RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 CDH13P55290 713 aa25.47■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 RBBP7Q16576 425 aa25.47■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa25.47■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 CREB3L4Q8TEY5 395 aa25.47■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 MACROD1Q9BQ69 325 aa25.47■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 CROTQ9UKG9 612 aa25.47■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 C9J4A7 227 aa25.46■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 STATHP02808 62 aa25.46■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 RAB40ALP0C0E4 278 aa25.46■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 DLSTP36957 453 aa25.46■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 UCNP55089 124 aa25.46■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 RPS15P62841 145 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 CFAP157Q5JU67 520 aa25.46■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 LIPMQ5VYY2 423 aa25.46■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP25.46■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 CCNYL1Q8N7R7 359 aa25.46■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 KCT2Q8NC54 265 aa25.46■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 OR52B6Q8NGF0 335 aa25.46■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 CT55Q8WUE5 264 aa25.46■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 MOCOSQ96EN8 888 aa25.46■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF304Q9HCX3 659 aa25.46■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 RNF11Q9Y3C5 154 aa25.46■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa25.46■■□□□ 1.67
CRIP1-201ENST00000330233 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 H0YIV9 168 aa25.45■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 AGPSO00116 658 aa25.45■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 TM9SF1O15321 606 aa25.45■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP25.45■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 TRIM13O60858 407 aa25.45■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 AVPR1BP47901 424 aa25.45■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 NAGLUP54802 743 aa25.45■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 CYP4F2P78329 520 aa25.45■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 TLE3Q04726 772 aa25.45■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 HERC3Q15034 1050 aa25.45■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 LCN10Q6JVE6 187 aa25.45■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 NIPAL1Q6NVV3 410 aa25.45■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 OR7G3Q8NG95 312 aa25.45■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 TRPC4APQ8TEL6 797 aa25.45■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 SLC6A16Q9GZN6 736 aa25.45■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 KCNK9Q9NPC2 374 aa25.45■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa25.45■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 TERTO14746 1132 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 MED26O95402 600 aa25.44■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 SKP1P63208 163 aa25.44■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 TRAF3Q13114 568 aa25.44■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 DNASE1L3Q13609 305 aa25.44■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 PCLAFQ15004 111 aa25.44■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP25.44■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 GGTA1PQ4G0N0 100 aa25.44■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 ABHD13Q7L211 337 aa25.44■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 VASH2Q86V25 355 aa25.44■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 C10orf107Q8IVU9 208 aa25.44■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 CCT6BQ92526 530 aa25.44■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 COL26A1Q96A83 441 aa25.44■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 ANKHQ9HCJ1 492 aa25.44■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 PRM3Q9NNZ6 103 aa25.44■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 H0YIG0 161 aa25.43■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 FOXS1O43638 330 aa25.43■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 ZWINTO95229 277 aa25.43■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 NSA2O95478 260 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 ALBP02768 609 aa25.43■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 PCNAP12004 261 aa25.43■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 LIFP15018 202 aa25.43■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 PIK3CBP42338 1070 aa25.43■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 PHEXP78562 749 aa25.43■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 HYAL2Q12891 473 aa25.43■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 ST3GAL2Q16842 350 aa25.43■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 AGBL2Q5U5Z8 902 aa25.43■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 OVCH1Q7RTY7 1134 aa25.43■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 OR4F6Q8NGB9 312 aa25.43■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 CDK15Q96Q40 435 aa25.43■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF382Q96SR6 550 aa25.43■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 GSTO2Q9H4Y5 243 aa25.43■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 UQCRHLA0A096LP55 91 aa25.42■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 LRIT2A6NDA9 550 aa25.42■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 H3BQF6 201 aa25.42■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 I3L1I5 382 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 CAPN1P07384 714 aa25.42■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 UQCRHP07919 91 aa25.42■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 TSPAN8P19075 237 aa25.42■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 ITPKBP27987 946 aa25.42■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 ALDH3A1P30838 453 aa25.42■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 ETV4P43268 484 aa25.42■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 OR1D4P47884 311 aa25.42■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 PKNOX1P55347 436 aa25.42■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 LCP2Q13094 533 aa25.42■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
CRIP1-201ENST00000330233 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms