RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515479.5

RUFY3-215, Transcript of RUN and FYVE domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RUFY3, Length 893 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3-215ENST00000515479 RAB23Q9ULC3 237 aa4.1□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 CCPG1Q9ULG6 757 aa4.1□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 KLHL20Q9Y2M5 609 aa4.1□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 ZFHX4Q86UP3 3567 aa4.1□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 GREB1Q4ZG55 1949 aa4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 ARHGEF35A5YM69 484 aa4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 USP17L23D6RBM5 183 aa4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 CLIC2O15247 247 aa4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 P4HA2O15460 535 aa4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 CIDEAO60543 219 aa4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 LRP3O75074 770 aa4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 CSPG5O95196 566 aa4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 CCNE2O96020 404 aa4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 PROS1P07225 676 aa4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 TRIM49P0CI25 452 aa4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 TRIM49CP0CI26 452 aa4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 ACTN2P35609 894 aa4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 FASLGP48023 281 aa4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 GTF2BQ00403 316 aa4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 PLIN5Q00G26 463 aa4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 PPFIA1Q13136 1202 aa4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 SLC1A5Q15758 541 aa4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 GRAMD1BQ3KR37 738 aa4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 CFAP221Q4G0U5 840 aa4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 CCDC70Q6NSX1 233 aa4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 C11orf63Q6NUN7 778 aa4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 MIER3Q7Z3K6 550 aa4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 NT5DC3Q86UY8 548 aa4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 C4orf19Q8IY42 314 aa4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 C10orf67Q8IYJ2 551 aa4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 OTUD6BQ8N6M0 293 aa4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 ACTRT1Q8TDG2 376 aa4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 LRR1Q96L50 414 aa4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 ZNF599Q96NL3 588 aa4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 SPAG5Q96R06 1193 aa4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 FTHL17Q9BXU8 183 aa4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 MAF1Q9H063 256 aa4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 ZHX3Q9H4I2 956 aa4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 PXMP2Q9NR77 195 aa4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 VPS18Q9P253 973 aa4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 FBXL2Q9UKC9 423 aa4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 R4GN57 208 aa4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 NFASCO94856 1347 aa4.09□□□□□ -1.75
RUFY3-215ENST00000515479 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
RUFY3-215ENST00000515479 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa4.08□□□□□ -1.76
RUFY3-215ENST00000515479 HHLA1C9JL84 531 aa4.08□□□□□ -1.76
RUFY3-215ENST00000515479 CCDC188H7C350 402 aa4.08□□□□□ -1.76
RUFY3-215ENST00000515479 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
RUFY3-215ENST00000515479 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
RUFY3-215ENST00000515479 SLC30A4O14863 429 aa4.08□□□□□ -1.76
RUFY3-215ENST00000515479 LDLRAD4O15165 306 aa4.08□□□□□ -1.76
RUFY3-215ENST00000515479 NCAM2O15394 837 aa4.08□□□□□ -1.76
RUFY3-215ENST00000515479 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
RUFY3-215ENST00000515479 RAD51CO43502 376 aa4.08□□□□□ -1.76
RUFY3-215ENST00000515479 STBD1O95210 358 aa4.08□□□□□ -1.76
RUFY3-215ENST00000515479 H2AFZP0C0S5 128 aa4.08□□□□□ -1.76
RUFY3-215ENST00000515479 SP9P0CG40 484 aa4.08□□□□□ -1.76
RUFY3-215ENST00000515479 SP100P23497 879 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
RUFY3-215ENST00000515479 SFNP31947 248 aa4.08□□□□□ -1.76
RUFY3-215ENST00000515479 AHRP35869 848 aa4.08□□□□□ -1.76
RUFY3-215ENST00000515479 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
RUFY3-215ENST00000515479 PAFAH1B1P43034 410 aa4.08□□□□□ -1.76
RUFY3-215ENST00000515479 QARSP47897 775 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
RUFY3-215ENST00000515479 GALCP54803 685 aa4.08□□□□□ -1.76
RUFY3-215ENST00000515479 KRTAP10-3P60369 221 aa4.08□□□□□ -1.76
RUFY3-215ENST00000515479 RPS6P62753 249 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
RUFY3-215ENST00000515479 GNB1P62873 340 aa4.08□□□□□ -1.76
RUFY3-215ENST00000515479 TNNC1P63316 161 aa4.08□□□□□ -1.76
RUFY3-215ENST00000515479 RPP30P78346 268 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
RUFY3-215ENST00000515479 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
RUFY3-215ENST00000515479 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
RUFY3-215ENST00000515479 CAMK1Q14012 370 aa4.08□□□□□ -1.76
RUFY3-215ENST00000515479 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
RUFY3-215ENST00000515479 GPNMBQ14956 572 aa4.08□□□□□ -1.76
RUFY3-215ENST00000515479 COL28A1Q2UY09 1125 aa4.08□□□□□ -1.76
RUFY3-215ENST00000515479 USP41Q3LFD5 358 aa4.08□□□□□ -1.76
RUFY3-215ENST00000515479 HSP90B2PQ58FF3 399 aa4.08□□□□□ -1.76
RUFY3-215ENST00000515479 TTMPQ5BVD1 217 aa4.08□□□□□ -1.76
RUFY3-215ENST00000515479 C6orf141Q5SZD1 244 aa4.08□□□□□ -1.76
RUFY3-215ENST00000515479 DCST1Q5T197 706 aa4.08□□□□□ -1.76
RUFY3-215ENST00000515479 NAA35Q5VZE5 725 aa4.08□□□□□ -1.76
RUFY3-215ENST00000515479 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.08□□□□□ -1.76
RUFY3-215ENST00000515479 SLC39A4Q6P5W5 647 aa4.08□□□□□ -1.76
RUFY3-215ENST00000515479 H2AFVQ71UI9 128 aa4.08□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms