RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553944.2

ACTN1-AS1-201, ACTN1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ACTN1-AS1, Length 484 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ERVK-8P63133 956 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PWP1Q13610 501 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CUL3Q13618 768 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GSTA3Q16772 222 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 AP5B1Q2VPB7 878 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GALNTL6Q49A17 601 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TMEM35AQ53FP2 167 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SPIN4Q56A73 249 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 C6orf136Q5SQH8 315 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FCRL6Q6DN72 434 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FBXO42Q6P3S6 717 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TMEM71Q6P5X7 295 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SPRED1Q7Z699 444 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ZFAND4Q86XD8 727 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 KMT5CQ86Y97 462 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FAM20CQ8IXL6 584 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FAM9CQ8IZT9 166 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FNDC5Q8NAU1 212 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ZNF740Q8NDX6 193 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 OR2T11Q8NH01 316 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 WDR48Q8TAF3 677 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 IFI44Q8TCB0 444 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TCTN2Q96GX1 697 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MAP3K3Q99759 626 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CCDC3Q9BQI4 270 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TUBB6Q9BUF5 446 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 EDEM2Q9BV94 578 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ACPTQ9BZG2 426 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ZMYND15Q9H091 742 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SPNS1Q9H2V7 528 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 LRRN3Q9H3W5 708 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 LRTM1Q9HBL6 345 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 DMRT3Q9NQL9 472 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 C1orf109Q9NX04 203 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SIRT5Q9NXA8 310 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SEMA5BQ9P283 1151 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PILRAQ9UKJ1 303 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SLC12A4Q9UP95 1085 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 U3KQA8 63 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 A0A0J9YVX5 310 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 URADA6NGE7 173 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CCT8L1PA6NM43 557 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 E9PBE3 544 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FCHO1O14526 889 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 HAT1O14929 419 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SLC22A2O15244 555 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 KLHL41O60662 606 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RASSF9O75901 435 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SEMA3DO95025 777 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TGFB1P01137 390 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ADRB1P08588 477 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PRPS2P11908 318 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MYF5P13349 255 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CD59P13987 128 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 IDO1P14902 403 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ST6GAL1P15907 406 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ACP1P24666 158 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 LSSP48449 732 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ARL4DP49703 201 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 STX1BP61266 288 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 HMGCS1Q01581 520 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RGS1Q08116 209 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TGM3Q08188 693 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ACSM2AQ08AH3 577 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 KIAA0040Q15053 153 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RPS6KA2Q15349 733 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ZIC1Q15915 447 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 AMZ1Q400G9 498 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PERM1Q5SV97 790 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 DEPDC1Q5TB30 811 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 STPG1Q5TH74 334 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CACHD1Q5VU97 1274 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NKAIN2Q5VXU1 208 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ACSM2BQ68CK6 577 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GUSBP11Q6P575 273 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FAM92BQ6ZTR7 304 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RNF44Q7L0R7 432 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ASPGQ86U10 573 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TRIM73Q86UV7 250 aa8.08□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms