RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 OR2L8Q8NGY9 312 aa22.96■■□□□ 1.27
RPUSD1-201ENST00000007264 MSANTD3Q96H12 275 aa22.96■■□□□ 1.27
RPUSD1-201ENST00000007264 VPS50Q96JG6 964 aa22.96■■□□□ 1.27
RPUSD1-201ENST00000007264 SPASTQ9UBP0 616 aa22.96■■□□□ 1.27
RPUSD1-201ENST00000007264 OAZ3Q9UMX2 235 aa22.96■■□□□ 1.27
RPUSD1-201ENST00000007264 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
RPUSD1-201ENST00000007264 FEZF1A0PJY2 475 aa22.96■■□□□ 1.27
RPUSD1-201ENST00000007264 C7orf72A4D263 438 aa22.96■■□□□ 1.27
RPUSD1-201ENST00000007264 H0Y8X5 98 aa22.96■■□□□ 1.27
RPUSD1-201ENST00000007264 YY2O15391 372 aa22.96■■□□□ 1.27
RPUSD1-201ENST00000007264 RETP07949 1114 aa22.96■■□□□ 1.27
RPUSD1-201ENST00000007264 CHN2P52757 468 aa22.96■■□□□ 1.27
RPUSD1-201ENST00000007264 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
RPUSD1-201ENST00000007264 RPE65Q16518 533 aa22.96■■□□□ 1.27
RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM31Q5JXX7 168 aa22.96■■□□□ 1.27
RPUSD1-201ENST00000007264 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
RPUSD1-201ENST00000007264 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC9B2Q86UD5 537 aa22.96■■□□□ 1.27
RPUSD1-201ENST00000007264 C10orf111Q8N326 155 aa22.96■■□□□ 1.27
RPUSD1-201ENST00000007264 ANKRD53Q8N9V6 530 aa22.96■■□□□ 1.27
RPUSD1-201ENST00000007264 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
RPUSD1-201ENST00000007264 OR1E3Q8WZA6 343 aa22.96■■□□□ 1.27
RPUSD1-201ENST00000007264 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
RPUSD1-201ENST00000007264 PPCDCQ96CD2 204 aa22.96■■□□□ 1.27
RPUSD1-201ENST00000007264 PDXPQ96GD0 296 aa22.96■■□□□ 1.27
RPUSD1-201ENST00000007264 C8orf4Q9NR00 106 aa22.96■■□□□ 1.27
RPUSD1-201ENST00000007264 PCDHGB4Q9UN71 923 aa22.96■■□□□ 1.27
RPUSD1-201ENST00000007264 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa22.96■■□□□ 1.27
RPUSD1-201ENST00000007264 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 MBTPS2O43462 519 aa22.95■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC14A1Q13336 389 aa22.95■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 FLCNQ8NFG4 579 aa22.95■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 OR4K1Q8NGD4 311 aa22.95■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 OR4A15Q8NGL6 344 aa22.95■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 NT5DC2Q9H857 520 aa22.95■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 VPS4AQ9UN37 437 aa22.95■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 ARHGAP10A1A4S6 786 aa22.94■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 OR1F1O43749 312 aa22.94■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 SEMA3DO95025 777 aa22.94■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 PPIBP23284 216 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa22.94■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 DEPDC1Q5TB30 811 aa22.94■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 ENPP6Q6UWR7 440 aa22.94■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 EPHX4Q8IUS5 362 aa22.94■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC47A1Q96FL8 570 aa22.94■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 MS4A8Q9BY19 250 aa22.94■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 CORO2BQ9UQ03 480 aa22.94■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 PDLIM1O00151 329 aa22.94■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 CLOCKO15516 846 aa22.94■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 APBB3O95704 486 aa22.94■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 FURINP09958 794 aa22.94■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 GPX2P18283 190 aa22.94■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 AKT2P31751 481 aa22.94■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 IKBIPQ70UQ0 350 aa22.94■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 PAGE2Q7Z2X7 111 aa22.94■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 BMFQ96LC9 184 aa22.94■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 TPT1P8Q9HAU6 139 aa22.94■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 SERPINA1P01009 418 aa22.93■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 MC1RQ01726 317 aa22.93■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 TCEA2Q15560 299 aa22.93■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM71E1Q6IPT2 247 aa22.93■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 ERICH5Q6P6B1 374 aa22.93■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 UGT2A3Q6UWM9 527 aa22.93■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 OR2A1Q8NGT9 310 aa22.93■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 NETO1Q8TDF5 533 aa22.93■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 MTERF3Q96E29 417 aa22.93■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 PHF12Q96QT6 1004 aa22.93■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 F2RL3Q96RI0 385 aa22.93■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 MIEF1Q9NQG6 463 aa22.93■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa22.93■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 PDP2Q9P2J9 529 aa22.93■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 ICKQ9UPZ9 632 aa22.93■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 PLPP1O14494 284 aa22.93■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 PRKD3O94806 890 aa22.93■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 SEMA4FO95754 770 aa22.93■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF23P17027 643 aa22.93■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 CSNK1G2P78368 415 aa22.93■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF385BQ569K4 471 aa22.93■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM86B1Q8N7N1 296 aa22.93■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 TBC1D29Q9UFV1 150 aa22.93■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 ERVK-11Q9UQG0 969 aa22.93■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa22.92■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 A6NHS1 94 aa22.92■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 IL3P08700 152 aa22.92■■□□□ 1.26
RPUSD1-201ENST00000007264 GRK3P35626 688 aa22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.5 ms