RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261407.8

LPCAT3-201, Transcript of lysophosphatidylcholine acyltransferase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LPCAT3, Length 2,268 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT3-201ENST00000261407 CCDC81Q6ZN84 652 aa18.49■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 CROCCP3Q8IVE0 287 aa18.49■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 POF1BQ8WVV4 589 aa18.49■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 COQ8BQ96D53 544 aa18.49■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 PLEKHA8Q96JA3 519 aa18.49■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 KRT84Q9NSB2 600 aa18.49■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 KIF17Q9P2E2 1029 aa18.49■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 TBC1D14Q9P2M4 693 aa18.49■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 LILRB5O75023 590 aa18.49■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 ITIH1P19827 911 aa18.49■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 MASP1P48740 699 aa18.49■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 C21orf59P57076 290 aa18.49■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 C21orf58P58505 322 aa18.49■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 SLC35A2P78381 396 aa18.49■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 IL18R1Q13478 541 aa18.49■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 DGCR6Q14129 220 aa18.49■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 MPEG1Q2M385 716 aa18.49■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 MED27Q6P2C8 311 aa18.49■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 NLRP8Q86W28 1048 aa18.49■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 ZNF547Q8IVP9 402 aa18.49■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 OR5AK3PQ8NH89 298 aa18.49■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 GIPC3Q8TF64 312 aa18.49■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 RSPRY1Q96DX4 576 aa18.49■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 MAGED4Q96JG8 741 aa18.49■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 FOPNLQ96NB1 174 aa18.49■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 IL17FQ96PD4 163 aa18.49■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 REEP1Q9H902 201 aa18.49■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 ENPP5Q9UJA9 477 aa18.49■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 PLAGL1Q9UM63 463 aa18.49■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 M0QX08 132 aa18.48■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 TOR1BO14657 336 aa18.48■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 JRKO75564 520 aa18.48■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 C6orf47O95873 294 aa18.48■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 CYP17A1P05093 508 aa18.48■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 RRM2P31350 389 aa18.48■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 PSMD7P51665 324 aa18.48■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 VEZF1Q14119 521 aa18.48■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 MOGQ16653 247 aa18.48■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 PRSS36Q5K4E3 855 aa18.48■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 ERAP2Q6P179 960 aa18.48■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 COMMD6Q7Z4G1 85 aa18.48■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 BTLAQ7Z6A9 289 aa18.48■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 FAM124AQ86V42 546 aa18.48■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 OR52J3Q8NH60 311 aa18.48■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 ZNF566Q969W8 418 aa18.48■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 DTD2Q96FN9 168 aa18.48■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 RAD21L1Q9H4I0 556 aa18.48■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 BTNL2Q9UIR0 455 aa18.48■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 TESMINQ9Y4I5 508 aa18.48■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 SUV39H1O43463 412 aa18.48■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 PCDHGA12O60330 932 aa18.48■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 MMP20O60882 483 aa18.48■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 VIPR2P41587 438 aa18.48■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 SLC6A11P48066 632 aa18.48■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 ITGA1P56199 1179 aa18.48■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 RPP38P78345 283 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 ZNF33BQ06732 778 aa18.48■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 KEAP1Q14145 624 aa18.48■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 NFE2L1Q14494 772 aa18.48■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 TBC1D25Q3MII6 688 aa18.48■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 Q6ZNX1 250 aa18.48■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 ZNF540Q8NDQ6 660 aa18.48■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 COQ10AQ96MF6 247 aa18.48■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa18.48■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 DUSP21Q9H596 190 aa18.48■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 TRIM39Q9HCM9 518 aa18.48■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 DKK3Q9UBP4 350 aa18.48■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 IRAK3Q9Y616 596 aa18.48■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 LRRK1Q38SD2 2015 aa18.48■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 PRAMEF25A6NGN4 478 aa18.47■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 QSOX1O00391 747 aa18.47■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 CLPXO76031 633 aa18.47■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 FADS2O95864 444 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 VIPP01282 170 aa18.47■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 MT-ND2P03891 347 aa18.47■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 HSD3B1P14060 373 aa18.47■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP18.47■□□□□ 0.551e-5■■■□□ 17.8
LPCAT3-201ENST00000261407 HSD3B2P26439 372 aa18.47■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 ASMTP46597 345 aa18.47■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 SPIN4Q56A73 249 aa18.47■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 GPR153Q6NV75 609 aa18.47■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 VPS37AQ8NEZ2 397 aa18.47■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 ABHD11Q8NFV4 315 aa18.47■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP18.47■□□□□ 0.555e-8■■■□□ 16.6
LPCAT3-201ENST00000261407 SPPL2AQ8TCT8 520 aa18.47■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 BORCS5Q969J3 196 aa18.47■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 ARRDC3Q96B67 414 aa18.47■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 KCNC2Q96PR1 638 aa18.47■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa18.47■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 RLIMQ9NVW2 624 aa18.47■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 MARK1Q9P0L2 795 aa18.47■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 USP34Q70CQ2 3546 aa18.47■□□□□ 0.55
LPCAT3-201ENST00000261407 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms