RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000077303.3

Ptpra-202, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptpra, Length 3,066 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpra-202ENSMUST00000077303 AcadsbQ9DBL1 432 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Jam2Q9JI59 298 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Slamf1Q9QUM4 343 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Med20Q9R0X0 212 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Khdrbs3Q9R226 346 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Vmn1r2A2AMT6 306 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 FanceB8JJD6 213 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 MndalD0QMC3 538 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Atn1O35126 1175 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 GzmkO35205 263 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Zfp14P10755 501 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Hsd3b2P26149 373 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Klrb1cP27814 223 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 AhsgP29699 345 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Stfa3P35173 103 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 AcadvlP50544 656 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Hrh3P58406 445 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Pcp4P63054 62 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 ErgP81270 486 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 OxtrP97926 388 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Bmp1P98063 991 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Aqp1Q02013 269 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Ctnnb1Q02248 781 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Pde12Q3TIU4 608 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Gdpgp1Q3TLS3 386 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Trim40Q3UWA4 246 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Coq8aQ60936 645 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Arhgef39Q66JY6 344 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 ManealQ6P1J0 452 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 HjurpQ6PG16 667 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Cyp20a1Q8BKE6 462 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 PisdQ8BSF4 406 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 PolbQ8K409 335 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Rbm12Q8R4X3 992 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Cadm1Q8R5M8 456 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Nudt7Q99P30 236 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Mrpl41Q9CQN7 135 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Msantd3Q9CR78 275 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Acer3Q9D099 267 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 PacrglQ9D3X5 248 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 P2ry14Q9ESG6 338 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Prl5a1Q9JII2 230 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 SqorQ9R112 450 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 PtsQ9R1Z7 144 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Ccr9Q9WUT7 369 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Igkv17-121A0A0G2JFA8 117 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Olfr1224-ps1A3KGY4 311 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Gm20431E9PY39 371 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Olfr726E9Q8X3 321 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Ech1O35459 327 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 MaffO54791 156 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Sp1O89090 784 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Cyp21P03940 487 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Gpr25P0C5I1 358 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Apex1P28352 317 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Bmp8aP34821 399 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Csf3rP40223 837 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Bmp8bP55105 399 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Rps24P62849 133 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Rab3aP63011 220 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Galnt3P70419 633 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Pld2P97813 933 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Olfr725Q05A45 321 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Mdga1Q0PMG2 940 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Tgtp2Q3T9E4 415 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Zbtb2Q3V3W4 514 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Sox17Q61473 419 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Igfbp7Q61581 281 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Tgtp1Q62293 415 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Cyp4b1Q64462 511 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 VclQ64727 1066 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Ticam1Q80UF7 732 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 TiprlQ8BH58 271 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Chpt1Q8C025 398 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Mab21L3Q8CI17 429 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 GmdsQ8K0C9 372 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Olfr345Q8VGK4 311 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 DhddsQ99KU1 333 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Q99LU8 229 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 1700029F12RikQ9CRB4 147 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Q9D1K7 174 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Efhc2Q9D485 750 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 RangrfQ9JIB0 185 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Il22Q9JJY9 179 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 ChmlQ9QZD5 621 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 TesminQ9WTJ6 475 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 MgaA2AWL7 3003 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Plce1Q8K4S1 2282 aa6.63□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 6720489N17RikA0A1Y7VJW0 127 aa6.62□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Rad21l1A2AU37 552 aa6.62□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Cyp2j8G3UZ38 503 aa6.62□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Arl6O88848 186 aa6.62□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Coro1aO89053 461 aa6.62□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Psmd3P14685 530 aa6.62□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Tgm2P21981 686 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Bdkrb2P32299 392 aa6.62□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Htr7P32304 448 aa6.62□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Meox2P32443 303 aa6.62□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Sstr4P49660 385 aa6.62□□□□□ -1.35
Ptpra-202ENSMUST00000077303 Atp6v1e1P50518 226 aa6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 44.1 ms