RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602516.1

HCG18-244, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 2,890 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-244ENST00000602516 TNFAIP8O95379 198 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 LTFP02788 710 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 C8BP07358 591 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ERCC2P18074 760 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 HLA-DPA1P20036 260 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 SHMT2P34897 504 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 PTGER3P43115 390 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CAMLGP49069 296 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CCR4P51679 360 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ARSFP54793 590 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ELP6Q0PNE2 266 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 NOGQ13253 232 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 SMCO1Q147U7 214 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 GPR68Q15743 365 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 PSMD5Q16401 504 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 TIGD5Q53EQ6 642 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CES4AQ5XG92 561 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CDC73Q6P1J9 531 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ZBTB46Q86UZ6 589 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CPNE9Q8IYJ1 553 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 METTL4Q8N3J2 472 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ING5Q8WYH8 240 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 STMN2Q93045 179 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 SMARCD1Q96GM5 515 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 PKMYT1Q99640 499 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ACBD6Q9BR61 282 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 PAAF1Q9BRP4 392 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 NAT9Q9BTE0 207 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 PTDSS2Q9BVG9 487 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 TSSK1BQ9BXA7 367 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 OR10A4Q9H209 315 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CPNE5Q9HCH3 593 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 GPAMQ9HCL2 828 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 NIT2Q9NQR4 276 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 TAS2R1Q9NYW7 299 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 PISDQ9UG56 409 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ENPP5Q9UJA9 477 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 STARD10Q9Y365 291 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CENPFP49454 3210 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 WDR27A2RRH5 827 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CENPXA8MT69 81 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 I3L521 148 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 TFECO14948 347 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 AKR7A2O43488 359 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 PAGE1O75459 146 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 RFPL2O75678 378 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 MLYCDO95822 493 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 S1PR4O95977 384 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ALDH1A1P00352 501 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 IL1AP01583 271 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 USP17L7P0C7H9 530 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 IL11P20809 199 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CXCR3P49682 368 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 RABGGTBP53611 331 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CRHR2Q13324 411 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 TM4SF20Q53R12 229 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ZNF765Q7L2R6 523 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 AMIGO1Q86WK6 493 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 LACC1Q8IV20 430 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 TP53INP2Q8IXH6 220 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 OR2L5Q8NG80 312 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 OR52M1Q8NGK5 317 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 OR6F1Q8NGZ6 308 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 LRFN5Q96NI6 719 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 COLEC11Q9BWP8 271 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 TLR9Q9NR96 1032 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 SNTG1Q9NSN8 517 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ZNF221Q9UK13 617 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 DNAH12Q6ZR08 3092 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 A6NLC8 198 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 H3BNX3 289 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 M0QZQ0 153 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 NTRK1P04629 796 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 PGAM1P18669 254 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 PAMP19021 973 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 PSMB4P28070 264 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CCT3P49368 545 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ACTBP60709 375 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ACTA2P62736 377 aa7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms