-201ENST00000345716 GLOD5A6NK44 160 aa20.03■□□□□ 0.8
NISCH-201ENST00000345716 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP20.03■□□□□ 0.8
NISCH-201ENST00000345716 MNDAP41218 407 aa20.03■□□□□ 0.8
NISCH-201ENST00000345716 C5orf22Q49AR2 442 aa20.03■□□□□ 0.8
NISCH-201ENST00000345716 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
NISCH-201ENST00000345716 DRGXA6NNA5 263 aa20.02■□□□□ 0.8
NISCH-201ENST00000345716 CTSAP10619 480 aa20.02■□□□□ 0.8
NISCH-201ENST00000345716 MASP1P48740 699 aa20.02■□□□□ 0.8
NISCH-201ENST00000345716 BNIP3Q12983 259 aa20.02■□□□□ 0.8
NISCH-201ENST00000345716 CARTPTQ16568 116 aa20.02■□□□□ 0.8
NISCH-201ENST00000345716 TAZQ16635 292 aa20.02■□□□□ 0.8
NISCH-201ENST00000345716 GRHL3Q8TE85 626 aa20.02■□□□□ 0.8
NISCH-201ENST00000345716 TAPBPLQ9BX59 468 aa20.02■□□□□ 0.8
NISCH-201ENST00000345716 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
NISCH-201ENST00000345716 SRCP12931 536 aa20.02■□□□□ 0.8
NISCH-201ENST00000345716 MATN1P21941 496 aa20.02■□□□□ 0.8
NISCH-201ENST00000345716 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP20.02■□□□□ 0.81e-8■■■■□ 24.2
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NISCH-201ENST00000345716 BADQ92934 168 aa20.02■□□□□ 0.8
NISCH-201ENST00000345716 CXCL16Q9H2A7 254 aa20.02■□□□□ 0.8
NISCH-201ENST00000345716 ING3Q9NXR8 418 aa20.02■□□□□ 0.8
NISCH-201ENST00000345716 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
NISCH-201ENST00000345716 TBPL1P62380 186 aa20.02■□□□□ 0.8
NISCH-201ENST00000345716 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa20.02■□□□□ 0.8
NISCH-201ENST00000345716 CGB2Q6NT52 195 aa20.02■□□□□ 0.8
NISCH-201ENST00000345716 TBX5Q99593 518 aa20.02■□□□□ 0.8
NISCH-201ENST00000345716 TRPV5Q9NQA5 729 aa20.02■□□□□ 0.8
NISCH-201ENST00000345716 A0A1W2PP55 124 aa20.02■□□□□ 0.79
NISCH-201ENST00000345716 HSD3B1P14060 373 aa20.02■□□□□ 0.79
NISCH-201ENST00000345716 HSD3B2P26439 372 aa20.02■□□□□ 0.79
NISCH-201ENST00000345716 CLCN7P51798 805 aa20.02■□□□□ 0.79
NISCH-201ENST00000345716 ERVPABLB-1P60509 514 aa20.02■□□□□ 0.79
NISCH-201ENST00000345716 ZNF423Q2M1K9 1284 aa20.02■□□□□ 0.79
NISCH-201ENST00000345716 NRSN1Q8IZ57 195 aa20.02■□□□□ 0.79
NISCH-201ENST00000345716 CHST14Q8NCH0 376 aa20.02■□□□□ 0.79
NISCH-201ENST00000345716 CRELD1Q96HD1 420 aa20.02■□□□□ 0.79
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NISCH-201ENST00000345716 HTR6P50406 440 aa20.01■□□□□ 0.79
NISCH-201ENST00000345716 VMACQ2NL98 169 aa20.01■□□□□ 0.79
NISCH-201ENST00000345716 SORT1Q99523 831 aa20.01■□□□□ 0.79
NISCH-201ENST00000345716 IL17CQ9P0M4 197 aa20.01■□□□□ 0.79
NISCH-201ENST00000345716 SNAP29O95721 258 aa20.01■□□□□ 0.79
NISCH-201ENST00000345716 SLC6A4P31645 630 aa20.01■□□□□ 0.79
NISCH-201ENST00000345716 OR1E2P47887 323 aa20.01■□□□□ 0.79
NISCH-201ENST00000345716 OR4D2P58180 307 aa20.01■□□□□ 0.79
NISCH-201ENST00000345716 LINC00471Q8N535 108 aa20.01■□□□□ 0.79
NISCH-201ENST00000345716 GPR150Q8NGU9 434 aa20.01■□□□□ 0.79
NISCH-201ENST00000345716 KLHL6Q8WZ60 621 aa20.01■□□□□ 0.79
NISCH-201ENST00000345716 IL17FQ96PD4 163 aa20.01■□□□□ 0.79
NISCH-201ENST00000345716 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
NISCH-201ENST00000345716 COMMD9Q9P000 198 aa20.01■□□□□ 0.79
NISCH-201ENST00000345716 RHCGQ9UBD6 479 aa20.01■□□□□ 0.79
NISCH-201ENST00000345716 MYH7BA7E2Y1 1941 aa20.01■□□□□ 0.79
NISCH-201ENST00000345716 A0A0U1RQS6 177 aa20.01■□□□□ 0.79
NISCH-201ENST00000345716 T-ENOLP0DO92 83 aa20.01■□□□□ 0.79
NISCH-201ENST00000345716 ZNF12P17014 697 aa20.01■□□□□ 0.79
NISCH-201ENST00000345716 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
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NISCH-201ENST00000345716 PIK3R3Q92569 461 aa20.01■□□□□ 0.79
NISCH-201ENST00000345716 DGAT2Q96PD7 388 aa20.01■□□□□ 0.79
NISCH-201ENST00000345716 TAS2R9Q9NYW1 312 aa20.01■□□□□ 0.79
NISCH-201ENST00000345716 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa20.01■□□□□ 0.79
NISCH-201ENST00000345716 KLHL24Q6TFL4 600 aa20.01■□□□□ 0.79
NISCH-201ENST00000345716 VEGFDO43915 354 aa20■□□□□ 0.79
NISCH-201ENST00000345716 REM1O75628 298 aa20■□□□□ 0.79
NISCH-201ENST00000345716 AHCYP23526 432 aa20■□□□□ 0.79
NISCH-201ENST00000345716 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
NISCH-201ENST00000345716 SMSP52788 366 aa20■□□□□ 0.79
NISCH-201ENST00000345716 DMPKQ09013 629 aa20■□□□□ 0.79
NISCH-201ENST00000345716 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
NISCH-201ENST00000345716 PIGGQ5H8A4 983 aa20■□□□□ 0.79
NISCH-201ENST00000345716 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa20■□□□□ 0.79
NISCH-201ENST00000345716 ZNF773Q6PK81 442 aa20■□□□□ 0.79
NISCH-201ENST00000345716 OR6K6Q8NGW6 343 aa20■□□□□ 0.79
NISCH-201ENST00000345716 P2RY13Q9BPV8 354 aa20■□□□□ 0.79
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