RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 IL1RL2Q9HB29 575 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 RDH14Q9HBH5 336 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 FZD3Q9NPG1 666 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 RAD18Q9NS91 495 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 KCTD5Q9NXV2 234 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 NLGN3Q9NZ94 848 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 WWOXQ9NZC7 414 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 PKD2L2Q9NZM6 624 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 IL17CQ9P0M4 197 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 OPTCQ9UBM4 332 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 LHX3Q9UBR4 397 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 CRLS1Q9UJA2 301 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 SCML1Q9UN30 329 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 BTRCQ9Y297 605 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 OARD1Q9Y530 152 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 CSMD1Q96PZ7 3565 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 UNC13CQ8NB66 2214 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC187A0A096LP49 1063 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 H3BNH8 94 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 KPNA5O15131 536 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC31A1O15431 190 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 CLOCKO15516 846 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 TIPRLO75663 272 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 OR4F21O95013 312 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 RASAL1O95294 804 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 PGM3O95394 542 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 KRT6AP02538 564 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 KRT6BP04259 564 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 ANXA6P08133 673 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 RNF224P0DH78 156 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 ALPPL2P10696 532 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 CDH1P12830 882 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP6V1B1P15313 513 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP6V1B2P21281 511 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 MYF6P23409 242 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 JAK1P23458 1154 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 DRD3P35462 400 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 SPAM1P38567 509 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 CASRP41180 1078 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 CSKP41240 450 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 CASP2P42575 452 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 MAP2K3P46734 347 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 RGRP47804 291 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 UQCRFS1P47985 274 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 KRT6CP48668 564 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 CLCN7P51798 805 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 NUP107P57740 925 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 ST8SIA6P61647 398 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 MYBPC1Q00872 1141 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 APOFQ13790 326 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 PTPRCAPQ14761 206 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP6AP1Q15904 470 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 NRF1Q16656 503 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 CYP51A1Q16850 503 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 NADK2Q4G0N4 442 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 MANEAQ5SRI9 462 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 MPP7Q5T2T1 576 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 CYHR1Q6ZMK1 362 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 GPR141Q7Z602 305 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 SPRED1Q7Z699 444 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 AMIGO2Q86SJ2 522 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 SATL1Q86VE3 508 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 IQCHQ86VS3 1027 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 SERPINA9Q86WD7 417 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 CARM1Q86X55 608 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 SPPL2CQ8IUH8 684 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 CPNE9Q8IYJ1 553 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 ZBTB2Q8N680 514 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 CDYL2Q8N8U2 506 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 GALNT6Q8NCL4 622 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 OR13H1Q8NG92 308 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 OR8J3Q8NGG0 315 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 UBTD2Q8WUN7 234 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 LZICQ8WZA0 190 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 VPS33AQ96AX1 596 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 SLCO4A1Q96BD0 722 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 NRBF2Q96F24 287 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 EXOC2Q96KP1 924 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 MRGPRX3Q96LB0 322 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 RDH12Q96NR8 316 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNA7Q96RP8 456 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM129BQ96TA1 746 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 CIB1Q99828 191 aa6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms