RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343017.11

SNX18-202, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

BASIC

Gene SNX18, Length 3,140 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-202ENST00000343017 FAM171BQ6P995 826 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 ZNF367Q7RTV3 350 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 TRIM46Q7Z4K8 759 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 KCNJ9Q92806 393 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 CMAHPQ9Y471 501 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 TMEM229AB2RXF0 380 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 PLK4O00444 970 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 PRAMEF12O95522 483 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 POMCP01189 267 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 ALPPP05187 535 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 TSPAN19P0C672 248 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 TRAPPC2P0DI81 140 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 TRAPPC2BP0DI82 140 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 ENPP1P22413 925 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 HTR7P34969 479 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 FEN1P39748 380 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 TTPAP49638 278 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 SELENOMQ8WWX9 145 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 PEX13Q92968 403 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 CRELD1Q96HD1 420 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 AP3M1Q9Y2T2 418 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 CIB4A0PJX0 185 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 STX7O15400 261 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 AP2A2O94973 939 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 SRCP12931 536 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 ALAS2P22557 587 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 MAN2A2P49641 1150 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 MAPK12P53778 367 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 ASAH1Q13510 395 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 DSC3Q14574 896 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 GPR19Q15760 415 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 TTLL9Q3SXZ7 439 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 MLIPQ5VWP3 458 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 C19orf48Q6RUI8 117 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 PLEKHH3Q7Z736 793 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 SERPINA11Q86U17 422 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 SLC34A3Q8N130 599 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 LGI4Q8N135 537 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 FBXL6Q8N531 539 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 OR8H1Q8NGG4 311 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 C1orf74Q96LT6 269 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 TINF2Q9BSI4 451 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 CD244Q9BZW8 370 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 NDUFAF4Q9P032 175 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 RHCGQ9UBD6 479 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 GBF1Q92538 1859 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 FAM227AF5H4B4 570 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 TNFRSF10BO14763 440 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 PCDH17O14917 1159 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 LPOP22079 712 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 APEX1P27695 318 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 SPIBQ01892 262 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 RUNX1T1Q06455 604 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 SPRYD7Q5W111 196 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 IDO2Q6ZQW0 420 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 TIGD4Q8IY51 512 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 SERPINB11Q96P15 392 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 B3GNT4Q9C0J1 378 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 C12orf4Q9NQ89 552 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 EVA1BQ9NVM1 165 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 MCUBQ9NWR8 336 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 NLKQ9UBE8 527 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 DHRS7Q9Y394 339 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 DOCK3Q8IZD9 2030 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 WDR90Q96KV7 1748 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 SUV39H1O43463 412 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 PRAMEF11O60813 436 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 EPOP01588 193 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 KIR3DL1P43629 444 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 CDH18Q13634 790 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 EPYCQ99645 322 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 TAPBPLQ9BX59 468 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 GALNT9Q9HCQ5 603 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 MYCP01106 439 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 EVI2BP34910 448 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 CRYBB2P43320 205 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 UBE3AQ05086 875 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 LIPKQ5VXJ0 399 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 PLET1Q6UQ28 207 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 PTCHD4Q6ZW05 846 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 BBS7Q8IWZ6 715 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX18-202ENST00000343017 PMEPA1Q969W9 287 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms