RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323081.12

SPNS1-202, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SPNS1, Length 2,102 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-202ENST00000323081 SAP18O00422 153 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 BCKDKO14874 412 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 POP7O75817 140 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 TGFB1P01137 390 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 GAB1Q13480 694 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 TUBA3CQ13748 450 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 VEZF1Q14119 521 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 RGNQ15493 299 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 FGD3Q5JSP0 725 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 LAIR2Q6ISS4 152 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 ZNF765Q7L2R6 523 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 HORMAD1Q86X24 394 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 PIK3C3Q8NEB9 887 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 OR4A15Q8NGL6 344 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 GIPC3Q8TF64 312 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 FGF13Q92913 245 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 SMARCD2Q92925 531 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 TPD52L3Q96J77 140 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 EFCAB11Q9BUY7 163 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 SGPP1Q9BX95 441 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 TMEM245Q9H330 911 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 PCM1Q15154 2024 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 PIPSLA2A3N6 862 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 CCNA2P20248 432 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 GSTM2P28161 218 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 RYKP34925 604 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 C21orf59P57076 290 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 TAP2Q03519 686 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 PIGFQ07326 219 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 GPM6BQ13491 265 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 NFE2L1Q14494 772 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 MOGQ16653 247 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 PAGE2BQ5JRK9 111 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP16.94■□□□□ 0.33e-6■■■■□ 24.5
SPNS1-202ENST00000323081 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 GALNT18Q6P9A2 607 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 COMMD6Q7Z4G1 85 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 ZFP90Q8TF47 636 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 MAL2Q969L2 176 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 WDR34Q96EX3 536 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 MAGED4Q96JG8 741 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 RIBC2Q9H4K1 309 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 VPS4AQ9UN37 437 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 CORO2BQ9UQ03 480 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 UNC80Q8N2C7 3258 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 SEC14L2O76054 403 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 PAPLNO95428 1278 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 ITGAMP11215 1152 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 CYP4B1P13584 511 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 ZNF12P17014 697 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 PPIBP23284 216 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 DAPP51397 102 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 MAPK10P53779 464 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 GABARAPL2P60520 117 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 IL5RAQ01344 420 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 ZNF763Q0D2J5 394 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 NFATC3Q12968 1075 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 IL18R1Q13478 541 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 RAPSNQ13702 412 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 ZNF385BQ569K4 471 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 ARMCX6Q7L4S7 300 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 LAS2Q8IYD9 372 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 OR4K1Q8NGD4 311 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 SLC5A11Q8WWX8 675 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 PPP1R16AQ96I34 528 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 SPATA9Q9BWV2 254 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 LHPPQ9H008 270 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 CHST8Q9H2A9 424 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 OR51B5Q9H339 312 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 PALMDQ9NP74 551 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 ITM2CQ9NQX7 267 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 DYRK4Q9NR20 520 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 PTGES3LE9PB15 166 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 SLC1A7O00341 560 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 HTR1AP08908 422 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 INHBBP09529 407 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 FPR1P21462 350 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 AQP1P29972 269 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 CCR3P51677 355 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 DPTQ07507 201 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
SPNS1-202ENST00000323081 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms