RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000248139.7

RAB40C-201, Transcript of RAB40C, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB40C, Length 2,699 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40C-201ENST00000248139 SLC6A14Q9UN76 642 aa24.58■■□□□ 1.53
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RAB40C-201ENST00000248139 H0YIV9 168 aa24.58■■□□□ 1.52
RAB40C-201ENST00000248139 K7ESM1 405 aa24.58■■□□□ 1.52
RAB40C-201ENST00000248139 KPNA5O15131 536 aa24.58■■□□□ 1.52
RAB40C-201ENST00000248139 C6orf47O95873 294 aa24.58■■□□□ 1.52
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RAB40C-201ENST00000248139 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa24.58■■□□□ 1.52
RAB40C-201ENST00000248139 ZNF740Q8NDX6 193 aa24.58■■□□□ 1.52
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RAB40C-201ENST00000248139 CFAP206Q8IYR0 622 aa24.57■■□□□ 1.52
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RAB40C-201ENST00000248139 SLC5A8Q8N695 610 aa24.57■■□□□ 1.52
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RAB40C-201ENST00000248139 MAPK11Q15759 364 aa24.56■■□□□ 1.52
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RAB40C-201ENST00000248139 ZNF846Q147U1 533 aa24.56■■□□□ 1.52
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RAB40C-201ENST00000248139 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa24.56■■□□□ 1.52
RAB40C-201ENST00000248139 CCDC103Q8IW40 242 aa24.56■■□□□ 1.52
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RAB40C-201ENST00000248139 ADPRHL2Q9NX46 363 aa24.56■■□□□ 1.52
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RAB40C-201ENST00000248139 ATG13O75143 517 aa24.55■■□□□ 1.52
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RAB40C-201ENST00000248139 NEURL2Q9BR09 285 aa24.55■■□□□ 1.52
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RAB40C-201ENST00000248139 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP24.55■■□□□ 1.52
RAB40C-201ENST00000248139 SLC19A1P41440 591 aa24.55■■□□□ 1.52
RAB40C-201ENST00000248139 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP24.55■■□□□ 1.52
RAB40C-201ENST00000248139 MPEG1Q2M385 716 aa24.55■■□□□ 1.52
RAB40C-201ENST00000248139 PAGE2Q7Z2X7 111 aa24.55■■□□□ 1.52
RAB40C-201ENST00000248139 VPS37AQ8NEZ2 397 aa24.55■■□□□ 1.52
RAB40C-201ENST00000248139 OR9Q2Q8NGE9 314 aa24.55■■□□□ 1.52
RAB40C-201ENST00000248139 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa24.55■■□□□ 1.52
RAB40C-201ENST00000248139 BTBD2Q9BX70 525 aa24.55■■□□□ 1.52
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