RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 FBXL8Q96CD0 374 aa7.52□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa7.52□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 ZNF597Q96LX8 424 aa7.52□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 RIPOR3Q96MK2 946 aa7.52□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 HIST1H2AJQ99878 128 aa7.52□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 BCL7BQ9BQE9 202 aa7.52□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 H2AFJQ9BTM1 129 aa7.52□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 ANKRD60Q9BZ19 345 aa7.52□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 ADNPQ9H2P0 1102 aa7.52□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 WDR41Q9HAD4 459 aa7.52□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 CXorf21Q9HAI6 301 aa7.52□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa7.52□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 AKIP1Q9NQ31 210 aa7.52□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 SIRT5Q9NXA8 310 aa7.52□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 ARL15Q9NXU5 204 aa7.52□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 CACNG2Q9Y698 323 aa7.52□□□□□ -1.2
CS-204ENST00000546621 LRRK1Q38SD2 2015 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 C5orf42Q9H799 3197 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 A0A1W2PPW3 197 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 ANTXRLA6NF34 631 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 TMEM202A6NGA9 273 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 BBIP1A8MTZ0 92 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 ERVH48-1M5A8F1 160 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 ARNTLO00327 626 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 CFLARO15519 480 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 NRP2O60462 931 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 KATNA1O75449 491 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 WDR47O94967 919 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 SLITRK5O94991 958 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 MATN4O95460 622 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 IFNA14P01570 189 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 EBLN1P0CF75 366 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 P2RY2P41231 377 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 CASP3P42574 277 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 MTHFRP42898 656 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 NR4A2P43354 598 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 GPR1P46091 355 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 HTR6P50406 440 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 AP1S2P56377 157 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 NME5P56597 212 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 GPR85P60893 370 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 ERVK-8P63133 956 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 CTBSQ01459 385 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 DPTQ07507 201 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 CNTN1Q12860 1018 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 BNIP3Q12983 259 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 GRIK2Q13002 908 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 ENPP2Q13822 863 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 RPS6KA2Q15349 733 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 TSC22D1Q15714 1073 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 INAVAQ3KP66 663 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 BCL7AQ4VC05 210 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 PIGGQ5H8A4 983 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 RAET1GQ6H3X3 334 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 XKRXQ6PP77 449 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 TMEM220Q6QAJ8 160 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 IL27RAQ6UWB1 636 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 RNF165Q6ZSG1 346 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 FKBP9P1Q75LS8 142 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 MTSS1LQ765P7 747 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 NLRP8Q86W28 1048 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 RASGRP3Q8IV61 690 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 CLIP4Q8N3C7 705 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 SFRP1Q8N474 314 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 FANK1Q8TC84 345 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 MCOLN3Q8TDD5 553 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 TMEM159Q96B96 161 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 CCM2Q9BSQ5 444 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 NTMT1Q9BV86 223 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 SLC32A1Q9H598 525 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 EPHX3Q9H6B9 360 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 NARFLQ9H6Q4 476 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 AIG1Q9NVV5 245 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 TRPS1Q9UHF7 1281 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 ZNF221Q9UK13 617 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 POMPQ9Y244 141 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 RNF11Q9Y3C5 154 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 GPR45Q9Y5Y3 372 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 STON1Q9Y6Q2 735 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 TRAV6A0A075B6T7 132 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 SLC5A10A0PJK1 596 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 H3BUI4 141 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 K7ESM1 405 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 NR5A2O00482 541 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 TOR1AO14656 332 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 MRASO14807 208 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-204ENST00000546621 NPC1O15118 1278 aa7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 149.7 ms