RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 SPINT3P49223 89 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 BLMHQ13867 455 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 REEP3Q6NUK4 255 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 DEFB119Q8N690 84 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 OR52E4Q8NGH9 312 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 SORCS1Q8WY21 1168 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ING3Q9NXR8 418 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A1W2PQ72 361 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 PCDHGA12O60330 932 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 CA3P07451 260 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 TACSTD2P09758 323 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 GMFBP60983 142 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 SNTA1Q13424 505 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 NRROSQ86YC3 692 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 CHST4Q8NCG5 386 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 SPATA9Q9BWV2 254 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 XKR8Q9H6D3 395 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 KLRF1Q9NZS2 232 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 PIAS3Q9Y6X2 628 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 TLR4O00206 839 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 BTN3A3O00478 584 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 LINGO3P0C6S8 592 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 C8orf89P0DMQ9 161 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 MATN1P21941 496 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 CD70P32970 193 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 CBX5P45973 191 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 RABL3Q5HYI8 236 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 TTC9BQ8N6N2 239 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 GPR174Q9BXC1 333 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 MCCC2Q9HCC0 563 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 PDCD5O14737 125 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 BMP8BP34820 402 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 IL18R1Q13478 541 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 SCD5Q86SK9 330 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ASPGQ86U10 573 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 C7orf57Q8NEG2 295 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 KLHL6Q8WZ60 621 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 IGLON5A6NGN9 336 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM170BA6NMN3 283 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNJ13O60928 360 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 HYAL2Q12891 473 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 HSH2DQ96JZ2 352 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM74Q96NL1 305 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 TOX2Q96NM4 488 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 PLGP00747 810 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 GLDCP23378 1020 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 SMCO1Q147U7 214 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP15.78■□□□□ 0.125e-7■■■■■ 35.6
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM126BQ8IUX1 230 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 KLHL36Q8N4N3 616 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 UCK2Q9BZX2 261 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 PIGUQ9H490 435 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 PRODH2Q9UF12 536 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 APBB3O95704 486 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 FDXRP22570 491 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 PDX1P52945 283 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 DIO3P55073 304 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 RANBP10Q6VN20 620 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 OR5P2Q8WZ92 322 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 TFECO14948 347 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNC1P48547 511 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ARSDP51689 593 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNC4Q03721 635 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 SCN1BQ07699 218 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ZFAND4Q86XD8 727 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 SCML4Q8N228 414 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 BIRC7Q96CA5 298 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNC2Q96PR1 638 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 TAS2R9Q9NYW1 312 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 GIMAP2Q9UG22 337 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 C8BP07358 591 aa15.77■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 JUPP14923 745 aa15.77■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 CAMK1Q14012 370 aa15.77■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP15.77■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 TBC1D25Q3MII6 688 aa15.77■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 MARCH8Q5T0T0 291 aa15.77■□□□□ 0.11
SH3BP4-201ENST00000344528 RNF220Q5VTB9 566 aa15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.5 ms