RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Spats1A2RRY8 269 aa10.62□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem92B7ZWI3 162 aa10.62□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc13D3YV10 709 aa10.62□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Amd2D3Z6H8 334 aa10.62□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn2r73D3Z7M3 851 aa10.62□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn2r99H3BK37 856 aa10.62□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm3424L7N298 263 aa10.62□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm8246M0QWX9 263 aa10.62□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ikzf3O08900 507 aa10.62□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 NsmafO35242 920 aa10.62□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kpna4O35343 521 aa10.62□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Amd1P0DMN7 334 aa10.62□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tbpl1P62340 186 aa10.62□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Serpinb5P70124 375 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Serpina3mQ03734 418 aa10.62□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q149G0 166 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Stox2Q499E5 926 aa10.62□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trim25Q61510 634 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fbxl19Q6PB97 674 aa10.62□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rad54bQ6PFE3 886 aa10.62□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Megf11Q80T91 1091 aa10.62□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Wasf2Q8BH43 497 aa10.62□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Acbd3Q8BMP6 525 aa10.62□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pggt1bQ8BUY9 377 aa10.62□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nudt9Q8BVU5 350 aa10.62□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Etf1Q8BWY3 437 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 TbcdQ8BYA0 1196 aa10.62□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lin28aQ8K3Y3 209 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 St8sia6Q8K4T1 398 aa10.62□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 NifkQ91VE6 317 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cxxc5Q91WA4 317 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mgat2Q921V5 442 aa10.62□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc5a2Q923I7 670 aa10.62□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Snf8Q9CZ28 258 aa10.62□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mxra7Q9CZH7 178 aa10.62□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Erich6bQ9D4S6 220 aa10.62□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prss23Q9D6X6 382 aa10.62□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ifi35Q9D8C4 286 aa10.62□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q9DAE7 121 aa10.62□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc12a4Q9JIS8 1085 aa10.62□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ItgaxQ9QXH4 1169 aa10.62□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 DptQ9QZZ6 201 aa10.62□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klrc2Q9WTJ9 238 aa10.62□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dopey1Q8BL99 2399 aa10.61□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam166bA2AIP0 273 aa10.61□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Znf711A2ANX9 761 aa10.61□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gabrr3B2RXA8 464 aa10.61□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r177E9PXM3 309 aa10.61□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc121E9Q6D3 323 aa10.61□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp607bG3X9H3 648 aa10.61□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rpl21O09167 160 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kif1cO35071 1100 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pias1O88907 651 aa10.61□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Aldh3a1P47739 453 aa10.61□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 BckdhaP50136 442 aa10.61□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 NcstnP57716 708 aa10.61□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Arf3P61205 181 aa10.61□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ica1P97411 478 aa10.61□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rbm15Q0VBL3 962 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q3U4G0 281 aa10.61□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm10488Q4KL05 212 aa10.61□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gucy2fQ5SDA5 1108 aa10.61□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ca4Q64444 305 aa10.61□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kir3dl2Q673W2 388 aa10.61□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zdhhc24Q6IR37 284 aa10.61□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Txndc15Q6P6J9 344 aa10.61□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lrit2Q6PFC5 549 aa10.61□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Shc4Q6S5L9 626 aa10.61□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Eif2s1Q6ZWX6 315 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1322Q7TQW3 310 aa10.61□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn2r81Q80Z09 865 aa10.61□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Svs2Q8BS30 375 aa10.61□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 BC024139Q8BVJ3 772 aa10.61□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gramd4Q8CB44 633 aa10.61□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 BtdQ8CIF4 520 aa10.61□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Spag16Q8K450 639 aa10.61□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lgi2Q8K4Z0 550 aa10.61□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp940Q8R2Q3 566 aa10.61□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Thoc3Q8VE80 351 aa10.61□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pdia5Q921X9 517 aa10.61□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Spred1Q924S8 444 aa10.61□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Glod4Q9CPV4 298 aa10.61□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trmt5Q9D0C4 501 aa10.61□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SarnpQ9D1J3 210 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Atp5dQ9D3D9 168 aa10.61□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cab39lQ9DB16 337 aa10.61□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 RgccQ9DBX1 137 aa10.61□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CasrQ9QY96 1079 aa10.61□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bahcc1Q3UHR0 2643 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Adgrg4B7ZCC9 3073 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pkd1l3Q2EG98 2201 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ighv1-43A0A0A6YXN5 117 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm3409A0A0G2JE67 319 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam217bA2AJW5 387 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Otud4B2RRE7 1107 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp94E9Q6Y4 486 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm6408J3QNG1 320 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm3402K7N5P2 326 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 EllO08856 602 aa10.6□□□□□ -0.71
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cbx4O55187 551 aa10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 42.7 ms