RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622166.1

IGHV3-54-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-54 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHV3-54, Length 353 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-54-201ENST00000622166 ADIPOR2Q86V24 386 aa9.27□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 P2RY8Q86VZ1 359 aa9.27□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 TMEM25Q86YD3 366 aa9.27□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 NPAS3Q8IXF0 933 aa9.27□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 NRSN1Q8IZ57 195 aa9.27□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 MFSD4AQ8N468 514 aa9.27□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa9.27□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa9.27□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 C11orf65Q8NCR3 313 aa9.27□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR7G3Q8NG95 312 aa9.27□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR4C15Q8NGM1 316 aa9.27□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa9.27□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP9.27□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 APH1BQ8WW43 257 aa9.27□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 SCAMP4Q969E2 229 aa9.27□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 REPS1Q96D71 796 aa9.27□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 CAPNS2Q96L46 248 aa9.27□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR4K3Q96R72 315 aa9.27□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 PKP4Q99569 1192 aa9.27□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 CCM2Q9BSQ5 444 aa9.27□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 DOHHQ9BU89 302 aa9.27□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 BTBD2Q9BX70 525 aa9.27□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 EPHX3Q9H6B9 360 aa9.27□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 SGK2Q9HBY8 427 aa9.27□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 FKBP14Q9NWM8 211 aa9.27□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 KIF17Q9P2E2 1029 aa9.27□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 DKK3Q9UBP4 350 aa9.27□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 OGDHLQ9ULD0 1010 aa9.27□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 DGKBQ9Y6T7 804 aa9.27□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 A0A1W2PRU2 124 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 KRT87PA6NCN2 255 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 TSPAN6O43657 245 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 ATG13O75143 517 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 MTX2O75431 263 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 TNFRSF21O75509 655 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 DIRAS1O95057 198 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 NADKO95544 446 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 ETHE1O95571 254 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 FGF19O95750 216 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 CYP4B1P13584 511 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 ANXA8P13928 327 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 PORP16435 677 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 GJA1P17302 382 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 FSHRP23945 695 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 IMPA1P29218 277 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 KRT20P35900 424 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 RPL3P39023 403 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 MVDP53602 400 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 EPHA5P54756 1037 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 SELENOWP63302 87 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 IL1RL1Q01638 556 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 PDE7AQ13946 482 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 LAPTM4AQ15012 233 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 OXA1LQ15070 435 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZNF284Q2VY69 593 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 SYTL3Q4VX76 610 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 MED27Q6P2C8 311 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 GALNT10Q86SR1 603 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 FAM124AQ86V42 546 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 NLRP8Q86W28 1048 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 LAS2Q8IYD9 372 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 NAT16Q8N8M0 369 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 ATG16L2Q8NAA4 619 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZNF540Q8NDQ6 660 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR52N2Q8NGI0 321 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 NDNFQ8TB73 568 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 IRF7Q92985 503 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 GLYATL1Q969I3 302 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 SLC38A4Q969I6 547 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 ITFG2Q969R8 447 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 TMEM159Q96B96 161 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 LRIG1Q96JA1 1093 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 MRGPRX3Q96LB0 322 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 DACH2Q96NX9 599 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 ALPK1Q96QP1 1244 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 RAD9AQ99638 391 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 PSD2Q9BQI7 771 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 REEP4Q9H6H4 257 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 EPS8L2Q9H6S3 715 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 THSD1Q9NS62 852 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 AASSQ9UDR5 926 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 TBX21Q9UL17 535 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 RNF6Q9Y252 685 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa9.26□□□□□ -0.93
IGHV3-54-201ENST00000622166 MGAT4DA6NG13 374 aa9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms